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[mise à jour]Astuce de la semaine: Une lacune dans la Crédits, Certains effets sur la recherche

nsfclosed[se tenir au courant de l'effet sur la recherche, ce à partir est une bonne article de Science Careers, Voir ci-dessous pour plus de liens et d'informations]. Pardonnez-moi pendant que je crée un laps de nos conseils hebdomadaires et place donne un 'initié de’ voir de l'arrêt (ou à la prescription des crédits dans le langage officiel). Cette très certainement pas une pleine compréhension de la façon dont l'arrêt de gouvernement vous réaliser en tant que chercheur, éducateur ou un étudiant, mais j'espère vous donner une idée.

Comme de nombreux lecteurs le savent, Je suis actuellement sur une base temporaire laisser partir OpenHelix de travailler à la National Science Foundation. Bien en congé, J'écris toujours Conseils (entre autres activités) pour le blog. Mon tour était aujourd'hui. Malheureusement, hier, le gouvernement a fermé et si elle l'a fait, il a fallu beaucoup de la journée pour se préparer à un «arrêt ordonné.’ On nous a donné une grande partie de la journée pour arrêter les opérations. Ce fut un moment intense d'e-mails, des appels et des préparations. Nous avons dû quitter le bureau par 1:30h. (malheureusement pour moi mon ordinateur saisi dans sa propre version d'un arrêt de la veille). Alors que vous, nos lecteurs, peut avoir une idée de l'effet de l'arrêt de la NSF et la recherche en général, Permettez-moi de raconter mon expérience et certaines des affects la fermeture aura sur la recherche et peut-être vous.

Mon travail à la NSF (et AAAS), pour la plupart, implique de travailler sur des programmes visant à élargir la participation à l'enseignement des sciences. Parmi les autres activités, J'organise des réunions de travail pour explorer la recherche dans ce domaine et de développer et d'exécuter un projet d'engagement de la science pour les jeunes réfugiés.

Dans le cadre de l'arrêt, NSF fermé ses portes. C'est à peu près un arrêt complet vers le bas. Tous les employés de la NSF ont dit qu'ils avaient jusqu'à 1:30h pour terminer une “arrêt ordonné” de toutes les activités. Pour moi, cela inclus emailing toutes les IP et les éducateurs participant à une réunion la semaine prochaine ici à la NSF sur l'éducation de l'informatique pour les personnes handicapées et d'autres que je travaille avec d'autres projets. Par les règles fédérales, aucun employé NSF, Le personnel boursier ou autre n'est autorisé à accéder au courrier électronique, répondre aux communications, travailler sur toutes les activités liées à la NSF, se rendre à des conférences ou des réunions ou autrement effectuer toute entreprise. La violation de cette est une forte amende.

Qu'est-ce que cela signifie pour ceux qui ont des fonds ou des activités avec NSF? Si vous n'avez pas de travail immédiat ou avez besoin de contacter un employé NSF, que l'effet sera minime si l'arrêt est court. Si vous devez présenter une demande de subvention, parler à un agent de subvention ou avoir une réunion NSF d'assister ou de toute autre entreprise avec NSF dans les prochains jours (ou aussi longtemps que l'arrêt dure) vous serez en mesure de le faire. Toutes les activités ont cessé. S'il ya une réunion NSF qui a lieu pendant l'arrêt, il est annulé.

Par exemple, J'ai été la planification et l'organisation d'une réunion ici à la NSF pour les éducateurs en informatique pour les personnes handicapées. Il a tout entraîné d'obtenir des chambres installées à l'établissement de programmes à leurs auteurs choisissent de se procurer des interprètes en ASL et traduire des documents en braille. Si l'arrêt se poursuit la semaine prochaine, cette réunion sera annulée et tous les participants sera incapable de venir. Alors, dans mon cas, si l'arrêt a duré dans la semaine prochaine, cette même serait annulé, les chercheurs et les éducateurs (sur 20) traitant devra annuler leur vol et les plans et toutes les dispositions seront pour rien. Évidemment, cela aura des coûts de vols perdus et les plans, mais cela signifie aussi que des centaines d'heures de travail de travail passé seront gaspillés.

Si vous avez une attribution en cours, il devrait y avoir peu d'impact à court terme, mais pas de nouvelles demandes de propositions seront faites, subventions ne seront pas autorisés à soumettre, etc. Comme la page d'accueil dit maintenant:

Pas de nouvelles possibilités de financement (des descriptions de programme, annonces ou des sollicitations) seront émisespréparation de la proposition de FastLane et la présentation seront indisponibles.Grants.gov peut être opérationnel, Mais, depuis FastLane ne sera pas opérant, téléchargements proposition de Grants.govn'aura pas lieu. C'est pourquoi les propositions ne seront pas vérifiées pour la conformité avec les exigences de préparation de la proposition sans provision ou traitées avant les opérations normales soient autorisés à reprendre.”

L' National Institutes of Health sera également l'arrêt si l'impact sera quelque peu différente. Depuis NIH est une institution de recherche, en plus d'être un un octroi (NSF est une institution accordant), toutes les recherches au NIH cessera. Les universités se sentent peu à court terme affecter comme l'un des trois cycles d'octroi viennent de terminer. Cela dit, 5 octobre est la prochaine série de délais et si la fermeture vers le bas continue au-delà de cette date, pas de demandes de subventions seront acceptées. Un court arrêt ne fera que retarder le traitement de ces subventions pendant un mois, plus le délai le plus exponentielle retardé le processus deviendra en raison de retards.

Il ya d'autres effets sur l'arrêt des chercheurs ont également. Visa commandites ou demandes de chercheurs invités ne seront pas émis lors de l'arrêt et certaines activités seront reportées ou cessent. Un autre exemple de mon propre travail est le programme d'engagement de la science Je cours pour les jeunes réfugiés. Bien que n'étant pas financé par la NSF, c'est quelque chose que je fais dans ma bourse et donc je ne suis pas autorisé à travailler sur elle. Cela signifie que le programme sera interrompu jusqu'à nouvel ordre et les étudiants ne seront pas en mesure de participer aux activités qu'ils ont été très heureux de le faire.

Alors, nous allons réitérer le haut 10 effets sur la recherche de l'arrêt auront:

10. NSF, NIH et d'autres sites d'agences et d'information seront indisponibles ou affectées. De nombreuses bases de données telles que PubMed ne seront pas mis à jour ou maintenus.
9. Visas pour les scientifiques en visite aux États-Unis ou collaborateurs scientifiques à l'étranger ne seront pas traitées.
8. Paiement des prêts et des bourses étudiantes pourraient être ralentis ou autrement affectées à long terme.
7. NIH, NSF et d'autres réunions agence hébergés et discussions cesseront.
6. De nouvelles propositions de subventions ne seront pas acceptés, traités ou examinés.
5. Les entrepreneurs et les entreprises qui dépendent de la NSF, NIH et d'autres institutions de recherche et d'octroi ne recevront aucune entreprise et les paiements seront retardés.
4. Gouvernement chercheurs employés, accorder des officiers et du personnel (au NIH et la NSF entre autres organismes) ne seront pas payés.
3. Gouvernement chercheurs employés, responsables des subventions et du personnel ne seront pas autorisés à travailler ou à contribuer à toute et à toutes les réunions, activités ou les communications liées au travail.
2. La recherche au NIH (et d'autres organismes comme l'ARPA-E de l'énergie) cessera.

et le numéro un effet sur (au moins dans le facteur de tristesse)
1. Enfants avec le cancer sera détourner au NIH.

Connaissez-vous un effet manqué ici? Comment!

Une article de ThinkProgress sur d'autres effets sur la science et la recherche, y compris d'autres organismes comme NOAA, etc.

Une longue discussion sur Reddit des scientifiques (avec quelques bons pointeurs et pas si bonnes histoires) sur les effets.

Ne vous inquiétez pas, l'expiration d'une pointe de vidéo ne sera pas longtemps que l'arrêt. J'ai beaucoup de temps aujourd'hui :D , sera donc de faire un pour plus tard.

Il ya une base de données pour tout, même uber-opérons

Je jouais autour avec Google Scholar est caractéristique nouvelle citation ce qui m'a permis de recueillir mes papiers dans un endroit facilement (a fonctionné assez bien, TVA, sauver quelques pépins, voir ci-dessous) quand j'ai remarqué qu'il manqué un papier de la mine de 2000: “La conservation des gènes cadre un ordre supérieur opérons.” Le résumé:

Opérons, co-transcrits et co-régulés ensembles contigus de gènes, sont mal conservés sur de courtes périodes de temps évolutionnaire. L'ordre des gènes, contenu des gènes et des mécanismes de régulation des opérons peuvent être très différentes, même dans les espèces étroitement apparentées. Ici,, Nous présentons plusieurs lignes de preuves qui suggèrent que, bien un opéron et ses gènes individuels et les structures réglementaires sont réarrangés en comparant les génomes de différentes espèces, ce réarrangement est un processus conservateur. Des réarrangements génomiques invariablement conserver les gènes individuels dans des contextes fonctionnels très spécifiques et réglementaires. Nous appelons ce contexte conservé une uber-opéron.

L'uber-opéron. Il a été suggéré mon mandat PI. Vivre et travailler en Allemagne à l'époque, Je pensais que c'était plutôt drôle. De toute façon, Je n'ai jamais vraiment progressé plus que l'autre sorte de papier ou sur cette recherche et le genre de piste perdue si ce document a donné lieu à peu près. J'ai tapé «uber-opéron’ dans Google aujourd'hui et constaté que ça a été cité à quelques reprises (88) et, J'ai trouvé cela intéressant: il ya eu quelques bases de données construite sur “uber-opérons.”

Un groupe de recherche chinois a créé la Uber-Operon base de données. Le papier semble intéressant, mais malheureusement le serveur est en panne (si cela est temporaire ou permanente, Je ne sais pas), l' ODB (Operon base de données) utilise uber-opérons (qu'ils appellent opérons de référence) de prédire opérons dans la base de données , Nebulon est un autre, HUGO est un autre. Lire le chapitre sur les méthodes de calcul pour prédire uber-opérons :)

Va juste pour vous montrer, il ya une base de données pour tout.

Oh, et retour à Google Scholar citations. Il ne trouve presque tous les papiers que j'ai publié, mais il a manqué deux (dont celle ci-dessus) et a eu deux faux positifs. En outre, de nombreuses citations sont manquants (comme le 88 pour cet article, et bien d'autres des autres papiers). Cela ne veut pas dire que c'est pas utile, Je trouve ça un bel outil mais il n'est pas parfait. Vous pouvez fen savoir plus sur Google Scholar citations ind ici, et environ Une fonction similaire de Microsoft ici.

Oh, et ne ce post m'a mis dans le HumbleBrag Hall of Fame? Si c'est réservé à twitter, que je devrais peut-twitter-ce si je peux y arriver :). (si je ne suis pas sûr en soulignant les bases de données relativement petite base un document relativement mineur constitue vanter, humblement ou pas LOL).

Nouvelle fonctionnalité, articles de recherche, sur le site OpenHelix

Si vous passez à la OpenHelix home page, vous commencerez à noter quelques différences. Nos pages d'atterrissage tutoriel ont une caractéristique supplémentaire de nouveaux. Nous avons maintenant une section sur chaque page de destination qui montre les plus récentes recherches dans les revues de BioMed Central. Par exemple, la capture d'écran ici est pour notre GeneMANIA tutoriel Suite. Dans le coin inférieur gauche, vous verrez l' 5 articles de recherche les plus récents qui ont utilisé GeneMANIA de l' BioMed Central catalogue de revues de recherche. Cela sera utile aux utilisateurs d'obtenir une idée de ce genre de données d'une ressource a la recherche qui se fait à l'aide de la ressource. Ce sera également utile pour trouver d'autres ressources qui pourraient être utiles (souvent une ressource associée est-mentionné en liaison avec la ressource d'intérêt).

C'est le début d'une série de nouvelles fonctionnalités que nous espérons pouvoir ajouter des pages de destination qui permettront d'améliorer la capacité des chercheurs à apprendre tout ce qu'ils peuvent sur les données et les outils mis à leur disposition. Nous allons ajouter un “Conseils vidéo récents” la section et plus.

Et, Si vous êtes un éditeur d'ouvrages de recherche et que vous souhaitez obtenir une liste «des études récentes’ de ce genre sur nos pages d'atterrissage pour vos revues (devront avoir accès au texte intégral des articles), s'il vous plaît contactez-nous et nous serions ravis de travailler avec vous pour le faire pour le bénéfice de vos journaux, des moyens, les chercheurs et oui, OpenHelix :).

Dans notre effort continu pour maintenir et développer notre base de données moteur de recherche et, nos tutoriels, notre blog et plus, vous remarquerez aussi que nous avons ajouté de la publicité sur notre site. Les petites annonces sont une bannière publicitaire en haut, une annonce gratte-ciel de côté et une petite annonce sur les pages d'atterrissage de tutorat. S'il vous plaît envisager de considérer ces sponsors s'ils vous intéresser. Annonces ne seront pas sur les tutoriels parrainé tels que UCSC Genome Browser et PIB, et autres, ils ne seront visibles pour tous les abonnés au catalogue de didacticiels.

Si vous désirez parrainer un tutoriel afin qu'il soit accessible au public, si vous êtes le développeur de l'outil ou d'une entreprise, s'il vous plaît nous contacter au sujet de la possibilité d'obtenir une formation et de sensibilisation à un grand nombre de chercheurs.

Aussi, si nous avons une douzaine de tutoriels qui sont parrainés par la disposition du public, nous avons un large catalogue de plus de 90 des didacticiels supplémentaires disponibles à la souscription. Vous pouvez subscribe pour accéder à ces en tant qu'individu, département ou institution.

 

Astuce de la semaine: SciVee, YouTube de la science

Chaque semaine, nous faisons un bout vidéo de la semaine. Chaque semaine, nous utilisons SciVee pour télécharger et partager cette vidéo (notre compte ici). Nous avons maintenant près 50 conseils et des vidéos résidant à SciVee. SciVee a été appelé le YouTube de la science. Comme sur YouTube, il vous permet de télécharger des vidéos, mais dans ce cas exclusivement liés à la science. De plus si, SciVee vous permet de faire un peu de «science-spécifique’ actions que vous ne serait pas capable de faire avec YouTube ou Vimeo. PubCasts et PosterCasts Deux de plusieurs fonctionnalités telles (Papercasts sont similaires à Pubcasts, non seulement publié des articles). Ces fonctionnalités vous permettent de télécharger une vidéo décrivant votre recherche puis téléchargez un document et l'affiche et de synchroniser le papier ou une affiche pour la vidéo. Cela permet à l'auteur pour décrire le papier (ou une affiche) et la recherche alors que le spectateur peut voir les sections pertinentes du papier ou une affiche. Il ya davantage sur la façon de le faire ici. Une session de posters virtuels, ou une conférence virtuelle. Une fois que vous le faites, vous pouvez intégrer vos vidéos sur un autre site web (comme nous le faisons ici,!) à partager et à permettre aux autres de partager. C'est un excellent outil pour partager vos recherches et l'obtenir à un large public.

La pointe du jour de la semaine est une courte introduction aux SciVee et un tutoriel rapide sur le téléchargement de vos propres vidéos.

A la fin, vous verrez que nous avons une communauté à SciVee appelé “Formation de ressources en génomique.” Là, vous verrez toutes les astuces de la semaine que nous avons fait. En outre, nous ajoutons la génomique et biologique d'autres outils de données et bases de données de ressources à la communauté quand nous les trouvons. Check out et rejoindre la communauté:

Visit Genomics Resource Training Community

Une nouvelle fonctionnalité de BioMed Central

Apporté à vous par OpenHelix et BioMed Central :D. Nous aimons vraiment la fonctionnalité et l'idée (bien sûr) et avons pensé le transmettre.

BioMed Central (BMC) est un éditeur libre accès. BMC avec OpenHelix lancé un nouvelle fonctionnalité récemment de donner aux lecteurs des journaux BMC accès rapide à des ressources pertinentes tutoriels génomique. Lorsque vous lisez un article de recherche chez BMC, les chercheurs sont désormais des liens vers des tutoriels en ligne de nombreuses ressources en génomique et les outils utilisés ou cités dans l'article. Le lien conduit le lecteur directement à la page d'atterrissage de formation sur le site OpenHelix. BMC propose un vaste choix du libre accès de haute qualité des revues de recherche et une grande partie de la recherche a annoncé aujourd'hui utilise et cite de nombreuses ressources sur les trains OpenHelix. Les chercheurs peuvent maintenant trouver rapidement une formation sur les bases de données et les outils utilisés dans la recherche. Par exemple, cet article récent , Caractérisation genomewide d'ARN non-polyadénylé, dans BMC Genome Biology cite plusieurs outils utilisés dans leur recherche, y compris GEO, MEME et d'autres. La nouvelle fonctionnalité trouve ces citations dans l'article et liste de liens vers les tutoriels OpenHelix sur ces ressources comme on le voit dans l'image.

Il peut être difficile de trouver un lien rapide vers une ressource pertinente dans les documents–les citations sont parfois incomplètes, ou non lié au site.

Nous avons des plans pour étendre cette fonctionnalité dans plusieurs façons de faire de la formation sur les ressources pertinentes et importantes en génomique simple et plus rapide pour les chercheurs.

Nous avons déjà obtenu quelques bons commentaires sur cette–Excellente idée!

@jytricker Excellente idée! @BioMedCentral / OpenHelix jv sera l'entraîneur scientifiques sur la génomique / outils bioinformatiques mentionnés dans les documents http://ow.ly/4eQbG

 

app iPad pour molécules en mouvement

Trouvé ceci de Wired, le vendredi, iPad permet aux scientifiques Drag, Molécules Pinch et Swipe réel . C'est une application qui permet aux scientifiques de manipuler les molécules avec une pince optique en utilisant l'iPad comme interface. Tout un app fascinante et la vidéo est intéressante.

Got me penser, comment est et pourrait un ordinateur tablette peut être utilisée dans les sciences biologiques (banc ou autrement,)? J'ai écrit au sujet applications de l'iPhone avant.

J'ai un iPad, et je l'utilise beaucoup pour la lecture des nouvelles, lire des livres, rattrapage par email, regarder des films. Je trouve que c'est le potentiel mais beaucoup plus intrigant que ce que je m'en sers pour les.

Il ya quelques recherches liés à la biologie grande apps que j'utilise. J'utilise Documents (iTunes s'ouvre) de lire et d'annoter les documents de recherche, et j'ai le Nature et PLoS applications lecteur, mais il se sent pour moi que les développeurs ont seulement exploité la surface de ce qu'on pourrait faire avec un ordinateur de poche à écran tactile tablet (que ce soit iPad ou en ardoise…). Ou du moins ce qu'il semble que vous devriez pouvoir faire repose sur Films Star Trek :D.

Je peux voir un soft pour garder un cahier de laboratoire (il ya des applications portables, mais je veux quelque chose orientée vers des notes de laboratoire. Je peux voir un soft permettant de manipuler des alignements de séquences multiples (un peu comme JalView) ou même un jeu comme Il Fold sur l'iPad pour les séquences multiples aligne. En fait,, pourquoi ne pas plier sur l'iPad ou tablette. UCSC Genome pensé qu'il navigateur peut être consulté en utilisant le navigateur sur l'iPad, Je peux voir une place suped GenomePad pour la tablette. Que diriez-vous d'une application personnelle génomique?

Avez des idées ou des applications que vous utilisez pour la recherche ou aimeraient voir?

Examen par les pairs à nouveau…

Juste un commentaire rapide recueillies à partir d'un lien Mary m'a montré. J'ai eu ma ins courir avec examinateurs de papiers et de subventions. Certains examinateurs ont certainement un ordre du jour et, comme les humains, tous les commentaires ont des préjugés subjectifs. Je pourrais vous raconter des histoires. Mais, pour la plupart, même donné les frustrations énormes quelques, le processus d'examen ont fait mes recherches et de documents scientifiques de mieux et le resserrement.

Examen par les pairs n'est pas sans ses problèmes, il ya des blogs entiers (comme Peer-to-Peer) et les communautés en discuter. Et bien sûr,, beaucoup de recherche de qualité inférieure est publié, comme en témoigne la possiblty rdébats récents de la papier d'arsenic bactérie mangeuse. J'ai lu mon quota de recherche vraiment mauvais et les conclusions fallacieuses des revues. Mais encore une fois, c'est la somme totale du système de revue par les pairs (et la discussion subséquente, plus de recherches, publications réfutation) qui a manifestement créé d'excellents projets scientifiques et de l'avancement de notre compréhension de la biologie jusqu'ici.

Nature Precedings n'est pas une alternative par les pairs, c'est un endroit pour mettre des recherches avant la publication des revues avec comité inviter à la discussion, stimuler de nouvelles recherches et revendication de priorité. Mais j'ai vu qu'il a souligné que la partie d'une alternative. Pourtant,, c'est les papiers comme celui-ci (et deux autres du même auteur) que cela me rends compte que les pairs est un purgatoire nécessaire. Je ne vais pas passer le temps éviscération des questions de cette recherche, ils sont légion et il ne vaut pas mon temps. Je peux imaginer le lecteur occasionnel de la Nature Precedings pourriez rencontrer et de voir tous les biolingo et pensent que c'est la recherche légitime, mais vraiment cela ne me concerne pas. Mais, l'auteur de ces articles les utilise pour légitimer sa thèse principale: “génome des données s'avère fausse la théorie de l'évolution.” Il le fait dans un communiqué de presse (http: //www.prweb.com/releases/theory/genome/prweb4896744.htm .. Je ne vais pas un lien afin de ne pas donner cette légitimité Web plus, mais vous pouvez prendre l'espace si vous voulez le voir) où il a des liens à tous les trois “les publications”:

Grâce à la génomique moderne, Dr. Senapathy et du travail de son équipe, a montré comment l'abondance et la diversité de la vie sur terre provient directement dans l'environnement prébiotique. Ils ont présenté les résultats de trois publications scientifiques dans la revue Nature Precedings: de publication 1, de publication 2, de publication 3.

La recherche montre que les données du génome modernes déracine complètement le modèle d'évolution.

Il utilise le respect bien mérité de la marque “Nature” et le tour de main à les appeler “les publications” (quand tout ce qu'ils sont pré-imprimés sans examen par les pairs ou de révision de la science) pour donner une légitimité à une conclusion de contrefaçon.

Avec tout le woo "’ dans ce monde, Je soupçonne que les pairs ou une autre solution rigoureuse (dont je n'ai pas encore vu) est plus nécessaire que jamais pour faire avancer la science.

Modifier par Mary: J'étais juste en regardant quelques journalistes découvrir cette histoire sur MuckRack (http://muckrack.com / sci ) et voici ce qu'ils ont dit:

Astuce de la semaine: BioExtract Server

L' BioExtract Server est un outil qui permet au chercheur de la recherche et l'accès aux données, analyser ces données et de stocker les données et créer des workflows de l'analyse. À cet égard, il est très semblable à Galaxy. BioExtract a été développé par deux groupes (Brendel et Lushbough) à l'Iowa State University et du Dakota du Sud, respectivement.

Aujourd'hui, la pointe dans une rapide introduction à BioExtract. Si vous avez utilisé avant le Galaxy *, vous remarquerez immédiatement les différences dans l'exécution, convivialité et de la communauté. Les deux ont des workflows. J'aime la mise en œuvre Galaxy de meilleures histoires et Bioextract ne semblent se concentrer sur la génomique comparative plus. Les deux BioExtract et Galaxy sont (ou seront) une partie de MyExperiment, un site pour trouver, utiliser et partager des workflows et des autres “objets de recherche.”

Dans la pointe d'aujourd'hui je donne une intro base, ils ont un bon conseil sur la façon de faire des workflows, dont je ne vont pas dans, ici (plus Aide ici).

*(Divulgation: OpenHelix ne formation et de sensibilisation pour Galaxy)

Astuce de la semaine: Pages Galaxy

Astuce de cette semaine est une brève introduction aux Pages Galaxy. Ce sont des pages spéciales que les utilisateurs peuvent créer au sein du Galaxy système d'annoter, décrire et expliquer les différentes analyses faites à l'aide Galaxy. L'utilisateur dispose de nombreuses capacités à relier et intégrer des histoires, workflows et des ensembles de données avec l'aide de textes et d'images et plus de bien d'annoter les analyses. Comme le décrit la semaine dernière, cela est l'un des nombreux ajouts Galaxy a ajouté pour augmenter la reproductibilité et la transparence de la recherche en génomique.

Marocaine des sciences

Allez Akhawayn University, Ifrane Maroc

La semaine dernière, j'ai assisté et a enseigné un atelier pour la Société Marocaine des Sciences de la Vie américaine (Biomatec-Unis) à leur atelier international 2e et 9e réunion annuelle, à Ifrane Maroc.

J'ai été très impressionné. Impressionné avec le Maroc, Les scientifiques marocains et les étudiants marocains. J'ai eu l'occasion d'interagir avec les trois. D'abord cette étudiants. J'ai enseigné trois ateliers, incluant une visite de ressources génomiques et deux how-to pour le navigateur du génome UCSC et le tableau du navigateur. Tous ont été accueillis avec enthousiasme. Mais plus que cela, j'ai été impressionné par l'enthousiasme de ces étudiants a montré pour la recherche en génomique et bioinformatique. Après chaque conférence et plus tard dans la journée, J'ai été inondés avec des questions et des demandes (que j'aime). Leur enthousiasme pour la science correspond ou surpasse n'importe quel autre groupe d'étudiants en sciences que j'ai rencontrés dans mon 20+ ans de carrière en biologie. En plus de cela, J'ai rencontré plusieurs étudiants qui j'ai pu discuter de leurs recherches avec un peu.

Aussi, J'ai pu discuter de la recherche au Maroc avec des scientifiques marocains de plusieurs informelle et d'assister à une table ronde sur l'avancement des sciences marocaine, spécifiquement biologiques et la recherche en bioinformatique. Scientifiques marocains, fois au sein et en dehors du Maroc, font des recherches de classe mondiale, y compris les mon hôte, bien sûr. Les recherches effectuées au sein du Maroc et par la diaspora marocaine du '’ des scientifiques (il y avait des scientifiques marocains à partir des États-Unis, L'Europe et le Moyen-Orient il ya), semble être un réseau mûrs, en collaboration avec l'enthousiasme des élèves, est une excellente ressource pour cette nation.

Si le niveau de la recherche et l'enthousiasme des chercheurs et des étudiants sont une indication, Marocaine des sciences sera fait de grands progrès dans les années à venir. Bien sûr,, ce n'est pas quelque chose de nouveau, je suis sûr, tout nouveau pour moi :D.

J'ai appris (réappris) deux choses sur ce voyage. Le monde est très petit, et très grand. J'ai rencontré plusieurs personnes qui avec qui j'ai eu croisé avant ou qui nous avions des amis communs de placement. Il était le scientifique marocain qui j'ai brièvement rencontré en Allemagne tout en faisant un postdoc là et l'étudiant marocain qui connaissait quelqu'un que je connaissais depuis le Qatar. On m'a demandé de parler brièvement et de la table ronde et je l'ai mentionné virtuels conférence africaine j'avais donné un atelier au, et que je pensais qu'il y avait une plaque tournante du Maroc à cette conférence. Assez sûr, l'un des scientifiques à la discussion avait assisté à mon atelier (et avait de bons mots pour elle :D). Ok, vous pourriez dire, c'est le monde "’ de la science. Eh bien, il descendit même à la femme que j'ai rencontré à l'hôtel qui était un boursier Fulbright faisant des recherches sur la musique berbère et l'arabe… et l'homme qui m'a donné un tour de la conférence de la dernière soirée, qui vient tout juste arrivé à son superviseur marocaine.

Et c'est un monde immense avec beaucoup de découvrir et de crainte, parfois blasés mon auto (rarement, mais je ne peux être là). Je n'ai jamais entendu parler de L'huile d'argan avant,

Rue & magasins dans la médina de Fès, Maroc

traditionnellement produit à partir de graines collectées à partir des fèces de chèvres (aujourd'hui, il est plus probable collectées et traitées par des méthodes plus modernes :), ou même considéré comme le tour du magique médina de Fès (à laquelle je dois revenir). Je n'avais aucune idée de l'existence de Allez Akhawayn University in Ifrane, une petite école d'arts libéraux dans la fraîcheur (il neige) montagnes du Maroc à Ifrane (Pourquoi je veux continuer à écrire que ifrane :D? ). Beau campus.

L'autre chose qui est venu à l'esprit alors qu'il assistait à cette conférence et de parler avec des scientifiques marocains est le potentiel (et la réalité inaperçue) des possibilités de recherche en dehors du triangle américano-européen-japonais. Bien sûr, l'Inde et la Chine sont la production de recherches de plus en plus grande au fil des ans, mais il ya une autre 100 ou si les pays là-bas avec un autre milliard de quelques personnes ayant un énorme potentiel. Bien sûr, ces petits pays ont toujours produit de grands scientifiques, mais je commençais à penser que la génomique et de la bioinformatique est en train d'aider les petits pays "faire un bond’ recherche biologique autant que la technologie cellulaire a permis à certains pays en développement à «saute-mouton’ à partir de lignes téléphoniques traditionnelles (cher, difficile à faire) au fil (moins cher). La recherche biologique a traditionnellement être forte intensité de ressources: laboratoires, grandes universités, équipements. Bioinformatique et la recherche en génomique, quoique toujours nécessitant une infrastructure, a une faible barrière d'entrée, je crois. J'ai fait un commentaire dans mon exposé, “Il n'ya pas de manque de données,” et c'est vrai. La quantité de données disponibles pour l'analyse est stupéfiante. Le nombre d'outils disponibles publiquement et bases de données est écrasante. On n'a pas besoin de faire “mégascience” en génomique (si il est sûr que) à faire des recherches de classe mondiale. Du Thar en or de recherche dans ces collines de données (désolé pour la référence à la California Gold Rush, J'ai _do_ vivre dans ce qui était au centre de tout cela). Or qui peut être exploité par toute personne, de laboratoire ou d'une nation avec un peu d'éducation et de l'enthousiasme.

J'espère revenir l'année prochaine à la conférence année le Maroc et la prochaine. J'ai beaucoup plus à apprendre :D. Et peut-être je peux enseigner un peu trop.