الوسم المحفوظات: بحث

[التحديث]نصيحة الأسبوع: مرور في الاعتمادات, بعض يؤثر على البحوث

nsfclosed[لمواكبة التأثير على البحوث, هذا من هو جيد المادة من علوم وظائف, انظر أدناه لمزيد من الروابط والمعلومات]. اغفر لي وأنا خلق مرور في نصائح الأسبوعية لدينا وبدلا من ذلك تعطي واحدة 'الداخل’ عرض من الاغلاق (أو مرور في الاعتمادات في لغة رسمية). هذا ليس فهم قطعا كاملا لكيفية اغلاق الحكومة سوف يؤثر أنت كباحث, المربي أو الطالب, ولكن نأمل سوف تعطيك فكرة.

وكما يعلم كثير من القراء, أنا حاليا بصفة مؤقتة ترك من OpenHelix للعمل في مؤسسة العلوم الوطنية. على الرغم من على ترك, ما زلت أكتب نصائح (من بين أنشطة أخرى) لبلوق. جاء دوري اليوم. للأسف, أمس الحكومة إيقاف وعلى الرغم من أنه لم, أنها أخذت الكثير من اليوم للتحضير ل'اغلاق منظم.’ لقد أعطيت جزء كبير من اليوم لاغلاق العمليات. وكان ذلك الوقت مكثفة من رسائل البريد الإلكتروني, دعوات والاستعدادات. كان علينا أن ترك منصبه 1:30مساء. (لسوء الحظ بالنسبة لي ضبطت جهاز الكمبيوتر الخاص بي حتى في انها النسخة الخاصة من الاغلاق في اليوم السابق). حتى يتسنى لك, قرائنا, قد تحصل على فكرة عن تأثير للاغلاق على جبهة الخلاص الوطني والبحث بشكل عام, اسمحوا لي أن تتصل تجربتي وبعض من يؤثر سوف اغلاق لها على البحث وربما كنت.

عملي في جبهة الخلاص الوطني (وAAAS), بالنسبة للجزء الاكبر, يتطلب ضرورة العمل على برامج لتوسيع نطاق المشاركة في تعليم العلوم. من بين أنشطة أخرى, أنا تنظيم لقاءات عمل لاستكشاف البحوث في هذا الموضوع وتطوير وتشغيل مشروع الاشتباك العلم للشباب اللاجئين.

كجزء من الاغلاق, اغلاق NSF أبوابه. هذا هو الى حد كبير اغلاق كاملة لأسفل. وقيل جميع العاملين لديهم حتى NSF 1:30مساء لاستكمال “اغلاق منظم” جميع الأنشطة. بالنسبة لي شمل هذا البريد الإلكتروني عن حزب القانون والعدالة والمربين حضور اجتماع الأسبوع المقبل هنا في جبهة الخلاص الوطني حول التعليم علوم الحاسب الآلي لذوي الإعاقة وغيرهم أن أعمل مع في مشاريع أخرى. بواسطة القواعد الاتحادية, لا يجوز لأي موظف NSF, يسمح زميل أو غيرهم من الموظفين للوصول إلى البريد الإلكتروني, الرد على الاتصالات, تعمل على أي وجميع الأنشطة ذات الصلة NSF, السفر إلى مؤتمرات أو اجتماعات أو إجراء أي عمل خلاف ذلك. انتهاك هذه هي غرامة كبيرة.

ماذا يعني ذلك بالنسبة لأولئك الذين لديهم تمويل أو التعامل مع NSF? إذا كان لديك أي عمل فوري أو بحاجة إلى الاتصال الموظف NSF, من التأثير سوف يكون ضئيلا للغاية إذا اغلاق قصيرة. إذا كنت في حاجة إلى تقديم اقتراح منحة, التحدث إلى ضابط منحة أو لديك اجتماع جبهة الخلاص الوطني لحضور أو أي عمل آخر مع جبهة الخلاص الوطني في غضون الأيام القليلة المقبلة (أو طالما يستمر الاغلاق) أنت لن تكون قادرة على القيام بذلك. وقد توقفت جميع الأنشطة. إذا كان هناك اجتماع جبهة الخلاص الوطني التي تحدث أثناء إيقاف التشغيل, تم الغاؤها.

مثلا, لقد تم تخطيط وتنظيم لقاء هنا في جبهة الخلاص الوطني للمعلمين في علوم الكمبيوتر للأشخاص ذوي الإعاقة. واستتبع ذلك كل شيء بدءا من الحصول على غرف استقر لوضع جداول أعمال على المعلقين اختيار لشراء المترجمين ASL وترجمة الوثائق إلى لغة بريل. اذا استمر الاغلاق الى الاسبوع المقبل, سيتم إلغاء هذا الاجتماع وسوف تكون جميع الحاضرين قادر على المجيء. هكذا, في حالتي, إذا استمر الاغلاق في الاسبوع المقبل, هذا من شأنه حتى يتم إلغاء, الباحثين والمربين (حول 20) وسوف يحضر لديك لإلغاء رحلاتهم والخطط وسوف تكون جميع الترتيبات لشيء. ومن الواضح أن هذا سوف يكون لها بعض التكاليف من الرحلات وخطط خسر, لكن ذلك يعني أيضا أن مئات من ساعات رجل الأعمال السابقة سوف يضيع.

إذا كان لديك جائزة الحالي, ينبغي أن يكون هناك تأثير يذكر على المدى القصير, ولكن لن يتم استدراج العروض الجديد, لن يسمح المنح التي ستقدم, الخ. كما يقول موقع الآن:

عدم وجود فرص تمويل جديدة (وصف البرنامج, إعلانات أو استدراج العروض) وستصدرسوف فاست لين إعداد وتقديم اقتراح يكون غير متوفر.Grants.gov قد تكون قائمة وعاملة, ومع ذلك, منذ فاست لين لن يكون التشغيل, التنزيلات اقتراح من Grants.govلن تأخذ مكان. لذلك لن يتم فحص المقترحات للالتزام بمتطلبات إعداد اقتراح NSF أو معالجتها حتى يتم السماح استئناف العمليات العادية في.”

و المعاهد الوطنية للصحة كما سوف الاغلاق على الرغم من أن التأثير سيكون مختلفا نوعا ما. منذ المعاهد الوطنية للصحة هي مؤسسة بحثية وبالإضافة إلى ذلك لتكون واحدة منح (جبهة الخلاص الوطني هو مؤسسة منح), وسوف جميع البحوث في المعاهد الوطنية للصحة تتوقف. سوف تشعر الجامعات المدى القصير القليل تؤثر باعتبارها واحدة من دورات منح ثلاثة أكملت للتو. وقال ان, 5 أكتوبر هو الجولة القادمة من المواعيد النهائية واذا استمر اغلاق الماضية ذلك التاريخ, لن يتم قبول أي طلبات المنح. وهناك اغلاق قصيرة إلا إلى تأخير معالجة هذه المنح لمدة تصل الى شهر, ويعد هذا التأخير تأخير أكثر أضعافا مضاعفة وسوف تصبح العملية بسبب تراكم الأعمال.

وهناك آثار أخرى على الاغلاق على الباحثين أيضا. تأشيرة الرعايات أو لن يتم إصدار طلبات من العلماء الزائرين خلال إغلاق وسيتم تأجيل بعض الأنشطة أو التوقف. مثال آخر من عملي الخاص هو البرنامج الاشتباك العلوم أركض للشباب اللاجئين. وإن لم يكن تمويلها من خلال NSF, هو شيء أقوم به في إطار زمالة بلدي، وبالتالي لا يحق لي للعمل على ذلك. هذا يعني أنه سيتم توقف البرنامج حتى إشعار آخر وسوف يقوم الطلاب لن تكون قادرة على المشاركة في الأنشطة التي قد تم متحمس جدا للقيام.

هكذا, دعونا نكرر الأعلى 10 الآثار على البحوث اغلاق سيكون لها:

10. جبهة الخلاص الوطني, سوف المعاهد الوطنية للصحة ومواقع وكالة أخرى وتكون المعلومات غير متاحة أو المتضررة. لن يتم تحديث العديد من قواعد البيانات مثل مجلات أو الاحتفاظ بها.
9. لا يمكن معالجتها على تأشيرات لزيارة العلماء إلى الولايات المتحدة أو يتعاون العلماء في الخارج.
8. قد تباطأ دفعات من القروض الطلابية ورواتب أو تتأثر إلا في الأجل الطويل.
7. المعاهد الوطنية للصحة, سوف NSF والاجتماعات والوكالات الأخرى المستضافة مناقشات تتوقف.
6. لن يتم قبول المنح مقترحات جديدة, معالجتها أو مراجعتها.
5. المقاولين والشركات التي تعتمد على NSF, سوف المعاهد الوطنية للصحة والمؤسسات البحثية ومنح أخرى لا يتلقون أي عمل وسيتم تأجيل المدفوعات.
4. الحكومة الباحثين العاملين, منح الضباط والموظفين (في المعاهد الوطنية للصحة وجبهة الخلاص الوطني بين الوكالات الأخرى) لن يتم دفع.
3. الحكومة الباحثين العاملين, لن يسمح ضباط المنح وموظفين للعمل أو المساهمة في أي وجميع الاجتماعات, الأنشطة أو الاتصالات ذات الصلة بالعمل.
2. البحوث في المعاهد الوطنية للصحة (وبعض الوكالات الأخرى مثل طاقة ARPA-E) سوف تتوقف.

ورقم واحد يؤثر (على الأقل في عامل الحزن)
1. الأطفال مع سرطان سيتم الابتعاد في المعاهد الوطنية للصحة.

هل تعرف من تأثير غاب هنا? كيف!

و المادة من ثينكبروجريس حول بعض الآثار الأخرى على العلوم والبحوث بما في ذلك وكالات أخرى مثل NOAA, الخ.

A مناقشة رديت طويلة من العلماء (مع بعض المؤشرات الجيدة وقصص ليست بهذه جيدة) حول الآثار.

لا تقلق, سوف مضي في تلميح الفيديو لا تكون دام الاغلاق. لدي الكثير من الوقت اليوم :D , لذلك سيتم القيام بأحد في وقت لاحق.

هناك قاعدة بيانات عن كل شيء, حتى über بين operons

كنت ألعب مع حولها الباحث العلمي من Google لميزة جديدة الاقتباس سمح لي بأن لجمع أوراقي في مكان واحد بسهولة (عملت بشكل جيد جدا, ضريبة, حفظ اخطاء قليلة, انظر أدناه) عندما لاحظت أنه غاب عن ورقة من الألغام من 2000: “الجينات الحفظ سياق أعلى مرتبة من operons.” الملخص:

Operons, متجاورة مجموعات شاركت في كتب وشارك في التنظيم ، من الجينات, يتم حفظها سيئة على مدى فترات قصيرة من الزمن التطوري. الجين النظام, يمكن أن المحتوى الجينات وآليات تنظيمية من operons قد تكون مختلفة جدا, حتى في الأنواع ذات صلة وثيقة. هنا, نقدم عدة أسطر من الأدلة التي تشير إلى أن, على الرغم من أن ترتيبها an operon والجينات الفردية والهياكل التنظيمية وذلك عند المقارنة بين الأنواع المختلفة من الجينوم, هذا هو عملية إعادة ترتيب المحافظ. إعادة ترتيب الجينوم دائما الحفاظ على الجينات الفردية في سياقات محددة للغاية الوظيفية والتنظيمية. نحن نسمي هذا السياق الحفظ an über بين operon.

وüber بين operon. كان مصطلح PI بلدي اقترح. يعيشون ويعملون في ألمانيا في ذلك الوقت, اعتقد انها كانت نوع من مضحكا. على أي حال, لم أكن حقا توسعت أكثر من ورقة أخرى أو نحو ذلك على هذا النوع من البحث وتعقب ما إذا فقدت هذه الورقة أدى في كثير. كتبت في "über بين OPERON’ في جوجل اليوم وجدت أن أشير إلى أنه في أوقات قليلة (88) و, لقد وجدت هذه مثيرة للاهتمام: كان هناك بضعة قواعد البيانات المبنية “über بين operons.”

إنشاء مجموعة الأبحاث الصينية über بين Operon قاعدة البيانات. ورقة تبدو مثيرة للاهتمام, ولكن للأسف كان الملقم إلى الأسفل (إذا كانت هذه هي مؤقتة أو دائمة, لا أعرف), و ODB (Operon قاعدة البيانات) يستخدم über بين operons (التي يسمونها operons المرجعية) للتنبؤ operons في قاعدة البيانات , Nebulon آخر, HUGO آخر. قراءة جhapter على الطرق الحسابية للتنبؤ über بين operons :)

يذهب فقط لتظهر لك, هناك قاعدة بيانات عن كل شيء.

يا, والعودة إلى الاقتباس الباحث العلمي من Google. لم تجد ما يقرب من كل ورقة لقد نشرت, على الرغم من غاب من اثنين (بما في ذلك واحدة فوق) وتلقى اثنان ايجابيات كاذبة. بالإضافة إلى ذلك, الاستشهادات كثيرة مفقودة (مثل 88 في هذه الورقة, وغيرها الكثير من الأوراق الأخرى). هذا لا يعني انها ليست مفيدة, وأجد من وسيلة لطيفة لكنها ليست مثالية. و يمكنكأكثر من باحث عن الاستشهاد هنا IND جوجل, وحول مايكروسوفت ميزة مشابهة هنا.

يا, ويعني هذا آخر وضعني في HumbleBrag قاعة المشاهير? اذا كان هذا محفوظة لتويتر, ربما ينبغي لي أن من تويتر هذا حتى أستطيع الوصول إلى هناك :). (على الرغم من أنني لست متأكدا من الإشارة قواعد البيانات الصغيرة نسبيا على ورقة صغيرة نسبيا يشكل المفاخرة, بكل تواضع أم لا LOL).

ميزة جديدة, بحث المقالات, على موقع OpenHelix

إذا ذهبت إلى أكثر من OpenHelix الصفحة الرئيسية, عليك أن تبدأ في ملاحظة بعض الاختلافات. صفحاتنا الهبوط البرنامج التعليمي لديها الميزة الجديدة المضافة. لدينا الآن المقطع على كل صفحة الهبوط الذي يعرض أحدث الأبحاث في المجلات الوسطى بيوميد. مثلا, لقطة هنا لدينا GeneMANIA جناح تعليمي. في أسفل الزاوية اليسرى سترى 5 المقالات والبحوث الأخيرة التي استخدمت GeneMANIA من بيوميد الوسطى كتالوج من المجلات البحثية. وسيكون هذا مفيدا للمستخدمين للحصول على فكرة عن أي نوع من البيانات لديها الموارد والبحوث التي تتم باستخدام الموارد. هذا سيكون مفيدا أيضا للعثور على الموارد الأخرى التي قد تكون مفيدة (وكثيرا ما تكون مصدرا المذكورة ذات الصلة بالتعاون مع المورد من الفائدة).

هذه هي بداية لسلسلة من الميزات الجديدة ونأمل أن تضيف إلى صفحات مقصودة من شأنها أن تعزز من قدرة الباحثين على معرفة كل ما يمكن حول البيانات والأدوات المتاحة لهم. سنكون إضافة “نصائح الفيديو الأخيرة” وأكثر من ذلك القسم.

و, إذا كنت ناشرا للأدب البحث وترغب في الحصول على "قائمة البحوث التي أجريت مؤخرا’ مثل هذا الهبوط على صفحات المجلات لدينا الخاص (سوف تحتاج إلى الوصول إلى النص الكامل للمقالات), يرجى الاتصال بنا وكنا نحب أن نعمل معكم على أن تفعل ذلك لصالح عدد من المجلات الخاصة بك, الموارد, الباحثون ونعم, OpenHelix :).

في جهودنا المستمرة للحفاظ على وتوسيع نشاطنا قاعدة بيانات محرك البحث و, لدينا برامج تعليمية, لدينا بلوق وأكثر, ستلاحظ أيضا لدينا وأضاف الإعلان على الموقع. الإعلانات هي لافتة إعلانية الأعلى, إعلان ناطحة سحاب الجانبية وإعلان صغير على صفحات مقصودة التعليمي. يرجى النظر في عرض هذه الراعية إذا كانت تهمك. وسوف لا يكون على إعلانات الدروس برعاية مثل UCSC متصفح الجينوم و الناتج المحلي الإجمالي, و آخرون, كما أنها لن تكون مرئية من أي المشتركين في النشرة المصورة من الدروس.

إذا كنت ترغب في رعاية البرنامج التعليمي بحيث يكون متاحا للجمهور, سواء كنت المطور من أداة أو شركة, يرجى الاتصال بنا عن فرصة للحصول على التدريب والتوعية لعدد كبير من الباحثين.

أيضا, وإن لدينا عشرات الدروس التي ترعاها متاحة للجمهور, نحن لا يملك الكتالوج كبيرة من أكثر من 90 الدروس الإضافية المتاحة للاكتتاب. يمكنك قubscribe الوصول إلى هذه كفرد, الدائرة أو المؤسسة.

 

نصيحة الأسبوع: SciVee, يو تيوب العلم

كل أسبوع نقوم به تلميح فيديو الأسبوع. كل أسبوع نستخدمها SciVee لتحميل وتبادل هذا الفيديو (لدينا حساب هنا). لدينا الآن ما يقرب من 50 نصائح والفيديو المقيمة في SciVee. وقد دعا SciVee يو تيوب العلم. مثل يوتيوب, انها تسمح لك لتحميل أشرطة الفيديو, وإن كان في هذه الحالة تتعلق حصرا العلم. بالإضافة إلى ذلك على الرغم, SciVee يسمح لك أن تفعل بعض 'العلم الخاصة’ الإجراءات انك لن تكون قادرة على القيام مع YouTube أو فيميو. PubCasts و PosterCasts وهما من ميزات عدة مثل (Papercasts تتشابه Pubcasts, فقط غير المنشورة ورقات). هذه الميزات تسمح لك لتحميل الفيديو الخاص بك ، واصفا البحوث ثم إيداع ورقة وملصق ومزامنة ورقة أو ملصق على الفيديو. هذا يتيح للكاتب أن يصف ورقة (أو ملصق) والأبحاث في حين يمكن للمشاهد انظر المقاطع ذات الصلة من ورقة أو ملصق. هناك مزيد من المعلومات حول كيفية القيام بذلك هنا. دورة ملصق الظاهري, أو الحديث الظاهرية. كنت تفعل ذلك مرة واحدة, يمكنك تضمين الفيديو على موقع آخر على شبكة الإنترنت (كما نفعل نحن هنا!) لتبادل والسماح للآخرين للمشاركة. انها أداة ممتازة لتبادل البحوث الخاصة بك والحصول على جمهور أوسع.

نصيحة اليوم من الأسبوع هو مقدمة قصيرة لSciVee وتعليمي سريع على تحميل أشرطة الفيديو الخاصة بك.

في نهاية سترى لدينا في المجتمع ودعا SciVee “الجينوميات تدريب الموارد.” هناك سترى كل النصائح من الأسبوع فعلناه. وبالإضافة إلى ذلك, نضيف الجينوميات الأخرى والموارد البيولوجية أدوات وقواعد بيانات للمجتمع عندما نجدهم. تحقق من والانضمام إلى المجتمع:

Visit Genomics Resource Training Community

ميزة جديدة بيوميد الوسطى

يوجه اليكم من OpenHelix ووسط بيوميد :D. نود حقا ميزة والفكرة (بالطبع) الفكر وكنا ينقلونه.

بيوميد الوسطى (BMC) هو ناشر الوصول المفتوح. أطلقت BMC مع OpenHelix a ميزة جديدة في الآونة الأخيرة لاعطاء القراء من الوصول في الوقت المناسب لBMC المجلات ذات الصلة الدروس الموارد الجينومية. عند قراءة مقال في BMC, وتقدم الباحثون الآن صلات البرامج التعليمية عبر الإنترنت للعديد من الموارد الجينوميات والأدوات المستخدمة أو استشهد في المقالة. الرابط يأخذ القارئ مباشرة إلى الصفحة المقصودة التدريب على موقع OpenHelix. BMC لديها تشكيلة كبيرة من جودة عالية وصول فتح المجلات البحثية وذكرت الكثير من البحوث ويستشهد اليوم يستخدم الكثير من الموارد على القطارات OpenHelix. يمكن للباحثين الآن العثور بسرعة على التدريب على قواعد البيانات والأدوات المستخدمة في البحث. مثلا, هذه المادة الأخيرة , Genomewide توصيف غير مذيل بعديد الأدينيلات الرناوات, في لBMC الجينوم علم الأحياء ويستشهد العديد من الأدوات المستخدمة في أبحاثهم بما في ذلك GEO, EVEN وغيرها. ميزة جديدة يجد هذه الاستشهادات في المقالة ويسرد ارتباطات الدروس OpenHelix على تلك الموارد كما رأينا في الصورة.

يمكن أن يكون من الصعب العثور على وصلة سريعة للموارد ذات الصلة في ورقات–الاستشهادات في بعض الأحيان غير مكتملة, أو لا ترتبط إلى موقع.

لدينا خطط لتوسيع هذه الميزة في عدة طرق لجعل التدريب على الموارد ذات الصلة وأهمية علم الجينوم أبسط وأسرع للباحثين.

تذوقنا بالفعل بعض ردود فعل كبيرة في هذا–فكرة رائعة!

بالدوينjytricker فكرة رائعة! بالدوينBioMedCentral / OpenHelix سوف JV مدرب العلماء على علم الجينوم / أدوات المعلوماتية الحيوية المذكورة في ورقات http://ow.ly/4eQbG

 

باد التطبيق لجزيئات المتحركة

وجدت هذه من خدمة يوم الجمعة, باد يتيح العلماء اسحب, قرصة ومرر الجزيئات ريال . انها التطبيق الذي يسمح للعلماء لمعالجة الجزيئات مع منتاش الضوئية باستخدام جهاز آي باد باعتباره واجهة. رائعة جدا التطبيق والفيديو المثير للاهتمام.

حصلت لي في التفكير, كيف يمكن لكمبيوتر وقرص يمكن استخدامها في العلوم البيولوجية (مقاعد البدلاء أو غيره)? كتبت عن تطبيقات آي فون قبل.

لدي باد, ويمكنني استخدامه الكثير لقراءة الأخبار, قراءة الكتب, اللحاق على البريد الإلكتروني, مشاهدة الأفلام. أجد أنه من المحتمل أكثر من ذلك بكثير على الرغم من فضول ما أقوم به لأنه.

هناك بعض الأبحاث ذات الصلة بيولوجيا كبيرا يمكنني استخدام تطبيقات. يمكنني استخدام أوراق (فتح اي تيونز) لقراءة والتعليق الأوراق البحثية, ولدي طبيعة و بلوس القارئ تطبيقات, لكنه يشعر لي أن يكون للمطورين الملغومة فقط على سطح ما يمكن القيام به مع لوحة تعمل باللمس محمول (سواء كان ذلك باد أو لائحة أو…). أو على الأقل ما يبدو يجب أن تتمكن من القيام على أساس نجمة أفلام تريك :D.

ويمكنني أن نرى التطبيق لحفظ كتاب المختبر (هناك تطبيقات المحمولة, ولكن أريد شيئا الموجهة نحو تلاحظ المختبر. ويمكنني أن نرى التطبيق لمعالجة التحالفات تسلسل متعددة (نوع من مثل JalView) أو حتى لعبة مثل طيها في باد لتسلسل متعددة محاذاة. في الواقع, لماذا لا طيها على باد أو قرص. اعتقد انه يمكن الاطلاع على متصفح الجينوم UCSC باستخدام مستعرض على جهاز آي باد, يمكن أن أرى ما يصل suped GenomePad للقرص. ماذا عن التطبيق a الجينوم الشخصية?

لديك أي أفكار أو التطبيقات التي تستخدمها لأغراض بحثية أو تود أن ترى?

استعراض الأقران مرة أخرى…

مجرد تعليق سريع جمعت من وجود صلة وأظهرت ماري لي. لقد كان انس تشغيل بلدي مع المراجعين من ورقات والمنح. بعض المراجعين بالتأكيد جدول أعمال و, كما البشر, كل المراجعات والتحيزات الذاتية. أستطيع أن أقول لك قصص. لكن, بالنسبة للجزء الاكبر, حتى في ضوء بعض الإحباطات ضخمة, جعلت من عملية الاستعراض بحثي ورقات العلم أفضل وأكثر إحكاما.

استعراض الأقران لا يخلو من المشاكل انها, هناك بلوق كامل (مثل الند للند) والمجتمعات مناقشته. وبطبيعة الحال, يتم نشر الكثير من الأبحاث دون المستوى, كما يتضح من possiblty صecent مناقشة الورقة البكتيريا الآكلة للزرنيخ. لقد قرأت بلدي حصة البحوث سيئة حقا واستنتاجات زائفة من المجلات. ولكن مرة أخرى, فمن مجموع - الإجمالية للنظام استعراض الأقران (والمناقشة اللاحقة, مزيد من البحوث, الطعن المنشورات) وقد خلق هذا العلم الواضح ممتازة والنهوض من فهمنا للبيولوجيا حتى الآن.

طبيعة Precedings ليس بديلا استعراض الأقران, انها مكان لوضع البحوث قبل نشرها نظير استعرض يدعو إلى إجراء مناقشة, تشجيع مزيد من البحوث وأولوية المطالبة. ولكن رأيت وأشار إلى أنه على أنها جزء من بديل. حتى الآن, انها مثل هذه الأوراق (واثنين آخرين من نفس المؤلف) التي تجعلني أدرك أن استعراض الأقران هو العذاب اللازمة. أنا لن تمضية الوقت نزع أحشائها القضايا من هذا البحث, انهم الفيلق وانها لا تستحق وقتي. يمكنني ان اتصور القارئ عارضة من Precedings الطبيعة قد يأتي عبرها ورؤية جميع biolingo واعتقد انه من البحوث الشرعية, ولكن في الحقيقة لا يهمني. لكن, كاتب هذه المقالات يستخدمها لاضفاء الشرعية على أطروحته الرئيسية: “بيانات الجينوم كاذبة تثبت نظرية التطور.” يفعل ذلك في بيان صحفي (المتشعب: //www.prweb.com/releases/theory/genome/prweb4896744.htm .. أنا لن تصل حتى لا تعطي هذه الشرعية على شبكة الإنترنت أكثر من أي, ولكن يمكنك أن تأخذ مساحة ما إذا كنت ترغب في رؤيته) حيث صلات الثلاثة “المنشورات”:

باستخدام علم الجينوم الحديثة, الدكتور. Senapathy وعمل فريقه, وأظهرت كيف أن وفرة وتنوع الحياة على الأرض مباشرة نشأت في بيئة بربيوتيك. وقدموا النتائج في ثلاثة منشورات علمية في الطبيعة Precedings: منشور 1, منشور 2, منشور 3.

تظهر الأبحاث الحديثة أن البيانات الجينوم بالكامل تقتلع نموذج التطور.

إنه يستخدم الاحترام عن جدارة لهذه العلامة التجارية “طبيعة” وخفة اليد لدعوتهم “المنشورات” (بينما كل ما يطبع من قبل مع أي استعراض الأقران أو استعراض للعلوم) لاضفاء الشرعية على استنتاج المزيفة.

مع كل وو "إن’ في هذا العالم, وأظن أن مراجعة النظراء أو أي حل آخر دقيقة (وأنا لم أر بعد) هو أكثر ضرورة من أي وقت مضى للتحرك إلى الأمام العلم.

تحرير بواسطة مريم: كنت أشاهد سوى بعض الصحفيين اكتشاف هذه القصة على MuckRack (المتشعب://muckrack.com / الخيال العلمي ) وهنا ما قالوه:

نصيحة الأسبوع: خادم BioExtract

و خادم BioExtract هو الأداة التي تسمح للباحث للبحث والوصول إلى البيانات, تحليل هذه البيانات وتخزين البيانات وثم إنشاء مسارات من التحليل. في هذا الصدد انها تشبه الى حد بعيد المجرة. وقد وضعت من قبل اثنين من الجماعات BioExtract (Brendel و Lushbough) في ولاية ايوا وجامعة ولاية ساوث داكوتا, على التوالي.

تلميح اليوم في مقدمة سريعة لBioExtract. إذا كنت قد استخدمت من قبل * غالاكسي, ستلاحظ على الفور اختلافات في التنفيذ, سهولة الاستخدام والمجتمع. كلا من مهام سير العمل. أود تنفيذ غالاكسي لأفضل Bioextract تاريخها ويبدو أن التركيز على علم الجينوم المقارن أكثر. وكلا BioExtract غالاكسي هي (أو سيتم) جزء من MyExperiment, موقع للبحث, استخدام وتقاسم العمل وغيرها “البحث الكائنات.”

في تلميح اليوم انا إعطاء مقدمة أساسية, لديهم معلومات جيدة حول كيفية القيام بذلك العمل, وأنا لا تذهب الى, هنا (أكثر مساعدة هنا).

*(إفشاء: لا OpenHelix التدريب والتوعية لغالاكسي)

نصيحة الأسبوع: صفحات المجرة

غيض من هذا الاسبوع هو مقدمة موجزة إلى صفحات غالاكسي. هذه هي صفحات خاصة التي يمكن للمستخدمين خلق داخل المجرة نظام لتعليم, وصف وشرح مختلف التحليلات القيام به غالاكسي. المستخدم لديه قدرات كثيرة لربط وتضمين تاريخها, العمل جنبا إلى جنب مع قواعد البيانات واستخدام النصوص والصور والمزيد من الجهود لتعليم بالكامل تحليلات. كما هو موضح في الأسبوع الماضي, هذه هي واحدة من العديد من الإضافات غالاكسي قد أضاف إلى زيادة الشفافية واستنساخ للبحوث الجينوم.

العلم المغربية

جامعة الأخوين, إفران المغرب

الأسبوع الماضي كنت وحضر ورشة عمل للتدريس في الجمعية الأمريكية المغربية لعلوم الحياة (Biomatec للولايات المتحدة) في ورشة عمل على الصعيد الدولي والاجتماع السنوي 2 9, إفران في المغرب.

أنا أعجبت بدقة. أعجب مع المغرب, العلماء المغاربة والطلاب المغاربة. لقد أتيحت لي الفرصة للتفاعل مع كل ثلاثة. الاولى من هذا الطلاب. تعلمت ثلاث ورش عمل, بما في ذلك جولة في الموارد الجينومية واثنين كيف لللمتصفح الجينوم UCSC والجدول المستعرض. وقد وردت بحماس جميع. بل أكثر من ذلك أعجبت أظهرت حماسة هؤلاء الطلاب للبحوث الجينوم وبيوينفورمتيك. وبعد كل نقاش في وقت لاحق اليوم, وقد انهالت أنا مع الأسئلة والطلبات (الذي أحبه). حماسهم للعلوم يطابق أو يتجاوز أي مجموعة أخرى من طلاب العلوم قابلتهم في بلدي 20+ الوظيفي العام في البيولوجيا. بالإضافة إلى ذلك, التقيت العديد من الطلاب الذين كنت قادرا على مناقشة أبحاثهم مع قليلا.

أيضا, وكنت قادرا على مناقشة البحوث في المغرب مع العلماء المغاربة عدة رسمية وحضور مناقشة مائدة مستديرة حول تعزيز العلم المغربي, البيولوجي على وجه التحديد والبحوث المعلوماتية الحيوية. العلماء المغاربة, داخل وخارج المغرب, وابحاثا worldclass, بما في ذلك بلدي المضيف طبعا. والأبحاث التي أجريت في المغرب والشتات المغربية’ من العلماء (كان هناك علماء من الولايات المتحدة المغربية, أوروبا والشرق الأوسط هناك), يبدو أن الشبكة قد حان أن, جنبا إلى جنب مع حماس الطلاب, هو كبير من الموارد لهذه الأمة.

إذا كان مستوى الحماس البحوث والباحثين والطلاب وأي إشارة, وسوف يكون العلم المغربي تخطو خطوات كبيرة في السنوات المقبلة. بالطبع, هذا ليس شيئا جديدا أنا متأكد, جديد عادل بالنسبة لي :D.

تعلمت (نعي) شيئين في هذه الرحلة. العالم صغير جدا, وكبيرة جدا. التقيت مع العديد من الاشخاص الذين عبروا أعطيه المسارات قبل أو مع الذين كان لدينا أصدقاء مشتركون. كان هناك عالم المغاربة الذين التقيت بهم في ألمانيا لفترة وجيزة في حين تقوم هناك مرحلة ما بعد الدكتوراه والطلاب المغاربة الذين عرفوا شخص أعرفه من قطر. وقد طلب مني أن أتحدث بإيجاز ومناقشات المائدة المستديرة وذكرتها قبل الظاهري المؤتمر الأفريقي كنت قد قدمت في ورشة عمل, وأعتقد بأنه كان هناك محور المغربي في هذا المؤتمر. المؤكد, وكان واحدا من العلماء في ورشة عمل بلدي وحضر المناقشة (وكانت الكلمات الطيبة لأنها :D). موافق, قد تقولون, هذا هو العالم '’ العلم. جيد, حصلت عليه حتى لامرأة التقيت في الفندق الذي كان على منحة فولبرايت ابحاثا على الموسيقى البربرية والعربية… والرجل الذي قدم لي مطية من المؤتمر مساء أمس, الذي حدث لمجرد أن يكون لها المغربي المشرف.

وإنه عالم كبير مع الكثير لاكتشاف والرعب نفسي منهكا أحيانا (نادرا, ولكن يمكن أن أكون هناك). لم أكن قد سمعت من أركان النفط قبل,

شارع & المحلات التجارية في المدينة القديمة في فاس, مغربي

تنتج عادة من البذور التي تم جمعها من براز الماعز (اليوم أكثر عرضة جمعها ومعالجتها بواسطة الأساليب الأكثر حداثة :), أو حتى النظر بجولة في المدينة القديمة في فاس السحرية (الذي لا بد لي من العودة). لم يكن لدي أي فكرة عن وجود جامعة الأخوين في إفران, مدرسة صغيرة ليبرالية في الفنون بارد (يثلج) جبال المغرب في إفران (لماذا أريد أن الاستمرار في الكتابة كما أن إفران :D? ). الحرم الجامعي الجميل.

الشيء الآخر الذي جاء إلى الذهن بينما كان يحضر هذا المؤتمر والتحدث مع العلماء المغاربة هو احتمال (والواقع دون أن يلاحظها أحد) من الإمكانيات البحثية خارج مثلث الولايات المتحدة وأوروبا واليابان. بالطبع الهند والصين تنتج البحوث الكبرى أكثر وأكثر على مر السنين, ولكن هناك أخرى 100 أو حتى دول أخرى هناك مليار شخص مع عدد قليل مع إمكانات ضخمة. بالطبع لقد أنتجت هذه البلدان الصغيرة دائما العلماء عظيم, 'ولكن كنت بدأت أعتقد أن علم الجينوم والمعلوماتية الحيوية هو بداية لمساعدة البلدان الصغيرة القفز’ البحوث البيولوجية بقدر تكنولوجيا الهاتف الخليوي سمح لبعض البلدان النامية على "القفز’ من خطوط الهاتف التقليدية (غالية, من الصعب القيام به) لاسلكية (أقل كلفة). وقد تكون الأبحاث البيولوجية تقليديا المورد مكثفة: مختبرات, أكبر الجامعات, معدات. المعلوماتية الحيوية والأبحاث الجينوميات, على الرغم من أنها لا زالت تحتاج البنية التحتية, لديه أدنى حاجز دخول أعتقد. قدم لي تعليق في حديثي, “ليس هناك نقص في البيانات,” وهذا صحيح. كمية البيانات المتاحة للتحليل مذهل. عدد من الأدوات المتاحة للجمهور وقواعد البيانات الساحقة. المرء لا يجب أن نفعل “العلم الكبير” في الجينوميات (رغم أن هناك يقين من أن) القيام على مستوى عالمي البحوث. وثار الذهب البحوث في بيانات لهم ثار التلال (نعتذر عن أي إشارة إلى كاليفورنيا الذهب الاندفاع, أنا _do_ يعيشون في ما كان المركز من كل ذلك). الذهب الذي يمكن استخراجه من قبل أي فرد, معمل أو الأمة مع شيء من التعليم والحماس.

وآمل في العودة العام المقبل لمؤتمر المغرب وسنوات القادمة. لدي الكثير لنتعلمه أكثر :D. وربما يمكن أن أقوم بتدريس قليلا جدا.