الوسم المحفوظات: الشخصية الجينوميات

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

هذا الاسبوع لدينا DNA في الاقتصاد أزعج ولعشاق الرياضة,,en,موارد البرامج الجديدة للفيروس والدهون,,en,مجموعة يدوية من الأوراق الجينوم السرطان,,en,الدخن,,en,ودي الانقراض,,en,بلدي المفضل قراءة هذا الأسبوع,,en,وكانت ورقة مراجعة البعوض وحملة الجين,,en,أنا حتى على متن الطائرة لالجينات تقود تلك الأشياء,,en,"كم هو لديك DNA وورث,,en," بواسطة,,en,mcgowankat,,en,الاقتصاد الحفلة الجينوم هنا,,en,إدخال SIB جديد,,en,V-الأنابيب و,,en,SwissLipids,,en,pic.twitter.com/hLLuyy9RMJ,,en,مجموعة رهيبة من,,en,البحث عن,,en,NatRevClinOncol,,fr,NatureRevCancer,,en,pic.twitter.com/pvbDVA0LTU,,en,األوامر الأحياء,,en,CommsBio,,la,المستقبل هو فهم,,en,من المعلوماتية الحيوية ستانفورد للندوة Microbiome,,en,pic.twitter.com/P5PM1fmSa9,,en,كريستوفر كورنو,,en,cornue,,en,الشهر القادم,,en,DARPA,,en,rwegrzyn,,pl,على موازنة,,en,السلف مع مخاوف الأمن البيولوجي "هندسة السلامة جين,,en,pic.twitter.com/sc6b2cI45b,,en (?), new software resources for virus and lipids, a handy collection of cancer genomics papers, microbiomes, biosecurity, خروف, pearl millet, and de-extinction. My favorite read this week, رغم أن, was the mosquito and gene drive review paper. I am so on board to gene-drive those things….


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


And why I want gene drive mosquitoes:

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week I left the “call to action” tweet at the top–you could vote for GenBank every day until the end of the competition. On other fronts, هناك وسائل الاعلام كبير على مادة DNA إعادة تحديد الهوية فنتر,,en,ولكن هناك أيضا رد فعل سلبي كبير على أن,,en,سلسلة من التغريدات في وجود يحصل على ذلك,,en,غير ذلك,,en,أكثر من الأمور الأخرى باردة في علم الجينوم حول الأدوات المتاحة وحول الأنواع الأخرى,,en,سعيد أن نعلن أن لدينا كريسبر المجمعة أداة تصميم الشاشة,,en,خطوط إرشاد,,en,ونشرت الآن,,en,pic.twitter.com/q3AYw9gTUW,,en,نيفيل سانجانا,,en,nevillesanjana,,en,twitter.com/david_a_knowles/status/905203427931602944,,en,علم الجينوم التهجين والتاريخ أنواع جديدة مع انجبال داخلي قياس عبر جينومات كل الاوز,,en,علم الطيور,,en,pic.twitter.com/cxDPXg1ZAe,,en,Ornithomics,,en,ornithomics,,en,التعرف على الأشخاص من خلال التنبؤ سمة باستخدام كامل الجينوم,,en,pic.twitter.com/JCKesjsAC2,,en,TeselaGen في مجال التكنولوجيا الحيوية,,en,أنا فعلا المؤلف على هذه الورقة، وكان واحدا من الأسباب تركت HLI,,en–but there’s also significant blowback on that. A series of tweets in there gets to that. Otherwise, more of the other cool things in genomics around the tools available and around other species.


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


HTTPS://twitter.com/david_a_knowles/status/905203427931602944

HTTPS://twitter.com/clairemcwhite/status/905445932094939136

 

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week I left the “call to action” tweet at the top–يمكنك vote for GenBank every day in August. And I know it’s September now, but I wanted to go and check–and they made it to the final four! So go vote for GenBank some more. Same link works fine. Other things this week: NYTimes shows more stories of people whose recreational genomics endeavors reveal family secrets. One of them is what’s in the reference genome? I don’t think the answer came up completely clearly, but it reminds me I want to look into that again. The breakthrough cancer diagnostics kit is approved. The girlfriend meme. And one more example of how far ahead agriculture is on genomics.


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


This seems to be the answer:

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week I left the “call to action” tweet at the top–you can vote for GenBank every day. But the other tweets are new this week. الأول, don’t fall for the fake grant scam. A catalog of museum samples (I love the data from sequencing projects using those), genotyping arrays vs. sequencing debate and a lot of new data that’s been released, fungi and E. القولونية البيانات, a terrible DNA joke, and a terrible use of DNA testing to see how white a White Nationalist is.


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


HTTPS://twitter.com/surt_lab/status/897187105495019520

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

هذا الأسبوع كان لذيذ,,en,أبل epigenome والتجمع الذرة جديد,,en,في الوقت للنزهات الصيف نصف الكرة الشمالي الخاص بك,,en,الأولانيات البحرية بالنسبة لك للتفكير في أثناء المشي الخاص بك على الشاطئ,,en,عودة فين,,en,ودليل على المؤامرات PCA,,en,وهناك مجموعة رائع جدا من بروتين المجمعات الإنسان,,en,أدوات Synbio,,en,بلدي المفضل هذا الاسبوع,,en,كان تسلسل أجزاء مختلفة من,,en,السنة شجرة البلوط القديمة,,en,وهذا هو فكرة باردة,,en,"إعطاء شخص برنامج,,en,كنت إحباط لهم ليوم واحد,,en,نعلمهم كيفية برمجة,,en,كنت إحباط منهم لمدى الحياة.,,en,دايفيد لينويبر,,en,برمجة الحكمة,,en,CodeWisdom,,cy,يتم نشر عملنا على الجينوم التفاح وepigenome أخيرا,,en,bionanogenomics,,en,pic.twitter.com/FcLyEYbL0A,,en,إتيان بوشر,,fr,"Graphtyper,,en,السكان على نطاق التنميط الجيني باستخدام الرسوم البيانية pangenome,,en,جوش بينالبا,,en,JoshPenalba,,id,تعليمي سريع,,en,"كيفية رسم تخطيطي فين في R,,en,صديق,,no,أديم بيليك الذي,,tr. Apple epigenome and a new corn assembly, in time for your northern hemisphere summer picnics. Marine protists for you to think about during your walks on the beach. The return of the Venn, and a guide to PCA plots. A very cool set of human protein complexes. Synbio tools.

My favorite this week, رغم أن, was the sequencing of different parts of a 200+ year old oak tree. That is a cool idea.


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


HTTPS://twitter.com/CSHL/status/874282809761910784

HTTPS://twitter.com/nekton4plankton/status/874357230866317313

dtc_testing

تلميح فيديو للأسبوع: Direct to Consumer Genetic Testing and Genetic Counselling

في OpenHelix, we remember the days when people didn’t even barely have documentation with their software when they put it out (yah, وأنا أعلم, it still varies). But outreach really is getting better. There are journals now that are also enforcing more reader-friendly ways to describe the research, with non-jargon summaries and some terrific visual aids.

على نحو متزايد, there are also videos associated with papers. I just came across this one, and thought it was a nice example of an important issue for non-scientists to access.

So this looks at direct-to-consumer (DTC) services available in Europe, but some of the same ones are available in the US. بالطبع, في الولايات المتحدة, ونحن طين حولها مع الرعاية الصحية مرة أخرى وما هو / هي لا موجودة من قبل حالة,,en,نصيحة قد تكون مختلفة,,en,يجب DTC شركات الاختبارات الجينية شرح الاستشارة الوراثية,,en,جعلها متاحة,,en,في,,sv,pic.twitter.com/eHfvFrMY6B,,en,ميدلتون,,en,في.,,is,هوارد,,en,الاختبارات الجينية المباشر إلى المستهلك,,en,أين وكيف يصلح المشورة الوراثية,,en,PME-2017-0001,,fr, the advice might be different. تنهد.

قبعة غيض:

مرجع:

Middleton, أ., مندس, Á., البلسمينة, C. م., & Howard, H. C. (2017). Direct-to-consumer genetic testing: where and how does genetic counseling fit?. شخصية الطب, (14:3) , صفحات 249-257 , دوى 10.2217/pme-2017-0001.

 

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week’s SNPpets include items just posted to bioRxiv–which is lately where I see all the really intriguing tools. Including the awesomely-named “Clusterflock”. In a popular related item, someone responds to the BIOSTAR سؤال, “why are there errors in bioinformatics software?”. We have bat and bean genomics. And conch and lobster DNA. There’s at least 2 efforts to coordinate/wrangle human public genomes. وأكثر من ذلك.


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week’s SNPpets include a popular slide deck that illustrates roads that go to bioinformatics; questions of what to do with your own genome data (assuming you aren’t a PhD in bioinformatics); fast identification of bacterial strains with StrainSeeker; and the epigenomic landscape of prokaryotes; the ancestors of cultivated peanuts sequenced; a cancer tool with proteomics coactivation pairs; very cool detailed visualization of tissue-level data that offers new insights; and microbiomes abound.


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week’s SNPpets include quite a range of things. New species genomes projects (pineapple is out, bauhinia being crowdfunded). I dare you to resist a tool called “Time Curves“. The pre-print on over 60k protein coding human variations. Updates via القاعدة الجوية and discussed for QIIME. Best quip of the week: You can buy a DNA test on Amazon and it costs less than the textbook about it. A couple of items on bioinformatics pain. Some new solutions. وأكثر من ذلك….


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


 

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week’s SNPpets include a lot of back-and-forth on the artist formerly known as personal genomics (now personalized medicine). We got the EU mucking up access, we have privacy issues unearthed, we have the cost of variant calling–and the uncounted cost of other analyses. But we also have the importance of genome sharing. There’s a follow-up story on the kid who was the “first child saved by genome sequencing”. Also some cool research on “essential” الجينات البشرية. New databases or updates, as usual (dbGaP is one I need to go deeper on). وأكثر من ذلك….


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…