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Consejo del la Semana: Modelo de tutorías organismo de base de datos

gbrowsePor la punta de la semana actual, nos gustaría señalar una serie de nuevas (libre para) tutoriales sobre los recursos modelo de base de datos de organismo. Estos siete tutoriales (incluye un tutorial en flash de películas, diapositivas para descargar, ejercicios y apuntes) fueron financiados en parte por una subvención del NHGRI. Acabamos de poner un Comunicado de prensa sobre este, pero pensé que el Consejo de la semana sería un gran lugar para presentar a estos tutoriales. Nosotros tienen siete tutoriales que son (o pronto lo estará) a disposición del público (Este enlace le llevará a una lista y enlaces a todos estos tutoriales). Los primeros cuatro son disponibles en GBrowse, WormBase, RGD (Base de datos del genoma de rata) y MGI (Genoma del ratón Informática. GBrowse (el tutorial relacionado con este), fue desarrollado por la Base de Datos de organismo modelo genérico (GMOD) proyecto y es una gran herramienta para desarrollar navegadores genoma para el modelo y los organismos de investigación. Muchas bases de datos de organismos modelo de uso de recursos GMOD total o parcialmente, incluyendo muchos de los que tenemos aquí en tutoriales. Otros tres se viene muy pronto en Danza (Pez cebra), FlyBase (Drosophila) y SGD (levadura). Échales un vistazo :).

Consejo del la Semana: GViewer de RGD

Esta semana ha estado muy ocupado aquí en OpenHelix y los EE.UU.. Para la punta de esta semana, como lo hacemos de vez en cuando, Voy a destacar un consejo breve tutorial hecho por otra persona. Esta semana es un hecho por los desarrolladores de RGD y mostrando los usos de la GViewer. Este tutorial se encuentra en SciVee, como dice la descripción:

El genoma de la rata vuelve a la vida mediante el uso de la herramienta Gviewer. Este video le mostrará cómo utilizar esta útil herramienta en el sitio web de RGD en http://rgd.mcw.edu /. Genes, QTL, syntenies y especies de interés pueden ser visualizados con facilidad como el zoom Gviewer y navega a través del genoma de la rata con unos pocos clics.

caMOD 2.4 publicado

Acabo de recibir un aviso sobre una nueva versión de la caMOD Modelos de Cáncer de base de datos. Este recurso basado en la web contiene información acerca de ratón, rata, y otros modelos animales relacionados con la investigación del cáncer. También se integra con muchos otros recursos útiles de datos.

Desde su descripción:

Recuperar la información sobre la fabricación de los modelos, su descripción genética, histopatología, líneas celulares derivadas, imágenes asociadas, agentes cancerígenos, y los ensayos terapéuticos. Los enlaces a publicaciones y otros recursos asociados se proporcionan.

Si usted es un investigador en este campo también se puede presentar este tipo de información.

La nuevas características de esta versión son:

  • La integración de caMOD con caELMIR
  • Los cambios del modelo de objetos como resultado de la revisión VCDE
  • El cumplimiento de los requisitos NCICB pila de tecnología

caELMIR es un sistema de gestión de datos para los datos preclínicos experimentales. Se trata de un LIMS, o, más específicamente un ELIMS, de Electronic LLABORATORIO Ennformación AbT.lGESTIÓN Sistema. Esto está fuera del alcance de nuestra cobertura actual de los recursos, pero algunas personas la búsqueda de este blog puede resultar útil.