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What's Your Problem? Offene Themen

wyp_q_mark2_thumbnail1Willkommen auf der "What's Your Problem?" (WYP) Open Thread. Der Zweck dieses Eintrags ist für die Gemeinschaft zu ermöglichen Fragen über den Einsatz der Genomik Ressourcen. Betrachten Sie uns als einen virtuellen Helpdesk. Haben Sie eine Frage zu, wie eine bestimmte Art des Datenzugriffs, oder wie man eine Datenbank verwenden, oder welche Art von Ressourcen gibt es für Ihr spezielles Problem der Forschung, nur in den Kommentaren fragen. OpenHelix Mitarbeiter Uhr auf dem Kommentar Fäden halten und diese Fragen beantworten, die nach unserem besten Wissen. Zusätzlich, Wir empfehlen unseren Lesern zu Fragen in den Kommentaren zu beantworten. Wenn Sie wissen die Antwort auf einen anderen Leser die Frage, Bitte Glockenspiel! Die "WYP" Thread wird jeden Donnerstag veröffentlicht werden und bleiben an der Spitze des Blogs für 24 Stunden. Bei Fragen oder Problemen am Donnerstag aufgefordert wird am Donnerstag die besten unserer Fähigkeit beantwortet werden. Du kannst einen Fragen an den anderen Tagen der Woche, aber die Antwort kann nicht kommen an diesem Tag.

Wir möchten auch Ressourcen-Anbietern einladen, uns zu informieren, wenn sie etwas Neues zu erzählen haben, oder etwas, was sie wollen, die Bioinformatik Gemeinde erwähnen. Wir hatten einige Leute per E-Mail, weil sie nicht sicher waren, ob sie etwas sollte Beitrag, und wir wollen, dass die Geldbuße sagen.

So What's Your Problem? Und was ist Ihre Lösung? :)

HINWEIS: In den unendlichen Kampf mit Spammern, Wir haben Kommentare zu moderieren. Ihr Kommentar / Frage kann nicht sofort nach Einreichung. Wir werden benachrichtigt, wenn ein Kommentar kommt und wir kommen vorbei und genehmigen es so bald wie wir es sehen.

Sie können mithalten mit diesen Thread durch die Erinnerung an ein zu prüfen,, durch Abonnement des RSS-Kommentar-Feed zu dieser WYP Post oder abonnieren Sie per E-Mail über neue Kommentare zum Post benachrichtigt werden (Verwendung Kontrollkästchen am Ende des Kommentarformulars, Sie können später abbestellen). Wenn Sie der Zukunft WYP Beiträge benachrichtigt werden (jeden Donnerstag), Sie können den Podcast WYP Feed.

Biostar

Ich habe mit Biostar für den letzten Monat und finde es eine große Hilfe sein. Biostar ist ein Q&Ein Raum für Genomik und Bioinformatik Fragen. Zur Zeit, Es ist mit ‘StackExchange", das ist ein von der Community getriebene Q&Ein Forum. Die Welt von heute in der Biologie Forschung war reif für Biostar (wir wissen sollten ;-).

Die Art und Weise Biostar funktioniert so, dass Sie sich registriert haben erhalten. Nach der Registrierung können Sie Fragen stellen oder beantworten über Bioinformatik oder Genomik. Fragen und Antworten werden bewertet und Diskussion erfolgen kann. Fragen werden von Tags organisiert und man kann sofort sehen, ob sie beantwortet wurde, wie sie bewertet. Die Benutzer werden Punkte basierend auf der Anzahl von Fragen und Antworten gegeben, Abstimmungen Aktionen und mehr. Dies gibt dem Benutzer 'Ruf,’ dies ist ein “grobe Schätzung, wie viel die biostar Gemeinde vertraut Ihnen” wie die faq sagt. Je mehr Reputation erhalten Sie, desto mehr Aktionen, die Sie in der Gemeinde tun können. Zum Beispiel, es dauert keinen Ruf zu beantworten, oder fragen Sie, sondern mehr um Abstimmung, retag Fragen, usw..

So weit die Fragen (Es wurden über bereits 600 bei der Arbeit an diesem Blog-Post) haben von der Anlage auf eine einfache reichten. Einige Fragen beziehen sich auf Codierung einer bestimmten Bioinformatik Aufgabe wie das Extrahieren Reihenfolge ab 3GB Fasta Datei oder wie man Daten aus einer Datenbank oder einer Ressource. Oft gibt es Fragen darüber, wo auf bestimmte Arten von Daten finden. Diese Frage vor ein paar Wochen fragte nach “Web-Ressourcen, um Krebs-Indikation zu finden, wo ein bestimmtes Gen amplifiziert.” Die Antworten (darunter eine aus eigener Mary :) führte zu einigen interessanten Ressourcen wie Oncomine. Ich war nicht in der Lage, um es auszuprobieren, da es Registrierung und / oder ein Abonnement erfordert, sondern aus der Beschreibung angegeben scheint eine nützliche Ressource werden. Zwischen der Suche unserer Datenbank mit öffentlich zugänglichen Datenbanken im Zusammenhang mit Krebs und fragen, Forscher sollten in der Lage, die richtige Ressource für ihre Bedürfnisse finden. Biostar scheint eine große fit sein für das, was wir tun, um OpenHelix. Betrachten vergleichende Genomik; könnte man verwenden unsere Suche auf die richtigen Ressourcen zu finden, verwenden Sie dann eines unserer Tutorials um ein solides Verständnis der Ressource und dann für die detaillierte How-to ist, sobald sie den Grundstein, Zum BioStar.

Wir überlegen, das Hinzufügen einer “Biostar Antwort” der Woche und Integration / Anbindung enger mit Biostar in unserer WYP Themen. Wir glauben, dass dies nur zur Steigerung der OpenHelix Blog-Mission zu erziehen und Hilfsangebote für Forscher auf der Genomik Ressourcen. Biostar hat gewachsen und gereift ganz gut in den letzten Monaten ab wann ich das letzte Mal darüber gelesen, Ich glaube, es ist in eine ganz nette Community entwickelt.

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wyp_q_mark2_thumbnail1Willkommen auf der "What's Your Problem?" (WYP) Open Thread. Der Zweck dieses Eintrags ist für die Gemeinschaft zu ermöglichen Fragen über den Einsatz der Genomik Ressourcen. Betrachten Sie uns als einen virtuellen Helpdesk. Haben Sie eine Frage zu, wie eine bestimmte Art des Datenzugriffs, oder wie man eine Datenbank verwenden, oder welche Art von Ressourcen gibt es für Ihr spezielles Problem der Forschung, nur in den Kommentaren fragen. OpenHelix Mitarbeiter Uhr auf dem Kommentar Fäden halten und diese Fragen beantworten, die nach unserem besten Wissen. Zusätzlich, Wir empfehlen unseren Lesern zu Fragen in den Kommentaren zu beantworten. Wenn Sie wissen die Antwort auf einen anderen Leser die Frage, Bitte Glockenspiel! Die "WYP" Thread wird jeden Donnerstag veröffentlicht werden und bleiben an der Spitze des Blogs für 24 Stunden. Bei Fragen oder Problemen am Donnerstag aufgefordert wird am Donnerstag die besten unserer Fähigkeit beantwortet werden. Du kannst einen Fragen an den anderen Tagen der Woche, aber die Antwort kann nicht kommen an diesem Tag.

Wir möchten auch Ressourcen-Anbietern einladen, uns zu informieren, wenn sie etwas Neues zu erzählen haben, oder etwas, was sie wollen, die Bioinformatik Gemeinde erwähnen. Wir hatten einige Leute per E-Mail, weil sie nicht sicher waren, ob sie etwas sollte Beitrag, und wir wollen, dass die Geldbuße sagen.

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