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금요일 SNPpets

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금요일 SNPpets

이번 주 SNPpets 기존 도구에 대한 업데이트가 포함되어 있습니다, 같은 Reactome그림, 가장 큰 JBrowse 디스플레이 내가 이제까지 본, 단어 구름과 같은 # ASHG15의 다양한 맛있는 가벼운 음식, 유전자 편집, 맞춤 의학 및 희귀 질병을 통해 조각, 그리고 가상 머신 카탈로그. 이번 주 가장 특이한 것은: 최근 진화 유전체학 연구는 빅뱅 이론에 도착. 그리고 더 많은….


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조사는 시간에 의해 폐쇄되어있는 경우이 건너, 답변을 참조 (그리고 트위터 토론 게시글은 재미입니다)

reddit_icon

무슨 대답이야? (novel pathways in silico)

reddit_iconThis week’s highlighted discussion is a different take on pathway and network tools. This is about the design of novel metabolic pathways silico에서, not just exploring existing pathways to look for where your favorite genes play roles.

reddit question iconIs there free software available for designing metabolic pathways? (self.bioinformatics)

제출 learnedidiot

I am interested in designing novel metabolic pathways in silico, and was curious if there is a good software packages that allows for finding the shortest path in terms of enzymes, regardless of species, for a given input to final output?

Although we have talked about COPASI 전에, in conjuction with GenoCAD, and we’ve done training on 현악, some of the other tools were new to me and I was pleased to learn of them. If you know of others you can offer the suggestions. 이 이동 look at the discussion.

답변은 무엇입니까? (경로의 색상 유전자)

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 생물 정보학 질문과 문제에 대한 답변 및 토론. 우리의 회원 커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일 우리는이 대화 목록에서 여기 해당 항목이나 토론 중 하나를 강조됩니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

이 질문은 잠시 전에 시작되었다, 하지만 다시 그것을 굴러 최근 응답했다. 그러나 그들은 다양한 실험 또는 광산 연습에서 유전자의 큰 목록을 다루고로 사람들이 많이 물어 질문. 그리고 요즘 제가 바이오 스타에서 약간의 통로 물건을 강조하고 있었다 최근에 그래서 나는이 좋은 동반자 조각이 될 것이라고 생각.

질문: 신호 통로의 색상 특정 단백질 / 유전자

나는 유전자 / protiens의 목록을 가지고. 나는 신호 통로에 단백질 / 유전자의 내 목록에 색을하고 싶습니다. 나는 KEGG이 작업을 수행하기위한 도구가 알고 (검색 및 색 경로지도). 그들은 공개적으로 사용할 수있는 모든 다른 대안입니다? 그렇지 않으면, 어떻게이 작업을 수행 할 수 (까지 모든 포인터 나 헤드). 고마워

GABS

나는에 대해 알고 KEGG 방법, 그러나 진짜로에서 열심히 볼 필요가 Biotapestry. 체크 아웃 답변 그에 대한 추가 정보를 볼 수.

 

주의 비디오 도움말: 합성 생물학에 대한 GenoCAD

합성 생물학의 분야 꽤 오래 simmering되었습니다. 그것은 때때로 큰 도약이 소요, 등 때와 벤터의 팀 발표 에 대한 자신의 일 M. genitalium, 그리고 그 간단한 셀에 세포 프로세스의 많은 모델링에 대한 종이 최근 큰 도약했다 나는 이야기, 그리고에 가상 저널 클럽은 Google 의 직후했습니다 .

그러나 구축하고 꽤이 분야에 대한 지원 소프트웨어에서 작업 한 사람들도되었습니다, 그리고 오늘은 그 도구 중 하나를 탐험하고 싶어. 이번 주 팁 우리는 찾아 보죠 GenoCAD. 컴퓨터 지원 설계 (CAD 데이터) 게놈에 대한 몇 가지 점에서 필요합니다–당신은 일부 시스템을 조롱 할 수 있습니다, 일부 매개 변수를 입력, 당신이 설립 한 방정식을 테스트. 그러나 최근 보고서는 보여 주었다으로–이 재단은 출판물과 데이터베이스에서 benchwork 및 기존 정보의 광범위한 금액이어야합니다. 하지만 그 정보는 조립해야합니다, corralled, 과 분석 및 예측 가능하도록 새로운 방식으로 코딩.

GenoCAD이 유형의 세포 활동을 구축하고 테스트 할이 시작됩니다. 여기 방법 그들은 자신을 설명:

GenoCAD은 오픈 소스 컴퓨터 보조 디자인입니다 (CAD 데이터) 합성 생물학 신청. GenoCAD의 기초는 합성 생물학 시스템을 프로그래밍하는 언어로 DNA를 고려하는 것입니다. GenoCAD는 언어의 단어 주석 유전자 부분의 큰 데이터베이스를 포함. GenoCAD는 부분이 유전 구조에 통합해야합니다 방법을 설명 디자인 규칙을 포함. 이러한 규칙은 복잡한 유전자 구조 및 인공 유전자 네트워크를 설계 과정을 통해 사용자를 안내하는 마법사를 구축하는 데 사용됩니다.

당신은과 좋은 조직을 갖추고 있습니다 찾을 수 있습니다 3 주요 단계: 당신이 단계에서 사용하고자하는 부분을 작성하고 선택할 수 있습니다 1. 발을 맞추어 2 당신은 구조에 넣어 조립. 당신이 더와 모델 가져하려는 경우이 항목의 활동은 당신은 세 번째 단계로 그렇게 할 수.

자세한 내용을 존재하거나 업로드하면 부품 목록에서 선택할 수 있습니다 GenoCAD 옵션을 (포함 BioBricks 자신의 및 항목 부품 등록) 및 부품을 구성하는 기존의 문법 규칙을 사용, 하지만 당신은 사람들에게 국한되지 않습니다. 당신은 당신의 구성 요소를 동반 자신의 부분을 추가하고 자신의 문법 규칙을 만들. 당신은 빨리이 기능을 구성하는 방법을 유연하고 쉽게 볼 수 있습니다. 당신은 거기있는 계정으로 저장할 수 있습니다, 그리고 미래에 그들을 구축.

이 팁에서 우리는 인터페이스의 기본 기능을 시험하는 시간을 갖게 될 것, 하지만 자신의 도움과 문서에서 자세한 내용을 되돌아 가서 자신을 둘러보실 수 있습니다. 제가 참조 섹션에 아래에 링크 한 도움이 간행물의 숫자가 있습니다.

최근에 과학자에 문서에 탐색 된 관련 도구가 있습니다: 이상 이동, 자연. GenoCAD는 기능을 갖춘 도구 중 하나입니다, 하지만뿐만 아니라 다른 사람들에 대한 읽을 수 있습니다. 곧 더 이상 기존의 정보를 찾기 위해 소프트웨어를 사용하기에 충분하지 않습니다 (여전히 중요 할 것이다 비록), 하지만 수정하는 데 도움이, 너무 연구를 확장하기 위해 일부 소프트웨어를 사용하여 아이디어를 모델링됩니다. 그 정말 매력적인 측면 중 하나 전체 셀 시뮬​​레이션 용지 최근 모델 생물을 반영되지 않은 경우가있었습니다 방식, 와 모델의 정교화 생물학의 더 나은 이해는 나왔다.

좋아하는 생물학적 시스템을 모델링 시작 silico에서. 아니면 적어도 그것에 대해 생각하기 시작.

빠른 링크:

GenoCAD 사이트: http://www.genocad.org/

합성 생물학에 대한 PLoS 논문의 핸디 새로운 컬렉션: http://blogs.plos.org/everyone/2012/08/15/plos-one-launches-synthetic-biology-collection/

생물의 마스터 프로그래머: http://www.technologyreview.com/featured-story/428187/biologys-master-programmers/

이상 이동, 자연: http://the-scientist.com/2012/07/01/move-over-mother-nature/

참고 문헌:

윌슨 ML, 환부 R, 아담 L, & Peccoud J. (2011). GenoCAD를 사용하여 합성 유전자 구조의 규칙 기반 설계 단계별로 소개. 방법 Enzymol. , 498, 173-188 간접 자원부: 10.1016/B978-0-12-385120-8.00008-5

제정 러시아의 황제, 엠제이, 카이, Y. & Peccoud, Kokocinski. (2009). GenoCADTM와 DNA 쓰기, 핵산 연구, 37 (웹 서버) W47. 간접 자원부: 10.1093/nar/gkp361

카이, Y를, 윌슨, M.L. & Peccoud, Kokocinski. (2010). iGEM​​에 GenoCAD: 표준을 준수하는 구조의 설계에 문법 접근 방식, 핵산 연구, 38 (8) 2644. 간접 자원부: 10.1093/nar/gkq086

타이슨, J.J. & 노박, B 조. (2010). 생물 화학 반응 네트워크의 기능 그림, 물리 화학의 연간 검토, 61 (1) 240. 간접 자원부: 10.1146/annurev.physchem.012809.103457

금주의 팁: 전체 세포 시뮬레이션 소프트웨어

제 트위터 피드는 세포의 생물 학적 과정의 시뮬레이션에 대한 새로운 출판물 주위 conflama 함께 지난 몇 일 동안 폭발. 분노의 대부분은 아양 부리는 겨냥했다 NYT 피스 그 종이를 약을 한 것 같다. 그리고 예–신문 기사 썼어; 조나단 Eisen는 이야기, 다음 관련 filleted 7 방법 (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7) 과를 만든 관련 잡담 대해 Storify. 농담 중 일부는 너무 재미 있었다–내가 좋아하는 미래 포럼 도움을 요청했습니다:

실시간 @ Pathogenomenick: Synthanswers.com 2035: 안녕하세요 저는 M을 실행하는 데 노력하고. 내 PC에서 genitalium 있지만 컴파일되지 않는다, 도와 주시기 바랍니다.

그렇게 말했다, 사실 내가이 중 일부는 불공정하다고 생각, 그리고 그것이 이루어졌다 실제 직장에서 산란하게하지 않았 으면 좋겠. 리드 저자 조나단 카는 및 JCVI와 스탠포드에서 사람들은 몇 가지 중요하고 필요한 작업을 완성했습니다. 모든 세포 활동의 다양한 기능을 모델링, 및 평가에 적합한 소프트웨어를 개발, 시험, 예측, 우리가 중요 극복하기 위해 지속적으로 이러한 측면을 시각화는 상당히 중요할 것–하지만 대부분 선형로 표현–게놈 시퀀스 데이터. 이 전 과거에 여지가 없을 것으로 일부 통로 및 모델링 도구되고 또한 좋은 방향입니다했습니다. (내 이전 좋아하는가 CellDesigner였다, 그리고 나도 알아 PathCase이 도구를 모델링했습니다, 뿐만 아니라 타인의 많이 있었–하지만 그것들은 각각의 경로와 프로세스에 주로 겨냥한되었습니다, 전체 세포의 하위 집합.)

그러나이 새로운 종이는 그때 실행하고 시각화 수 있도록 더욱갑니다 및 셀룰러 프로세스 번호를 자신의 소프트웨어를로드. 동반 해설 논문으로 설명:

그것은 저자들이 양적 세포 스케일 모델을 사용하여 시스템 수준의 질문을하고 응답하기위한 첫 번째 초안 프레임 워크를 생산했다고이 정신에.

이 도움말을 보려면이 소프트웨어와 함께 당신에게 그들이 생성하는 영화 중 하나를 보여 주마, 그리고 자세한 내용과 소프트웨어 및 데이터 세트에 액세스 프로젝트 페이지으로 이동. 그리고 당신은 할 수 설정하고 자신의 시뮬레이션을 실행–하지만 그게 내 평소 조언의 범위 너머에있어, 그래서 당신은 그 자신을 탐구 해.

그들은 사용 28 셀룰러 프로세스 활동의 다양한 모델–일부는 신진 대사 경로에 적합합니다, DNA 복제에 대한 몇 가지, RNA 가공, 단백질 부패, 및 다양한 다른 것들에게. 보충 여기서 정말 중요합니다–S1이 모델을 가지고, 수학, 당신이 있어야 다른 중요한 것들 다하고 있었는지 이해하기. 이 용지를 구입하면 그 다운로드하는 것을 잊지 마십시오!

컬렉션의 금액, 대조, curation, 그리고 보충에서 이러한 모델을 구성하고 넣어 위해 필요한 합성은 정말 인상적입니다–신경쓸 소프트웨어. 사실 P에서 저자 목록을 다시 봐야만 했어요. 88 보충의, 그리고 나는 아직도 몇몇 다스가이 종이에 많은 사람이 많지 않다는 이유를 알아낼 수 없습니다. 물론 이죠, 그들은 다른 사람의 수백 어깨에 서서: “우리의 모델은 이상의 합성을 기반으로 900 출판물과 이상을 포함 1,900 실험적으로 매개 변수를 관찰했다.” 그리고 데이터베이스에있는 모든 물건들–현재 카운트가 요구하는 두 개 이상의 열 데이터베이스.

 

일단 프로그래밍 시스템을, 그럼 모의 유전자 knockouts을 할 수. 그들은 이것을했을 때 그들이 가진 것으로 79% 생존을위한 생체내에서 이전 관측과 대응. 그들은 또한 성장 속도 비교에서 공부 이러한 유형을 사용할 수. 그들이 모델이 일치하지 않습니다 특히 이러한 데이터는 흥미 있었다: 모델 도전하고 있습니다, 추가 조사 생물학, 상세 검색은 이미 구성의 일부가 아니라 속성의 계정에 필요한 것입니다 어디에 당신이 결정할 수.

그들이 제공하는 영화는 시원, 하지만 거의 너무 비싸요. 나는 조각을 늦출 수있는 대시보드의 꿈과 점진적으로 계속 진행되었다. 나는 또한이하는 것도 그런 것 Caleydo 스타일의 멀티 패널보기 나는 패널 몇 1, 2에 집중할 수있는 곳을, 유전자 또는 구조이나 뭐 다른 패널과.

나도 마음이 간행물의 미래의 플래시를 가지고… 언젠가는 미생물 종이나 조직 / 세포 유형은 여러 가지 방법으로 특성화된다, 약간의 비디오는 데이터를 평가하는 이해해야한다는 숙제를 동반. 하지만 비디오가 풍부한 양의 데이터의 밑에 필요합니다, 품질 통제, 그리고 curated. 나는 보충 정보를 읽고 있었어 (S1, 예, the 122 당신은 또한을 평가하는 데 필요한 페이지 보충제 28 그들이 사용했던 모델) 결국 서로에 의존 인정: 조와, BioCyc, KEGG, NCBI, 및 UniProt 주석, 뿐만 아니라 다양한 측면에 대한 다른 데이터베이스와 많은 (오, 및 타사 소프트웨어의 두 페이지). 이들이 존재하고 올바른 있어야–이 새로운 소프트웨어는 다운 swooping하고 중요한 작업이 유형에서 우리를 구하지 못해. 하지만–그는 말했다, 새로운 데이터는 더 이상 신문에 없습니다, 그것은 브라우저보다 더 필요합니다 (하지만 아마도 현재도 어차피 브라우저가 필요합니다). 그리고 당신은 소프트웨어를 효과적으로 생물학을 평가 어떻게 작동하는지 알아야합니다.

정말 처음이 아니라서 어떤 사람들은이 작품을 비난하고, 그것은 완료 않아 (만 28 모듈), 그리고 Freddolino 및 Tavazoie에 의한 해설 용지 역시 그 통화:

저자 자신도 인정로서, 현재의 모델은 첫 번째 초안으로 간주되어야합니다, 는 스스로 하나의 생산 모델로서보다 미래 교양을위한 출발점으로서 더 중요.

우리는 여기에서 미래를 얻을 수, 하지만 직선이어야하며 때로 dartboard가 발생하는 것은 시작하는 좋은 방법입니다하지 않습니다. 그래서 다트 던져, 우리가 과학에서 어떤 일을하세요–하지만 그들 중 일부는 건설하기위한 것이다 바란다.

당신은 더 이상 종이를 탐험하고 싶다면, 또한 되려고하고 있어요 가상 저널 클럽은 Google에서 호스팅 종이를 논의하는.

단지 저널 셀에 발표된 흥미로운 새 문서는 세포의 내부를 시뮬레이션하기위한 통합된 노력을 설명. 이번 주 금요일, +스티븐 라슨 답장이 은신처에서 용지를 걸어 그 의미를 설명합니다. 이 흥미로운 새로운 개발에 대한 논의를 위해 우리와 함께하시기 바랍니다.

이뿐만 아니라 참석하려고 할거야. 그 호스트–OpenWorm의 스티븐–제가 얼마전까지 만해도 그 3D-웜 소프트웨어에 대해 얘기 때 발생한 그룹의 일원이었다. 주의 비디오 도움말: 3D 웜! 때문에 웜 생물학 및 개발 주변의 우수한 자원들이 잘 앞서 모델링에있는 다른 커뮤니티가 될 거에요. 그리고 저널 클럽에 대한 메모: 종이의 수석 저자는 초대를보고 참석 예정–그리고 논문에 대한 링크를 제공하고 액세스를 원하는 지금 가지고 있지 않다면 저기 보충했습니다.

빠른 링크:

시뮬레이션에 대한 용지: 전체 셀 전산 모델은 유전자형에서 표현형 예측

동일한 문제의 해설 용지: 가상 세포 생물학의 새벽

현재 사용 가능한 소프트웨어: https://simtk.org/home/wholecell

스탠포드 팀 프로젝트 사이트: M. genitalium 전체 셀 모델 & 기술 자료

참고 문헌:

카는, 제이, Sanghvi, 제이, 맥클린, 디, Gutschow, 엠, 제이콥스, 제이, Bolival, B를, 아사 - 가르시아, 북아 일, 유리, Kokocinski. & 은밀한, M. (2012). 전체 셀 전산 모델은 유전자형에서 표현형 예측, 세포, 150 (2) 401. 간접 자원부: 10.1016/j.cell.2012.05.044

Freddolino, 피. & Tavazoie, S. (2012). 가상 세포 생물학의 새벽, 세포, 150 (2) 250. 간접 자원부: 10.1016/j.cell.2012.07.001

답변은 무엇입니까? (문학에서 유전자 네트워크를 구축)

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리의 회원커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

최근에 누군가가 문학에서 유용한 정보를 추출하는 방법에 대해 질문하고 해당으로부터 네트워크를 구축하여왔다. 응답자들은 유용한 소프트웨어를 제공–네트워크 유기체에 대해 생각해야하는 방법에 대해 생각에 대해서도 좋은지도:

질문: 문학에서 유전자 규제 네트워크 구축

안녕하세요 모두들!!

누구나 혼자 문학에서 유전자 규제 네트워크를 구축할 것이 가능한 소프트웨어 아시나요?

고마워!

다이아나

첫 번째 대답은 고려해야 할 몇 가지 소프트웨어를 제공, 하지만 두 번째 대답 (적어도 현재와 같은 명령을) 문학을 넘어 생각이 측면에 대한 사려 깊은 논평을 제공. 나는 좋은 밸런스라고 생각. 토론을 체크 아웃.

금요일 SNPpets

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  • 이것은 좋은 생각이 아니에요. 보스턴 공상 과학 - 긱 투어. 나는 공원 서비스에 대한 작업에 사용. … 실시간 @ YishaiKnobel: 브로드 연구소에서 매혹적인 관광 및 유전체학에 대한 강의 오늘. 광범위한는 보스턴 관광 명소로 전환해야. [메리]
  • 실시간 @ BioCatalogue: @ manniet3에 의해 BioCatalogue 아이폰 / iPad 애플 리케이션은 이제 밖! http://bit.ly/p2tUQF 우리가 어떻게 생각하는지 알려주십시오. [메리]
  • 포함 KEGG, iPATH 2.o, PathwayProjector, metaSHARK, MEGAN 4, HUMAnN: 실시간 @ phylogenomics: Metagenomic 데이터 세트를위한 신진 대사 재건 도구의 조사»생물 정보학 Knowledgeblog http://shar.es/HK0U5 [메리]
  • 단백질 데이터 뱅크의 40 주년을 축하하는 특별 심포지엄, October 28 – 30, 2011, 콜드 스프링 하버, 뉴욕 – 포스터 초록 마감: August 15 [제니퍼]
  • 아, plz: 실시간 @ nutrigenomics: RT @ grapealope처럼: 생물 정보학이 도구를 만들기에 관한 아닙니다. 우리는 도구를 알고; 우리가 먼저 그들을 사용해야합니다. @ atulbutte # singularityu [메리]
  • 낄낄 웃음. 나는 몇 종의 이렇게 했어요, 단지 식물… : @ pcronald: 식물학은 전체 샐러드 바를 보유하고. http://onion.com/pojv2t [메리]
  • RT @ wahwahnyc: PubMed 중앙에: 병리학자: 경로 중심의 분석을위한 자동화된 도구. BMC는 생물 정보학. http://1.usa.gov/oDyBpc [메리]
  • 일부 여유와 재미를 찾고? The 트웬티 - 퍼스트 첫번째 연간 IG 노벨상 의식 목요일 발생합니다, September 29, 2011 그리고 티켓은 현재 판매되고. 참고: “첫번째 사람을 웃게 IG 노벨상 명예 성과, 그리고 그들이 그렇게 생각하게.” [제니퍼]
  • 실시간 @ genetics_blog: . @ 플로스 및 애플 리케이션에 대한 @ mendeley_com 콜: http://bit.ly/oc2NGLhttp://bit.ly/nHYqNa [메리]
  • 그냥 구글과 MS에 대한 자연 뉴스에서 이것을 보았다: 컴퓨팅 거인 무료 과학 통계를 실행 [제니퍼]
  • FameLab, 과학 및 공학 통신 경쟁 – 안나요 아직 시시한 일… [제니퍼]

Reactome 웹 세미나가 오는; 수요일 Feb 2

우리는 도로에서 워크샵을하고 지난 주에 있었다, 그래서이 이제 며칠 나이. 그러나 GO 친구 메일링리스트에없는 경우에는 그것이 당신의 새로운 가능성. 에 대한 빠른 단어 친구 목록 GO: 많은 도구는 유전자 온톨로지에 의존하고 이동을 구성 요소의 몇 가지 종류를 가지고 있기 때문에, 해당 메일링리스트에 와서 일을 꽤 다양한있다. 이 글 개발자 GO위한 것만이 아니라. 당신은 그것을 확인해 수도 있습니다.

어쨌든, 제가 오늘에 집중하려고하면 향후에 대해 공지합니다 Reactome 웹 세미나. 인터페이스에 큰 변화가 있었다, 하지만 기본 냉정과 모든 생물 학적 경로의 높은 품질이 그대로 유지, 물론! Reactome 우리가 오랫동안 사랑 도구입니다, 그리고 우리는 다음 업데이 트에 대한 주위 Reactome 사람과 조정했습니다 우리의 튜토리얼. 이제 우리는 업데이 트에 최선을 다하고 있습니다.

당신이 원한다면 Reactome에 대한 자세한 내용과 이러한 새로운 변경 내용, 곧 웹 세미나가있을거야. 당신은 등록해야, 그리고는 여기에 세부 사항 중 일부를주지. 에 반하고 친구 메시지 링크를 GO 나머지를 볼.

온타리오 게놈 연구소 (법률) 암 연구를위한 온타리오 연구소 (OICR) 공동 호스팅하는 한 시간 웹 컨퍼런스 / Reactome 패스 데이터베이스에 대한 웹 세미나 (http://www.reactome.org) - 자유롭게 사용할 수, 핵심 생물 학적 경로의 수동 curated 리소스. Reactome 데이터베이스 대사의 기본 경로에서 같은 GPCR 신호 및 apoptosis와 같은 복잡한 사건에 이르기까지 인간 생물학의 영역을 캡슐 경로 데이터를 제공합니다.

이것은 후속 웹 세미나는보다 직관적인 사용자 인터페이스 및 데이터 분석 도구의 새로운 제품군으로 업데이트 웹 사이트를 소개합니다. 여러 연구 그룹에서 사례 연구를 통해이 데이터베이스를 사용하는 방법을 배우게.

프레 젠 테이션은 박사에 의해 주어집니다. 로빈 올라가자, Reactome 공익 사업의 관리자, OICR, 그리고에 대한 업데이트된 Reactome 리소스를 사용하는 방법을 다룰 것입니다:

• 탐색 및 경로의 지식을 검색,
• 네트워크 및 경로 데이터를 통합,
• 실험 데이터 세트를 분석 패스와 표현 분석 도구를 사용하여,
• Reactome BioMart와 실험 데이터 세트에 주석을,
Reactome 기능성 상호 작용 네트워크 Cytoscape 플러그인을 사용하여 암 및 기타 질병에 관한 • 발견 네트워크 패턴,
• Reactome 데이터 및 분석 도구를 이용 사례를 소개합니다.

http://fafner.stanford.edu/pipermail/gofriends/2011-January/001772.html

등록 정보에 대한 링크로 이동. 나는 듣고있을 거예요 (우리는 그날 워크샵을 예약하지 않은 경우!)

금요일 SNPpets

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