Tag Archives: la médecine personnalisée

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SNPpets vendredi

This week I left the “call to action” tweet at the top–you could vote for GenBank every day until the end of the competition. Today’s the last day. Vote once more. And remember how resources like GenBank let us have foundations for other important resources as well. There are new resources in this week’s SNPpets that are definitely descendants of GenBank. Aussi, more tit-for-tat on the Venter paper privacy issue drama. A very personal genome story from a personal genome researcher. Makes you think about the policy issues in new ways. Aussi, policy on gene editing in plants. The first species to have every members’ les données du génome. Gene counts via RNAseq in a new resource, and a new cancer gene repository.


SNPpets_2Bienvenue à notre collection vendredi lien fonction: SNPpets. Au cours de la semaine, nous avons rencontré beaucoup de liens et de lectures qui nous paraissent intéressants, mais ne pas se rendre à un billet de blog. Ici, ils sont pour votre plaisir…


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This week I left the “call to action” tweet at the top–you can vote for GenBank every day in August. The cut is coming soon, so go vote again. In other news this week, a story about big data for assessing biodiversity across time and space. And a Big Photo. Whole-genome sequencing in primary care–not ready yet. #CRISPR ethics–not ready yet. Animal breeding, plant bioinformatics, and horizontal gene transfer round out the week.


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https://twitter.com/FloridaMuseum/status/898293371814330368

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This week I left the “call to action” tweet at the top–you can vote for GenBank every day. But the other tweets are new this week. Première, don’t fall for the fake grant scam. A catalog of museum samples (I love the data from sequencing projects using those), genotyping arrays vs. sequencing debate and a lot of new data that’s been released, fungi and E. coli des données, a terrible DNA joke, and a terrible use of DNA testing to see how white a White Nationalist is.


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https://twitter.com/surt_lab/status/897187105495019520

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Cette semaine, il y a un appel à l'action réelle dans les tweets,,en,Voir tweet de Steven Salzberg sur le,,en,Service d'accorder l'Amérique et GenBank est nommé,,en,vous pouvez voter tous les jours,,en,Le reste des tweets intrigantes de la semaine comprennent la diversité des levures,,en,diversité historique britannique,,en,aspects réglementaires non codantes,,en,les pirates de l'ADN codant pour ordinateur,,en,et l'établissement de normes pour information,,en. See Steven Salzberg’s tweet about the 2017 Service to America award and GenBank is nominated–you can vote every day! The rest of the week’s intriguing tweets include yeast diversity, British historical diversity, non-coding regulatory stuff, computer-coding DNA hackers, and setting standards for information of uncultured samples of organisms and for personal data.


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Cette semaine, il y a un appel à l'action réelle dans les tweets,,en,Voir tweet de Steven Salzberg sur le,,en,Service d'accorder l'Amérique et GenBank est nommé,,en,vous pouvez voter tous les jours,,en,Le reste des tweets intrigantes de la semaine comprennent la diversité des levures,,en,diversité historique britannique,,en,aspects réglementaires non codantes,,en,les pirates de l'ADN codant pour ordinateur,,en,et l'établissement de normes pour information,,en. See Steven Salzberg’s tweet about the 2017 Service d'accorder l'Amérique,,en,Vous pouvez voter pour GenBank,,en,essayez d'imaginer les deux dernières décennies sans elle,,en,Et il est temps de célébrer la science du gouvernement devant le public,,en,aller voter,,en,revenir pour le fromage et le génome pomegranite,,en,bavardage le plus intriguant cette semaine était l'ancienne substance du génome de la plante au fond,,en,Je continue à essayer de dire aux gens à quel point l'agriculture est avant dans les applications de la génomique,,en,chercheurs humains,,en,ZZZZzzzzzzzzz,,en,GenBank a été l'un des plus grands succès et utile,,en,Un énorme projet vise à séquencer,,en,génomes de plantes dans,,en,Nous devons parler de génie génétique via,,en,@Commentaire,,en,intelligence Squared,,en,IQ2US,,uz,travaille sur un moyen de visualiser,,en,les modifications effectuées via,,en,ggjoy,,no,et alignements par paires,,en. You can vote for Genbank. Vraiment–try to imagine the last couple of decades without it. And it’s time to celebrate government science in front of the public. Go vote. Après que les, come back for the cheese and pomegranite genome. Most intriguing chatter this week was the ancient plant genome stuff at the bottom. I keep trying to tell people how far ahead agriculture is in genomics applications. Human researchers: ZZZZzzzzzzzzz.


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I stayed up late last night to see if I’d have health care this morning, and I got off schedule. But off we go–still insured!

This Friday includes the first ever tardigrade protein structure! It’s bigger on the inside–wait, dans, wrong thing. Human wise, we have recreational genomics apps, and we have recreational genomics consequences. Epigenetic shampoo (sérieux). Students and biotechnology issues, how are they thinking about the topics? Maize and Mars. Dead bovine DNA. Live cheese microbes. Hungry yet?


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This week I’m taking a different tack. There was something bothering me about misuse of genomics, et je vais râler sur ce,en. Recently a friend pointed me to something that I hadn’t seen before: cranks are misusing 23andMe-type of data to “diagnose” kids as being likely to suffer “vaccine injury”. As you might recognize from the dog-whistle, this means that anti-vaccine cranks are taking their message to a new front: génomique personnalisée. They are misusing data to convince parents that vaccinating their kids is dangerous.

This is a very, very disturbing direction as vaccine fears already have led to tragic outcomes as kids get vaccine-preventable diseases at increasing rates.

En outre, cranks are coming together around “la médecine personnalisée” to pitch their terrible ideas to people and sell them “detox” potions and supplements. They are out talking to the public on these things. We need to step up our game and get people better information. Il y aura de graves conséquences,,en,il est très clair qu'ils tirer ces conclusions,,en,il est plus subtile comme cette conférence,,en,Il y a beaucoup de pseudoscience étant donné une plate-forme à l'événement,,en–misuse of genomics on many topics–with the potential for public health outcomes.

So below are a few links to illustrate this. It’s time to raise awareness of this in the legit genomics community. I expect others didn’t know this was going on, trop.


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This week there was some mainstream communication on genomics as well. I’m not sure it helped. Soupir.

 

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This Friday includes a range of topics, as usual. Interesting assessments of the state of autism genomic architecture–and read the piece on the “ghettoization” of genetic disease after that (Laura Hercher’s tweet). Horizontal gene transfer in cheese bacteria. Traits in crops. CRISPR for insects. Deep time in human DNA, and evolutionary history of tumors. There are so many great things around right now…. C'est parti!


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Cette semaine a été grande sur des choses de #CRISPR,,en,Ce drame sur les modifications hors cible,,en,et le refoulement,,en,consommation d'oxygène,,en,Mais il y a beaucoup des choses d'habitude trop,,en,médecine personnalisée marche sur,,en,DTC problèmes de tests génétiques,,en,nouveaux échantillons provenant de sources anciennes,,en,Meilleure chose,,en,le script pour convertir fastq à emojis,,en,Je pars la semaine prochaine parce que je serai sur la route sans beaucoup de chance de capturer les tweets avec mon filet à papillon,,en,Pheno4J,,zu,Un gène à la base de données Phénotype Graphique,,en,Vous cherchez à exploiter la puissance de,,en,Commencez à,,en,BTCon17,,gl,= Idée brillante,,en,Twitter conférence via,,en,@biotweeps,,en,organisé par,,en,@thonoir,,fr,@KJames_IntBio,,da,@drmikeographer,,lb,Morgan Jackson,,fr,@BioInFocus,,en,GRANDE pièce par,,en,@caulfield,,en,sur les tests génétiques DTC,,en,la qualité scientifique de terrible à ok,,en,valeur pratique,,en,à presque,,en,Clair,,en. That drama about the off-target alterations, and the pushback, consumed much oxygen. But there’s plenty of the usual stuff too–un nouveau logiciel, personalized medicine marches on, DTC genetic testing issues, new samples from ancient sources. Best thing: the script to convert fastq to emojis.

Oh–I’m off next week because I’ll be on the road without much chance to capture the tweets with my butterfly net.


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Cette semaine comprend une de ces histoires qui me rappelle la puissance des bases de données,,en,Voir qu'Odyssey diagnostic d'une famille avec un enfant présentant des symptômes de mystère et le médecin qui sleuthed quelques informations,,en,puis connecté à d'autres familles en attente de réponses,,en,Hudson Alpha tweet,,fr,Mais il y a aussi les problèmes qui se profilent d'une mauvaise utilisation de l'information,,en,deux tweets sur cette semaine,,en,autres outils,,en,plus de génomes,,en,Plantes sauvages,,en,virus sauvages,,en,ancêtres sauvages,,en,composants graphiques Reactome sont populaires,,en,si vous les faites,,en,les gens vont les utiliser,,en,Anti-Trump science Manifestants finalement publié leurs estimations de foule soigneusement vérifié Fact-,,en,pic.twitter.com/wX21VKR5XQ,,en,Mother Jones,,en,@MotherJones,,en,Le mouton est étrange que baffles scientifiques,,en,@Digg,,en,Rachel Feltman,,en,@RachelFeltman,,en,QTLtools de,,en,laboratoire publié,,en,logiciels essentiels,,en,Ceci est pour * QTL ce que Plink était pour GWAS,,en. See that diagnostic odyssey of a family with a child with mystery symptoms and the doctor who sleuthed out some information–then connected with other families awaiting answers (Hudson Alpha tweet). But then there’s also the looming issues of misuse of information, two tweets on that this week. More tools. More genomes. Wild plants, wild viruses, wild ancestors. Reactome graphical components are popular–if you make them, people will use them.


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https://twitter.com/genetics_blog/status/867075369643511809A