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答案是什么? (如何保持目前的)

这一周是有点比平常不同 “答案是什么?” 哨所,在那里,我们强调从一个论坛,我们的读者可能会感兴趣的问题. 不过–在这个岗位, 一个问题的答案,包括 映泰–所以回来围绕!

斯蒂芬特纳 (又名 @ genetics_blog) 人们问他写了一篇博客文章,最近他是如何保持目前在生物信息学/基因组学. 我知道很多人时,后转推, 和OpenHelix他很亲切列入导致一些良好的交通,这个博客和新的Twitter的追随者. 昨晚我看到这个以及, 确认我这个职位的印象:

博客, 论坛, 自动搜索, 叽叽喳喳, 与文学–当然. 很多人可能会知道一些关于这些, 但它很高兴看到有人组装集合. 它也是有趣的,看看如何相似,它是我的策略.

因此,它似乎是这可能是一个有趣的项目,突出对一些事情的答案来源, 一个很好的方法,找到有用的网站和乡亲要注意的,在这一领域. 检查出来.

如何保持目前在生物信息学/基因

这么多的数据和信息. 你总得有一些战略. 你必须有超过文献.

一周的视频提示: NCBI的基因资源的大变化


NCBI的 创建于 1988 并一直保持着 GenBank中 多年的数据库. 他们还提供了多种类型的生物数据的计算资源和数据检索系统. 因此,他们都非常清楚的速度有多快,生物学家收集的数据已经改变,扩大. 由于各种数据类型的使用已开发, 它已成为明显的,新的信息类型 (如扩展元数据) 需要收集, 和数据处理的新方法.

NCBI的已经适应这种需要多年来,最近一直在调整它的基因组资源. 今天的提示将基于一些变化. 我的影片将重点放在 “完全重新设计的基因组网站”, 这是最近推出了在宣布 最近NCBI的通讯. 我还没有找到一个出版物描述的变化, 但进入一些细节和通讯 在基因组的现场顶部发现公布 (& 我想指出,在视频) 有关的变化非常有帮助的细节.

正如你将看到在公布, 的 基因资源 最近发生了变化不是唯一的相关资源, 包括基因组计划的资源的重新设计 BioProject 资源和创造 BioSample 资源. 我不会有时间细讲有关这两种资源,但在我后结束,我将链接到最近的两个NCBI的出版物,本月排在核酸研究 – 这些都是很好的资源,读上BioProject的更多信息, BioSample, NCBI的整个. 对于历史的角度看,我也链接到原来的基因组参考, 这是生物信息学和目前免费访问.

一些变化是非常有趣, 包括 “单基因组记录现在是一个有机体,不是一个基因组隔离。” NCBI的通讯状态 “主要改进包括更自然的组织为原核有机体的水平, 真核, 和病毒的基因组. 报告包括有关小学的核或原核基因组的可用性以及细胞器和质粒. ” 还有一张纸条, “由于自然分类系统的重组, 旧的基因组标识符不再有效. 这些基因组标识符通常不暴露在以前的系统,主要用于以编程方式访问. ” 这使我不知道什么样的变化,这将授权其他NCBI的资源, 以及外部资源. 我没有看到任何公告,尚未, 所以我就留下来调整 & 检查周围往往.

享受尖端 & 让我们, 或NCBI的, 知道你觉得他们的变化! :)

快速连结:

NCBI的主页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

Entrez的基因资源首页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome

BioProject资源首页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/

参考文献:

历史悠久的Entrez的基因组参考: Tatusova, 吨, 蝎,Mizrachi, 一, & Ostell, Ĵ. (1999). 在WWW Entrez的完整基因组: 数据的代表性和分析 生物信息学, 15 (7), 536-543 分类号: 10.1093/bioinformatics/15.7.536

巴雷特, 吨, 克拉克, 光, Gevorgyan, 河, Gorelenkov, V, Gribov, 大肠杆菌, 蝎,Mizrachi, 一, Kimelman, 米, 普鲁特, 光, Resenchu​​k, 学, Tatusova, 吨, Yaschenko, 大肠杆菌, & Ostell, Ĵ. (2011). BioProject和BioSample在NCBI数据库: 促进捕获和组织的元数据 核酸研究 分类号: 10.1093/nar/gkr1163

塞耶斯, 大肠杆菌, 巴雷特, 吨, 森, 四, 博尔顿, 大肠杆菌, 科比, 学, Canese, 光, Chetvernin, V, 教会, 四, DiCuccio, 米, Federhen, 学, Feolo, 米, Fingerman, 一, 格尔, 属, Helmberg, 瓦特, 卡普斯京, 华, 克拉斯诺夫, 学, 康特里曼, 四, 李普曼, 四, 阅读, z的, 马学恩, 吨, 马德伊, 吨, Maglott, 四, Marchler - 鲍尔, 答:, 磨坊主, V, 蝎,Mizrachi, 一, Ostell, j的, Panchenko, 答:, 潘, 属, 普鲁特, 光, 舒勒, 克, Sequeira, 大肠杆菌, 雪利酒, 学, 沙姆韦, 米, Sirotkin, 光, Slotta, 四, Souvorov, 答:, Starchenko, 克, Tatusova, 吨, 瓦格纳, 属, 王, 华, 威尔伯, 瓦特, Yaschenko, 大肠杆菌, & 叶, Ĵ. (2011). 国家生物技术信息中心的数据库资源 核酸研究 分类号: 10.1093/nar/gkr1184

提示的周: 从UniProt的PSI SBKB,然后再返回


它往往是有益的访问多个生物医学数据库或资源, 即使他们似乎提供重叠的信息,因为没有两个完全相同的信息资源集中在, 或完全相同的方式在目前. 而不是重复彼此’ 打捞努力, 数据库往往链接其他资源相关信息. 你可以认为这些链接 “社会关系”, 如果你想和在今天的小费,我想告诉你几个蛋白质信息资源之间的连接, 一些核心价值的真正功能,包括一个新的连接 PSI的结构生物学知识库, 或SBKB.

我开始在提示 在UniProtKB, 我搜索一个UniProt ID号. 从产生的蛋白质的报告,我首先简要地告诉你如何链接到相应的 RCSB PDB 报告, 在这里你可以找到高品质的蛋白质的结构信息和更多的. 如果你有兴趣了解更多有关RCSB PDB & 如何使用它, 请检查出OpenHelix的全, RCSB临时区议会赞助的免费教程.

从那里,我要回到UniProt报告,并表现出了新的链接选项链接到蛋白质协议, 可用的材料, 以及有关理论模型的信息和预测蛋白质目标的SBKB. 我没有时间来证明这一点,但最近更新的SBKB允许用户到现在的结构生物学知识库搜索UniProt加入号码. 这些搜索为用户提供额外信息,包括蛋白质的结构信息和有关预发行结构序列的信息. RCSB PDB, 我们有一个 免费教程上SBKB 这是由赞助商 蛋白质结构计划.

正如我翻阅的UniProt蛋白质的报告用户会看到各种各样的生物科学资源的信息和链接. OpenHelix, 因为我相信你们许多人都知道, 就如何利用这些资源的许多教程. RCSB PDB和PSI的SBKB我们的教程都是免费的. 我们的 教程UniProt许多其他资源 都可以通过我们的培训数据库的订阅,或通过购买单独的访问. 无论你学习的资源,通过我们的教程, 通过参考我下面的列表, 或通过你自己的探索数据库, 真的是通过这些相互关联的可用信息的数量惊人, 公帑资助的资源 – 请利用它们在您的研究!

快速连结:

的UniProt知识库 - http://www.uniprot.org/

OpenHelix教程上UniProt – http://www.openhelix.com/cgi/tutorialInfo.cgi?id=77

RCSB PDB – http://www.pdb.org

OpenHelix教程RCSB PDB – http://www.openhelix.com/pdb

蛋白质的结构倡议结构生物学知识库 (SBKB) - http://www.sbkb.org/

OpenHelix教程上SBKB – http://www.openhelix.com/sbkb

所有OpenHelix教程目录 – http://www.openhelix.com/cgi/tutorials.cgi

参考文献:
UniProt联盟. (2009). 通用蛋白质资源 (UniProt) 在 2010 核酸研究, 38 (数据库) 分类号: 10.1093/nar/gkp846

玫瑰, 体育, Beran, 二, 毕, 三, 布卢姆, 瓦特, Dimitropoulos, 四, 古德塞尔, 四, 普尔利奇, 答:, 克萨达, 米, 奎恩, 克, 韦斯特布鲁克, j的, 年轻的, j的, Yukich, 二, Zardecki, 三, 伯曼, 阁下, & 畛域, P. (2010). 蛋白质数据银行的因子rcsB: 重新设计网站和网络服务 核酸研究, 39 (数据库) 分类号: 10.1093/nar/gkq1021

伯曼, 阁下, 韦斯特布鲁克, j的, Gabanyi, 米, 我, 瓦特, 沙阿, 河, Kouranov, 答:, 瑞典人, 吨, 阿诺德, 光, 松, 楼, Bordoli, 属, 柯普, j的, Podvinec, 米, 亚当斯, 体育, 卡特, 属, 轻微, 瓦特, 奈尔, 河, & 巴尔, Ĵ. (2009). 蛋白质结构的主动结构基因组学知识库 核酸研究, 37 (数据库) 分类号: 10.1093/nar/gkn790

现场由我们的朋友在Bioinformatics.org暑期课程

这在我刚得到邮件通知–从 Bioinformatics.org:

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CS101的生物信息学编程简介

七月 28-29, 2011

*的现场*在剑桥, 马萨诸塞州, 美国

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***这是我们特别提供编程入门课程, 鉴于人肯德尔广场, 剑桥, 马萨诸塞州.***

目标:

本课程教授IT专家, 入门级的生物信息学家,并充分利用Linux和各种开源生物信息学工具生物学家, 连同脚本和数据管理工具, 执行计算和生物研究数据信息创建. 这门课程的例子都使用从DNA和氨基酸序列数据, 芯片概况, 图像, 质谱, 实验室信息管理系统, 和生物学注解.

教学大纲:

本课程分为 4 会议, ,大约有 1-1.5 小时的演讲, 为实验室和更多的时间练习. 第5次会议,是一个保留的项目进行讨论和任何其他课程相关问题的学生可能要讨论.

会议 1 将包括一个生物信息学的计算环境概述. 常见的数据管理和采矿问题将突出, 非常久远的一个具有挑战性的问题及其解决方案概述. Linux操作系统概述将完成, 非常久远的实验室工作,以得到参与者熟悉Linux.

会议 2 将支付与Perl脚本基本面, 如标量, 阵列, 变量插值, 经营者 (数学, 有条件, 逻辑), 文件输入/输出, 印刷, 循环 (的if - then - else的, 为, 而), 列表操作, 等. 实验室将进行演习

会议 3 将覆盖函数/子程序, 哈希数组和正则表达式. 与会者将介绍MySQL数据库.

会议 4 将覆盖安装的Perl包, 与使用操作序列的一些著名的例子包BioPerl, 高炉自动化查询, 等. 项目将被分配,使用BioPerl和Perl数据库接口

先决条件: 没有编程经验, 只是需要学习如何编程.

欲了解更多信息: 对于学费成本及其他查询, 请联系 edu@bioinformatics.org.

注意:: 这是不相关的OpenHelix, 我们只知道和喜欢Bioinformatics.org团队,并希望传播这个词.

 

因子rcsB PDB和OpenHelix宣布一项更新免费教程和培训材料

新教程反映了许多变化对网站和增强因子rcsB临时区议会, 并包括一个叙述在线教程, PowerPoint幻灯片, 讲义, 和演习.

贝勒维, 西澳 (华美) 四月 12, 2011

结构生物学的研究合作实验室 (因子rcsB) 蛋白质数据银行 (临时区议会վ) 已与OpenHelix提供了修订和更新教程 (http://www.openhelix.com/PDB) 其免费的网络为基础的资源研究生物大分子 (銈://www.pdb.org).

该因子rcsB兴盛提供了多种工具和资源用来研究生物大分子. 港口发展局是全球单一资料库的实验确定的蛋白质三维生物结构, 核酸和复杂的组装. 作为全球港口发展局成员的合作 (wwpdb.org), 苏格拉底的因子rcsB临时区议会和临时区议会的数据诠释, 并提出了基本的和先进的搜索, 显示和可视化的方法来访问这些数据.

新教程反映了许多变化对网站和增强因子rcsB临时区议会, 包括一个新的数据钻取功能和数据的汇总, 比如一个下载页面更新配体的功能, 图像和数据的结合亲和力, 新的报告类型和可视化选项, 许多人.

新的培训材料 (在 http://www.openhelix.com/pdb) 包括一个在线演示教程讲述: 基本和高级搜索, 如何生成报告, 探索个别结构的不同选择, 以及研究和教育资源和工具,许多人在临时区议会的因子rcsB. 约60分钟的教程, 它运行在几乎所有浏览器, 可从开始到结束或章节和导航使用向前和向后滑.

除了教程, 因子rcsB兴盛用户还可以访问有用的培训,包括动画的PowerPoint为基础用于教学幻灯片和教学材料, 建议在幻灯片脚本, 幻灯片讲义, 和演习. 这样可以节省大量时间和精力的教师和教授课堂内容创造.

用户可以查看教程和材料,并免费下载 http://www.openhelix.com/pdb.

关于因子rcsB临时区议会
蛋白质数据银行的因子rcsB (銈://www.pdb.org), 由研究合作实验室管理的结构生物信息学 (因子rcsB), 通过提供有关生物分子结构的一个重要的信息资源的全球科研和教育. 这些生命的分子存在于所有生物体, 从细菌和植物对动物和人类.

该因子rcsB临时区议会的成员机构共同管理该项目: 拉特格斯, 新泽西州的州立大学和圣地亚哥超级计算机中心和药剂业及制药科学斯卡格斯在加州大学, 圣地亚哥.

关于OpenHelix
OpenHelix, 有限责任公司, (銈://www.openhelix.com) 生物信息学和基因组学提供了搜索和培训门户, 让研究人员找到一个地方,学习如何使用网络资源和数据库. 搜索门户网站的搜索数百OpenHelix资源, 教程套房和其他材料的研究,以最直接相关的资源和培训材料的需求OpenHelix. 研究人员和机构可以节省时间, 预算和人力资源,通过利用订阅到近 100 通过门户网站提供在线教程套房. 更有效地利用资源的手段最相关的更快和更有效的研究.

蛋白质结构计划推出一个更新的免费OpenHelix教程和培训材料的结构生物学知识库 (SBKB).

免费知识库的结构生物学教程套件包括一个在线电影叙述, PowerPoint幻灯片, 幻灯片讲义和练习.

贝勒维, 西澳 (华美) 四月 11, 2011

知识库的结构生物学 (SBKB), 一个有关的蛋白质信息的一站式商店在罗格斯大学举办, 已与OpenHelix提供免费更新和修改教程套房 (http://www.openhelix.com/sbkb) 其网上蛋白质“门户”位于 http://sbkb.org/.

是一个免费的SBKB, 通过全面的资源生产之间的健康的蛋白质结构倡议的国家机构之间的合作: 生物学课程与自然出版集团. PSI的SBKB包含遗传, 结构, 功能和实验信息的蛋白质,很容易获得通过的报告和各种显示器. 该门户网站还包括许多额外的资源链接.

新教程反映了许多变化,以及增强的SBKB, 从结构基因组学,包括最近更名为知识库结构生物学知识库, 新的导航组织, 改造和蛋白质模型门户报告, 许多人.
线上叙述在几乎任何浏览器教程运行,并可以在许多方面导航. 在谈到 60 分钟, 本教程强调和解释的特点和功能需要,开始使用有效的SBKB. 本教程可以使用新的用户向他们介绍门户网站的蛋白质, 由以前的用户可以查看新的特性和功能, 或只是作为一个参考工具,了解特定功能.

除了教程, 用户还可以访问有用的培训,包括动画的PowerPoint为基础用于教学幻灯片和教学材料, 建议在幻灯片脚本, 幻灯片讲义, 和演习. 这样可以节省大量时间和精力的教师和教授课堂内容创造.

用户可以查看教程和材料,并免费下载 http://www.openhelix.com/sbkb.

关于防扩散安全倡议
蛋白质结构计划 (防扩散安全倡议, http://www.nigms.nih.gov/Initiatives/PSI/psi_biology/), 这是支持由美国国立卫生研究院, 是一个联邦制, 在大学和企业的努力极大地降低成本和减少花费的时间来确定一个三维蛋白质结构的目的. 对PSI的长远目标是使从他们​​相应的DNA序列知识的三维原子级的最容易获得的蛋白质结构. PSI的努力以取得新的结构生物学的见解,并帮助广大的生物医学研究界的研究成果使PSI的使用.

关于OpenHelix
OpenHelix, 有限责任公司, (銈://www.openhelix.com) 生物信息学和基因组学提供了搜索和培训门户, 让研究人员找到一个地方,学习如何使用网络资源和数据库. 搜索门户网站的搜索数百OpenHelix资源, 教程套房和其他材料的研究,以最直接相关的资源和培训材料的需求OpenHelix. 研究人员和机构可以节省时间, 预算和人力资源的过度利用订阅 100 通过门户网站提供在线教程套房. 更有效地利用资源的手段最相关的更快和更有效的研究.

探索开放获取生物信息学工具与自由 “世界旅游资源的基因组学” 教程套房

网上教程为研究人员和科学家的地方,了解许多生物资源提供给他们.

Quote  start这些链接协助科学家的指导,这可能是陌生的他们的资源相关的技术教程. 这与OpenHelix阿尔卡特合作, BioMed Central的杂志能够使他们的科学内涵,更为有用和访问.Quote end

贝勒维, 西澳 (华美) 四月 6, 2011

现在科学界已通过“探索和发现许多生物信息学和基因组学资源,提供给他们一个宝贵的启动点世界旅游资源的基因组学“OpenHelix教程套件.

免费教程套件包括资源的采样算法和分析工具等类别举办, 表达资源, 基因组浏览器 (真核和原核/微生物), 文学和文本挖掘资源, 和资源集中对核苷酸, 蛋白质, 途径, 疾病和变异.

在每个类别, 本教程探讨不仅是最热门资源, 但也填写独特的科研需要或一些不太知名的研究人员特别有用.

参观也显示简单的方法完成艰巨的任务自由OpenHelix搜索工具寻找和学习其他资源, 教程套房, 和其他工具.

“随着不断扩大的数据集和资源的基因组时代”沃伦说, (三分球) 车床, 在OpenHelix首席科学官, “本教程套件填补提供科学家资源的概述,并显示他们的方式找到他们,并学习如何使用它们的迫切需要。”

线上叙述教程, 它运行在几乎所有浏览器, 可从开始到结束或章节和导航使用向前和向后滑.

在本教程套件包括动画的PowerPoint幻灯片作为本教程的基础上使用, 建议在幻灯片脚本, 幻灯片讲义, 在本教程中提到的和AA的资源和教程登陆页面列表. 这节省了大量时间和精力,为教师和教授,给他人这次巡演.

这个免费的教程姊妹篇, 探索,发现和了解网上生物学计算工具, 是纸“OpenHelix: 生物信息学教育以外的一个不同的盒子“发表在题为问题的简报特别在生物信息学”特刊: 生物信息学教育“. 本文介绍的资料库,研究人员可以访问非正规教育学习上公开可用的生物信息学资源来源广泛. 这些措施包括各种各样的格式和战略资源,包括列出, 期刊,定期功能工具的描述, 和电子学习资源的来源,如麻省理工学院开放式课程的努力.

我们中断了这一计划的话… 关于个人购买教程

我们通常不博客约OpenHelix具体教程购买 (我们做的新闻发布), 这不是博客的目的, 但我真的想放弃了快速元首. 我们的教程很多都是免费给最终用户,因为该资源提供了资金,培训和推广. UCSC的, 进行编码, 临时区议会վ, 查看, SBKB星系 只是一些例子. 我们的教程批量 (检查目录: 深远 100!) 后面一 订阅 墙. 为培训人员, 基因组学教授的教学, 电力学习者, 团体和机构, 订阅做出很大的意义. 虽然有时, 个人用户需要训练对一个或两种资源,满足他们的需要. 我们刚刚增加了个人购买功能为这些用户到我们的教程.

如果你还没有订阅, 你会发现新的绿色 “购买” 和 “订阅” 按钮 (如果你订阅, 这些按钮将不会出现,当然, 本教程是无限的访问). 点击 “购买” 按钮,您可以访问该特定教程后,立即 $28.50 购买 (通过谷歌结帐, 需要一个免费的谷歌帐户, 如果你有一个谷歌的电子邮件, 将你需要人). 你必须立即访问将持续 3 天购买后. 这将会给三天无限制地访问Flash电影和下载幻灯片的能力, 讲义和练习.

再次, 你可以看到 我们在这里列出教程, 或搜索我们的资源 主页和搜索页. 只要输入在资源 (或一般主题) 你有兴趣在搜索框中. 如果我们有一个教程资源, 会有一个'益智’ 搜索结果的左侧的图标,. 绿色意味着它的赞助商和免费, 红色意味着你可以查看订阅, 或个人购买. 只需点击图标 :ð.

研讨会: 世界巡回赛的基因组浏览器和分析工具银河

想就宣布,玛丽和我 星期二, 11月2日, 2010 在华盛顿特区 (我的家乡), 前右 ASHG会议 (我们也将). 研讨会的题目是 基因组浏览器的全球巡演,以及银河的分析工具. 我们将覆盖UCSC基因组浏览器和表, 基因组的其他浏览器的概述, BioMart, 银河和旅游资源的基因组,以及如何找到他们. 如需有关位置的信息, 成本, 主题您可以在这里继续阅读. 在ASHG attendess的UCSC和银河研讨会 (我们将在, 但鲍勃, Anton和其他人会做), 但这些都卖光了,填补. 我们提供的这个研讨会,谁愿意学习这些主题和更多, 使用直流居民和ASHG参加者.

要购买一个座位,并注册, 去我们 即将举行的研讨会页.

继续阅读

在生物信息学简报 – 我们的教育文件可现在

早在4月,我偶然提到,我们 (OpenHelix) 正在写一份关于生物信息学教育的非正式文件的来源 (在一个星期五SNPets项目) 我们被要求公布的文件出来时. 嗯, 我们得到消息在上周末的文章已经发表. 文章将出现在一个特别的问题 在生物信息学简报 致力于生物信息学教育. 我不知道,如果这个问题的所有文章还, 但它看起来像几个在该杂志的高级访问. 生物信息学教育是一个地区 (显然) 这OpenHelix深切关注 & 我们焦急地等待着完整的问题,我们的副本,这样我们就可以阅读所有的文章, 但我离题…

标题 “OpenHelix: 生物信息学教育以外的一个不同的盒子” (如果你打一个paywall, 或无法访问, 我们会很乐意送重印. 只要电子邮件通讯作者, 詹妮弗上市抽象或从我们的要求 联系我们友情链接- 三分球) 是一个凉爽的建议,从文章的评论之一 – 我原来的标题是多少驯 (确定, 更无聊). 不管最后的标题, 我们想要做的文章是讨论非正式的生物信息学教育来源. 通过教育,我们做意味着获得适用的信息,使研究员生物信息学领域内的经营. 由非正式的,我们的意思是传统之外, 信贷类和学位. 从本质上讲,我们提供了一个位的知识和技术诀窍,我们已经聚集了数百个资源工作多年, 数以千计的研讨会与会者, 哪里的研究员无数的在线联系人, 或图书馆, 或在生物信息学领域的各种信息需求谁就可以打开.

我们的论点是,不是每个人都需要计划在管理和操纵这些天他们的生物数据. 有这么多的罚款公开提供的数据库, 算法, 工具和更多, 它仅仅是一个宣传和培训的问题,任何人都可以可以重新格式化和分析他们的个人资料集. 我们认为, :

…生物信息学的教育需要做四件事情的最低:

1. 提高现有资源的认识
2. 使研究人员能够发现并评估资源的功能
3. 降低之间的认识和使用资源的的障碍
4. 支持用户经常资源继续教育的需求

在纸张中,我们走过这些 – 我们首先描述与点相关的例子需要, 然后可能满足需要的非正式资源. 本文包括资源和链接的表和很多引用. 我们真的希望这是一个非常有用的资源在生物信息学教育领域的. 我已经期待到下一个特殊的教育问题作出贡献, 既磨练了我的写作技巧和扩展的信息,我们可以为读者提供. 请不要评论, 电子邮件, 不管,让我们了解您使用的资源, 你从文章中了解到, 等. 哦, 这里的引文信息:
ResearchBlogging.org
威廉姆斯, j的, 锰, 米, 佩罗- Micale, 三, 车床, 学, Sirohi, 全, & 车床, 在. (2010). OpenHelix: 生物信息学教育以外的一个不同的盒子 在生物信息学简报 分类号: 10.1093/bib/bbq026