Tag Archives: personalisierten Medizin

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Freitag SNPpets

This week I left the “call to action” tweet at the top–you could vote for GenBank every day until the end of the competition. Heute ist der letzte Tag,,en,Abstimmen erneut,,en,Und merke dir,,en,Und denken Sie daran, wie Ressourcen wie GenBank uns Grundlagen für andere wichtige Ressourcen lassen und,,en,Es gibt neue Ressourcen in dieser SNPpets Woche, die auf jeden Fall sind,,en. Vote once more. And remember how resources like GenBank let us have foundations for other important resources as well. There are new resources in this week’s SNPpets that are definitely descendants of GenBank. Auch, more tit-for-tat on the Venter paper privacy issue drama. A very personal genome story from a personal genome researcher. Makes you think about the policy issues in new ways. Auch, policy on gene editing in plants. The first species to have every members’ Genom-Daten. Gene counts via RNAseq in a new resource, and a new cancer gene repository.


SNPpets_2Herzlich Willkommen auf unserer Friday Feature Linksammlung: SNPpets. Während der Woche kommen wir auf eine Vielzahl von Links und liest, dass wir denken, sind interessant, sondern machen es nicht zu einem Blog-Eintrag. Hier sind sie für Ihr Vergnügen…


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This week I left the “call to action” tweet at the top–Sie können jeden Tag in August zu GenBank abstimmen,,en,Der Schnitt wird in Kürze,,en,so gehen stimmen wieder,,en,In anderen,,en,In anderen Nachrichten in dieser Woche,,en,Eine Geschichte über große Datenmengen für die biologische Vielfalt in Zeit und Raum Beurteilung,,en,Und ein großes Foto,,en,Whole-Genom-Sequenzierung in der Grundversorgung,,en. The cut is coming soon, so go vote again. In other news this week, a story about big data for assessing biodiversity across time and space. And a Big Photo. Whole-genome sequencing in primary care–Noch nicht fertig,,en,CRISPR Ethik,,en,Tierzucht,,en,Pflanzen Bioinformatik,,en,und HGT die Woche abrunden,,en,twitter.com/FloridaMuseum/status/898293371814330368,,en,Noch früh Vorteile des ganzen erzählen,,en,Grundversorgung,,en,Studie fand heraus, vernachlässigbare Verbesserung,,en,pic.twitter.com/Kh2x2Xx2I5,,en,Matt Fisher,,fr,@Matt_R_Fisher,,en,EXCELLENT Stück,,en,@CookDeegan,,so,Jane Maienschein auf Notwendigkeit für Nicht-Experten über CRISPR Ethik zu sprechen,,en,Tierzucht und Genetik genetische,,en,Statistik Prinzipien, die verantwortlich Tierzucht ermöglichen,,en,@edxonline,,uz,Mooc,,cs,Alison Van Eenennaam,,en,@BioBeef,,nl,Core Facilities,,en,Horizontal Erworbene Gene sind oft zwischen eng verwandten Bakterienarten Gemeinsamer,,en. #CRISPR ethics–Noch nicht fertig,,en,CRISPR Ethik,,en,Tierzucht,,en,Pflanzen Bioinformatik,,en,und HGT die Woche abrunden,,en,twitter.com/FloridaMuseum/status/898293371814330368,,en,Noch früh Vorteile des ganzen erzählen,,en,Grundversorgung,,en,Studie fand heraus, vernachlässigbare Verbesserung,,en,pic.twitter.com/Kh2x2Xx2I5,,en,Matt Fisher,,fr,@Matt_R_Fisher,,en,EXCELLENT Stück,,en,@CookDeegan,,so,Jane Maienschein auf Notwendigkeit für Nicht-Experten über CRISPR Ethik zu sprechen,,en,Tierzucht und Genetik genetische,,en,Statistik Prinzipien, die verantwortlich Tierzucht ermöglichen,,en,@edxonline,,uz,Mooc,,cs,Alison Van Eenennaam,,en,@BioBeef,,nl,Core Facilities,,en,Horizontal Erworbene Gene sind oft zwischen eng verwandten Bakterienarten Gemeinsamer,,en. Animal breeding, plant bioinformatics, and horizontal gene transfer round out the week.


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This week I left the “call to action” tweet at the top–you can vote for GenBank every day. But the other tweets are new this week. Erste, don’t fall for the fake grant scam. A catalog of museum samples (I love the data from sequencing projects using those), genotyping arrays vs. sequencing debate and a lot of new data that’s been released, fungi and E. coli Daten, a terrible DNA joke, and a terrible use of DNA testing to see how white a White Nationalist is.


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https://twitter.com/surt_lab/status/897187105495019520

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Diese Woche gibt es einen tatsächlichen Aufruf zum Handeln in der Tweets,,en,wieder für den Käse und pomegranite Genom,,en,Faszinierendste Geschwätz war diese Woche das alte Pflanzengenom Material an der Unterseite,,en,Ich versuche den Leuten zu sagen, wie weit vor der Landwirtschaft in der Genomik-Anwendungen,,en,menschliche Forscher,,en,ZZZZzzzzzzzzz,,en,Ein massives neues Projekt zielt darauf ab, zu sequenzieren,,en,Pflanzengenome in,,en,Wir müssen über Gentechnik auf Diskussion über,,en,@Kommentar,,en,Intelligence Squared,,en,IQ2US,,uz,wurde auf eine Weise arbeiten zu visualisieren,,en,Bearbeitungen mit,,en,ggjoy,,no,und paarweise Alignments,,en. See Steven Salzberg’s tweet about the 2017 Service nach Amerika Auszeichnung und GenBank nominiert,,en,Sie können jeden Tag abstimmen,,en,Der Rest der interessanten Tweets der Woche umfassen Hefe Vielfalt,,en,Britische historische Vielfalt,,en,nicht-kodierenden regulatorischen Sachen,,en,Computer-kodierenden DNA-Hacker,,en,und Festlegung von Standards für Informationen,,en–you can vote every day! The rest of the week’s intriguing tweets include yeast diversity, British historical diversity, non-coding regulatory stuff, computer-coding DNA hackers, and setting standards for information of uncultured samples of organisms and for personal data.


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Diese Woche gibt es einen tatsächlichen Aufruf zum Handeln in der Tweets,,en,wieder für den Käse und pomegranite Genom,,en,Faszinierendste Geschwätz war diese Woche das alte Pflanzengenom Material an der Unterseite,,en,Ich versuche den Leuten zu sagen, wie weit vor der Landwirtschaft in der Genomik-Anwendungen,,en,menschliche Forscher,,en,ZZZZzzzzzzzzz,,en,Ein massives neues Projekt zielt darauf ab, zu sequenzieren,,en,Pflanzengenome in,,en,Wir müssen über Gentechnik auf Diskussion über,,en,@Kommentar,,en,Intelligence Squared,,en,IQ2US,,uz,wurde auf eine Weise arbeiten zu visualisieren,,en,Bearbeitungen mit,,en,ggjoy,,no,und paarweise Alignments,,en. See Steven Salzberg’s tweet about the 2017 Service to America award. You can vote for Genbank. Wirklich–try to imagine the last couple of decades without it. And it’s time to celebrate government science in front of the public. Go vote. Danach, come back for the cheese and pomegranite genome. Most intriguing chatter this week was the ancient plant genome stuff at the bottom. I keep trying to tell people how far ahead agriculture is in genomics applications. Human researchers: ZZZZzzzzzzzzz.


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I stayed up late last night to see if I’d have health care this morning, and I got off schedule. But off we go–still insured!

This Friday includes the first ever tardigrade protein structure! It’s bigger on the inside–wait, auf, wrong thing. Human wise, we have recreational genomics apps, and we have recreational genomics consequences. Epigenetic shampoo (ernst). Students and biotechnology issues, how are they thinking about the topics? Maize and Mars. Dead bovine DNA. Live cheese microbes. Hungry yet?


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Diese Woche nehme ich einen anderen Weg,,en,Es war etwas, das mich über den Missbrauch von Genomik stört,,en,und ich werde auf das schimpfen,,en,Kürzlich zeigte mir ein Freund zu etwas, das ich vorher nicht gesehen hatte,,,en,Kurbeln missbräuchlich 23andMe-Datentyp,,en,diagnostizieren,,en,Kinder als wahrscheinlich zu leiden,,en,Impfschaden,,en,Wie Sie aus der Hundepfeife könnten erkennen,,en,Dies bedeutet, dass anti-Impfstoff Kurbeln ihre Nachricht an eine neue Front einnehmen,,en,Sie sind missbräuchlich Daten Eltern davon zu überzeugen, dass ihre Kinder impfen gefährlich,,en,Das ist ein sehr,,en,sehr beunruhigende Richtung als Impfstoff Ängste bereits zu tragischen Ergebnissen geführt haben, wie Kinder durch Impfung vermeidbare Krankheiten bei steigenden Preisen erhalten,,en,Kurbeln kommen zusammen, um,,en,aufzuschlagen sie ihre schrecklichen Ideen, um Menschen und verkaufen,,en,detox,,en,Tränke und Ergänzungen,,en. There was something bothering me about misuse of genomics, and I’m going to rant on that. Recently a friend pointed me to something that I hadn’t seen before: cranks are misusing 23andMe-type of data to “diagnose” kids as being likely to suffer “vaccine injury”. As you might recognize from the dog-whistle, this means that anti-vaccine cranks are taking their message to a new front: personalisierte Genomik. They are misusing data to convince parents that vaccinating their kids is dangerous.

This is a very, very disturbing direction as vaccine fears already have led to tragic outcomes as kids get vaccine-preventable diseases at increasing rates.

Darüber hinaus, cranks are coming together around “personalisierten Medizin” to pitch their terrible ideas to people and sell them “detox” potions and supplements. Sie sprechen an die Öffentlichkeit über diese Dinge,,en,Wir müssen unser Spiel intensivieren und die Menschen bekommen eine bessere Information,,en,Es wird ernsthafte Konsequenzen,,en,Missbrauch von Genomik zu vielen Themen,,en,mit dem Potenzial für die öffentliche Gesundheit Ergebnisse,,en,So sind unter ein paar Links, dies zu veranschaulichen,,en,Es ist Zeit, das Bewusstsein für diese in der legit Genomik Gemeinde zu erhöhen,,en,Ich erwarte, dass andere nicht wussten dies vorging,,en,oftmals,,en,es ist ganz klar, dass sie diese Schlussfolgerungen sind Zeichnung,,en,Layla Katiraee,,ar,@BioChicaGMO,,fr,Aber manchmal,,en,es ist subtiler wie diese Konferenz,,en,Deshalb fordere ich,,en,zu überdenken diese Konferenz teilnehmen,,en,Es gibt eine Menge von Pseudowissenschaft eine Plattform auf der Veranstaltung gegeben wird,,en,In dieser Woche gibt es auf Genomik einig Mainstream-Kommunikation sowie,,en,Ich bin nicht sicher, ob es geholfen,,en,pic.twitter.com/zaBEWk86ox,,en,Nationale DNA-Tag,,en. We need to step up our game and get people better information. There will be serious consequences–misuse of genomics on many topics–with the potential for public health outcomes.

So below are a few links to illustrate this. It’s time to raise awareness of this in the legit genomics community. I expect others didn’t know this was going on, Auch.


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This week there was some mainstream communication on genomics as well. I’m not sure it helped. Seufzer.

 

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This Friday includes a range of topics, as usual. Interesting assessments of the state of autism genomic architecture–and read the piece on the “ghettoization” of genetic disease after that (Laura Hercher’s tweet). Horizontal gene transfer in cheese bacteria. Traits in crops. CRISPR for insects. Deep time in human DNA, and evolutionary history of tumors. There are so many great things around right now…. Los geht!


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Diese Woche war groß auf #CRISPR Sachen,,en,Das Drama über die Off-Target-Änderungen,,en,und die Push-Back,,en,verbraucht viel Sauerstoff,,en,Aber es gibt viele der üblichen Sachen zu,,en,personalisierte Medizin Märsche,,en,personalisierte Medizin marschiert,,en,DTC Gentests Fragen,,en,neue Proben aus alten Quellen,,en,Beste Sache,,en,das Skript zu konvertieren fastq zu Emojis,,en,Ich gehe nächste Woche, weil ich sein werde,,en. That drama about the off-target alterations, and the pushback, consumed much oxygen. But there’s plenty of the usual stuff too–neue Software, personalized medicine marches on, DTC genetic testing issues, new samples from ancient sources. Best thing: the script to convert fastq to emojis.

Oh–I’m off next week because I’ll be on the road without much chance to capture the tweets with my butterfly net.


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This week includes one of those stories that reminds me of the power of databases. See that diagnostic odyssey of a family with a child with mystery symptoms and the doctor who sleuthed out some information–then connected with other families awaiting answers (Hudson Alpha tweet). But then there’s also the looming issues of misuse of information, two tweets on that this week. More tools. More genomes. Wild plants, wild viruses, wild ancestors. Reactome graphical components are popular–if you make them, people will use them.


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https://twitter.com/genetics_blog/status/867075369643511809A