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금요일 SNPpets

이번 주 우리는 공연의 경제와 스포츠 팬들을 위해 DNA를 가지고,,en,바이러스 및 지질에 대한 새로운 소프트웨어 리소스,,en,암 게놈 논문의 편리한 수집,,en,진주 기장,,en,및 드 - 멸종,,en,나의 마음에 드는 이번 주에 읽어,,en,모기 유전자 드라이브 검토 종이이었다,,en,나는에 보드에 그렇게 생각 유전자 드라이브 것들을,,en,"당신의 DNA 가치는 얼마입니까,,en,"에 의해,,en,@mcgowankat,,en,공연 게놈 경제는 여기,,en,새로운 SIB 소개,,en,V-파이프 및,,en,SwissLipids,,en,pic.twitter.com/hLLuyy9RMJ,,en,의 최고 모음,,en,에서 연구,,en,@NatRevClinOncol,,fr,@NatureRevCancer,,en,pic.twitter.com/pvbDVA0LTU,,en,컴즈 생물학,,en,@CommsBio,,la,미래는 이해한다,,en,마이크로 바이 옴 심포지엄 스탠포드 생물 정보학에서,,en,pic.twitter.com/P5PM1fmSa9,,en,크리스토퍼 코뉴,,en,@cornue,,en,다음 달,,en,@DARPA,,en,@rwegrzyn,,pl,균형에,,en,생물 안전에 대한 우려 전진 "엔지니어링 진 안전,,en,pic.twitter.com/sc6b2cI45b,,en (?), new software resources for virus and lipids, a handy collection of cancer genomics papers, microbiomes, biosecurity, 양, pearl millet, and de-extinction. My favorite read this week, 그래도, was the mosquito and gene drive review paper. I am so on board to gene-drive those things….


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그리고 유전자 드라이브 모기를하려는 이유,,en,나는 모기의 일부 종은 허리케인 후 그들의 인구를 늘릴 수있는 방법을 이해,,en,하지만 이상,,en,하나 개의 함정에 조금 많이,,en,pic.twitter.com/U80muFylaA,,en,잭슨 모슬리,,fr,@ TheBugRoomNo2,,zu,유전자 드라이브,,en:

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이번 주 내가 왼쪽으로,,en,행동을 요구하다,,en,상단에 트윗,,en,당신은 매일의 GenBank 투표 수,,en,그러나 다른 트윗은 이번 주 새로운,,en,빠지지 않는다,,en,가짜 보조금 사기에 빠지지 않는다,,en,박물관 샘플 카탈로그,,en,나는 그를 사용하여 시퀀싱 프로젝트에서 데이터를 사랑,,en,유전자형 배열 대,,en,시퀀싱 토론과 많은,,en “call to action” tweet at the top–당신은 할 수,,en,대회가 끝날 때까지,,en,오늘 마지막 날,,en,한 번 더 투표,,en,그리고의 GenBank와 같은 자원은 우리뿐만 아니라 다른 중요한 자원에 대한 기초를 보자 어떻게 기억,,en,확실히의 GenBank의 후손이 주 SNPpets의 새로운 자원이 있습니다,,en,더 보복 벤터 종이의 개인 정보 보호 문제에 드라마에,,en,개인 게놈 연구에서 매우 개인 게놈 이야기,,en,당신이 새로운 방식으로 정책 문제에 대해 생각하게한다,,en,식물 유전자 편집에 대한 정책,,en,첫 번째 종은 모든 회원을 가지고,,en,새로운 자원의 RNAseq를 통해 진 컨츠,,en,새로운 암 유전자 저장소,,en,사람들이 어 서,,en,의 세계가 우리의 GenBank를 얼마나 사랑하는지 알려 보자,,en,그리고 그 나머지,,en,투표 유지,,en,너무,,en,록 스타 의료 사서 될 수있다,,en,@ lwu5,,xh,켜졌 어,,en,네덜란드 정부는 상식을 가지고,,en vote for GenBank every day until the end of the competition. On other fronts, there’s big media on Venter’s DNA re-identification article–but there’s also significant blowback on that. A series of tweets in there gets to that. Otherwise, 사용할 수있는 도구 주변의 게놈과 다른 종의 주위에 다른 멋진 것들을 더,,en,우리의 풀링 CRISPR 화면 디자인 도구 있음을 알려드립니다,,en,고정대,,en,지금 게시,,en,pic.twitter.com/q3AYw9gTUW,,en,네빌 샌자나,,en,@nevillesanjana,,en,twitter.com/david_a_knowles/status/905203427931602944,,en,모든 거위의 게놈에 걸쳐 측정 혼입이와 하이브리드의 게놈과 분화의 역사,,en,조류학,,en,pic.twitter.com/cxDPXg1ZAe,,en,Ornithomics,,en,@ornithomics,,en,전체 게놈을 사용하여 특성 예측에 의한 개인의 식별,,en,pic.twitter.com/JCKesjsAC2,,en,TeselaGen 생명 공학,,en,사실은이 논문에서 저자 해요 그리고 내가 HLI을 떠난 이유 중 하나였다,,en,'이의 여기 목표로하는 것은 정보 공유 방지하는 것이 었습니다,,en,제이슨 파이퍼,,en,@piper_jason,,en,생물학 게시를 재편 강연,,en,PNAS에 논문에서,,en,에 의해 정체를 폭로,,en,bioRxiv에서 이전,,en,twitter.com/clairemcwhite/status/905445932094939136,,en.


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은 https://twitter.com/david_a_knowles/status/905203427931602944

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이번 주 내가 왼쪽으로,,en,행동을 요구하다,,en,상단에 트윗,,en,당신은 매일의 GenBank 투표 수,,en,그러나 다른 트윗은 이번 주 새로운,,en,빠지지 않는다,,en,가짜 보조금 사기에 빠지지 않는다,,en,박물관 샘플 카탈로그,,en,나는 그를 사용하여 시퀀싱 프로젝트에서 데이터를 사랑,,en,유전자형 배열 대,,en,시퀀싱 토론과 많은,,en “call to action” tweet at the top–당신이 할 수 vote for GenBank every day in August. And I know it’s September now, but I wanted to go and check–and they made it to the final four! So go vote for GenBank some more. Same link works fine. Other things this week: NYTimes shows more stories of people whose recreational genomics endeavors reveal family secrets. One of them is what’s in the reference genome? I don’t think the answer came up completely clearly, but it reminds me I want to look into that again. The breakthrough cancer diagnostics kit is approved. The girlfriend meme. And one more example of how far ahead agriculture is on genomics.


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이번 주 내가 왼쪽으로,,en,행동을 요구하다,,en,상단에 트윗,,en,당신은 매일의 GenBank 투표 수,,en,그러나 다른 트윗은 이번 주 새로운,,en,빠지지 않는다,,en,가짜 보조금 사기에 빠지지 않는다,,en,박물관 샘플 카탈로그,,en,나는 그를 사용하여 시퀀싱 프로젝트에서 데이터를 사랑,,en,유전자형 배열 대,,en,시퀀싱 토론과 많은,,en “call to action” tweet at the top–you can vote for GenBank every day. But the other tweets are new this week. 처음으로, don’t fall for the fake grant scam. A catalog of museum samples (I love the data from sequencing projects using those), genotyping arrays vs. sequencing debate and a lot of new data that’s been released, fungi and 이메일. 대장균 데이터, a terrible DNA joke, and a terrible use of DNA testing to see how white a White Nationalist is.


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은 https://twitter.com/surt_lab/status/897187105495019520

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이번 주 맛 있었다,,en,애플 후성 유전체와 새로운 옥수수 어셈블리,,en,당신의 북반구 여름 피크닉 시간,,en,당신은 해변에서 당신의 산책시에 대해 생각하기위한 해양 원생 생물,,en,벤의 반환,,en,및 PCA 플롯에 대한 안내,,en,인간의 단백질 복합체의 아주 멋진 세트,,en,오피씨 도구,,en,내가 제일 좋아하는 이번 주,,en. Apple epigenome and a new corn assembly, in time for your northern hemisphere summer picnics. Marine protists for you to think about during your walks on the beach. The return of the Venn, and a guide to PCA plots. A very cool set of human protein complexes. Synbio tools.

My favorite this week, 그래도, was the sequencing of different parts of a 200+ year old oak tree. That is a cool idea.


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은 https://twitter.com/CSHL/status/874282809761910784

은 https://twitter.com/nekton4plankton/status/874357230866317313

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주의 비디오 도움말: Direct to Consumer Genetic Testing and Genetic Counselling

OpenHelix시, we remember the days when people didn’t even barely have documentation with their software when they put it out (yah, 나도 알아, it still varies). But outreach really is getting better. There are journals now that are also enforcing more reader-friendly ways to describe the research, with non-jargon summaries and some terrific visual aids.

점점, there are also videos associated with papers. I just came across this one, and thought it was a nice example of an important issue for non-scientists to access.

So this looks at direct-to-consumer (DTC) services available in Europe, but some of the same ones are available in the US. 물론 이죠, 미국, as we muck around with health care again and what is/is not a pre-existing condition, the advice might be different. 한숨.

모자 팁:

참조:

Middleton, 대답 :, Mendes, Á., 베냐민, C 조. 엠, & Howard, H 조. C 조. (2017). Direct-to-consumer genetic testing: where and how does genetic counseling fit?. 맞춤 의학, (14:3) , 페이지 249-257 , 간접 자원부 10.2217/pme-2017-0001.

 

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This week’s SNPpets include items just posted to bioRxiv–which is lately where I see all the really intriguing tools. Including the awesomely-named “Clusterflock”. In a popular related item, someone responds to the Biostar 문제, “why are there errors in bioinformatics software?”. We have bat and bean genomics. And conch and lobster DNA. There’s at least 2 efforts to coordinate/wrangle human public genomes. 그리고 더 많은.


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This week’s SNPpets include a popular slide deck that illustrates roads that go to bioinformatics; questions of what to do with your own genome data (assuming you aren’t a PhD in bioinformatics); fast identification of bacterial strains with StrainSeeker; and the epigenomic landscape of prokaryotes; the ancestors of cultivated peanuts sequenced; a cancer tool with proteomics coactivation pairs; very cool detailed visualization of tissue-level data that offers new insights; and microbiomes abound.


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This week’s SNPpets include quite a range of things. New species genomes projects (pineapple is out, bauhinia being crowdfunded). I dare you to resist a tool called “Time Curves“. The pre-print on over 60k protein coding human variations. Updates via FlyBase and discussed for QIIME. Best quip of the week: You can buy a DNA test on Amazon and it costs less than the textbook about it. A couple of items on bioinformatics pain. Some new solutions. 그리고 더 많은….


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This week’s SNPpets include a lot of back-and-forth on the artist formerly known as personal genomics (now personalized medicine). We got the EU mucking up access, we have privacy issues unearthed, we have the cost of variant calling–and the uncounted cost of other analyses. But we also have the importance of genome sharing. There’s a follow-up story on the kid who was the “first child saved by genome sequencing”. Also some cool research on “essential” 인간의 유전자. New databases or updates, as usual (dbGaP is one I need to go deeper on). 그리고 더 많은….


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