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캠브리지 Healthtech Institute는 OpenHelix의 인수를 발표

캠브리지 Healthtech 연구소 (CHI) 워싱턴에 본부를 둔 OpenHelix의 구입을 발표, 웹에서 가장 인기 있고 강력한 오픈 액세스 생물 정보학 자원의 일부에 온라인 및 현장 교육의 제공.

"최신 생물 정보학 도구를 사용하는 방법을 아는 것은 게놈 연구에 중요, 있는 유일한 중요성이 증가 할,"고 말했다 필립스 Kuhl, 개발 및 오픈 액세스 생물 정보학 데이터베이스와 프로그램에 대한 교육을 제시하는 10여 년간의 실적과 함께 캠브리지 Healthtech 학회의 대통령 ", OpenHelix는 연구자들에게 쓸모있는 서비스와 회의 및 교육 제품의 CHI의 가족에 키 추가되었습니다. "

OpenHelix는 바이오 IT 월드의 자회사로 캠브리지 Healthtech 학회에 참가, 생명 과학 기술과 전략적 혁신에 대한 뉴스와 의견의 최고의 소스, 약물 발견과 개발을 포함. "OpenHelix는 바이오 IT 월드에게 학술 연구 지역 사회에서 광범위하고 우수 고객을 제공합니다, 뿐만 아니라 기회가 우리의 기존 고객 가치 교육의 생산 라인을 확장하기로,"있어 더 Scimemi, 바이오 IT 월드의 발행인, "우리의 독자의 많은 훈련을하는 것은 자신이나 자신의 직원이나 학생들이 필요하지만 인식되지 않을 수 있습니다."

"우리는 과거에 우리가 가지고있는 성공을 자랑스럽게 생각합니다, 최고 대학 및 의과 대학 중 일부는 OpenHelix에 가입과 함께,"스콧 선반했다, OpenHelix의 CEO는 "바이오 IT 월드와 함께 작업하는 것은 우리에게 인프라를 가져올 것이다, 자원, 및 시장 범위 우리는 더 우리의 튜토리얼을 성장해야, 구독, 및 제품 오퍼링을. "

인수의 일환으로, 스콧 선반, CEO 및 OpenHelix의 공동 설립자 OpenHelix 단위의 일반 관리자와 메리 망간이 될 것입니다, OpenHelix의 사장 겸 공동 설립자 감독이 될 것입니다, 제품 및 OpenHelix 유닛의 콘텐츠.

바이오 IT 월드 소개 (www.Bio-ITWorld.com)
바이오 IT 월드는 생명 과학 데이터의 관리 및 분석에 영향을 미칠 최첨단 동향 및 기술의 뛰어난 혜택을 제공합니다, 비롯한 차세대 시퀀싱, 약물 발견, 예측 및 시스템 생물학, 정보학 도구, 임상 실험, 및 맞춤 의학. 다양한 소스를 통해, 바이오 ITWorld.com, 주간 업데이트 뉴스 레터 및 바이오 IT 월드 뉴스 게시판, 바이오 IT 월드는 생명 과학 기술과 전략적 혁신에 대한 뉴스와 의견의 최고의 소스입니다, 약물 발견과 개발을 포함.

캠브리지 Healttech 연구소 소개 (www.chicorporate.com)
캠브리지 Healthtech 연구소 (CHI), 년에 설립 1992, 상위 제약에서 저명한 연구자 및 비즈니스 전문가에게 우수한 품질의 과학적인 정보를 제공하는 업계 리더이다, 생명 공학, 학술 단체. 이러한 이벤트로 자원의 구색을 제공하는, 리포트, 간행물 및 뉴스 레터, 제품의 CHI의 포트폴리오는 캠브리지 Healthtech 연구소 컨퍼런스를 포함, 바넷 교육 서비스, 인사이트 제약 보고서, 캠브리지 마케팅 컨설턴트, 캠브리지 미팅 플래너, 기술 재단과 캠브리지 Healthtech 미디어 그룹, 이는 바이오 IT 월드 및 임상 정보 과학 뉴스를 포함.

소개 OpenHelix (www.openhelix.com)
OpenHelix, 워싱턴 주 회사, 년에 설립되었다 2003 오픈 액세스 웹 기반 생물 정보학 자원의 다음 신생 무엇인지에 대한 교육하지만 빠르게 성장하고있는 시장을 제공하는. OpenHelix 자원의 많은 공급 업체에 대한 교육 및 홍보 서비스를 제공하고 있습니다, UCSC의 게놈 브라우저 등, OMIM, 및 단백질 데이터 뱅크 (RSCB PDB). OpenHelix 수신 $1.2 만 부여에서 2007 생물 정보학 자원에 대한 검색 엔진을 만들 수 및 자습서 제품군을 확장. 에 2009, 그것은 이상 할 구독 서비스를 시작 100 튜토리얼 스위트.

주의 비디오 도움말: 1000 NCBI에서 Genomes의 데이터 집합 브라우저


최근 NCBI 뉴스 레터 라는 새로운 자원의 출시를 발표 1000 Genomes의 데이터 집합 브라우저, 그리고 내가이 팁에서 특징 될 리소스입니다. 그것은 새로운을 통해 사용할 수있는 도구 중 하나입니다 NCBI 유사 자원 페이지, 또한 같은 자료를 제공하는 dbSNP, dbVar, dbGaPClinVar (하는 많은 OpenHelix은 대한 튜토리얼이 있습니다) 뿐만 아니라 다른 대안 도구에게 – 유사 리포터 (시험판 버전), 임상 리맵 (베타 버전) 그리고 표현형 - 유전자형의 통합.

나는 NCBI의를하기 전에 1000 Genomes의 데이터 집합 브라우저, 나는에 시간을 조금 보내고 싶습니다 1000 Genomes 프로젝트, NCBI에서하고 프로젝트 자체에서 무엇인지 구분하기 위해. 부터 1000 Genomes 파일럿 용지:

“의 목적 1000 Genomes 프로젝트는 발견하는 것입니다, 여러 인간 집단에서 인간의 DNA 다형성의 모든 형태에 정확한 haplotype 정보를 유전자형 및 제공. 특히, 목표는 이상 성격입니다 95% 게놈 지역에서 현재의 높은 처리량 시퀀싱 기술에 액세스 할 수 있습니다 및 allele 빈도가 그 변종의 1% 이상 (다형성의 전통적인 정의) 5 개의 주요 인구 그룹의 각 (유럽​​에서 조상이나와 인구, 동아시아, 남아시아, 서 아프리카와 아메리카).”

당신은 아래의 링크에서 전체 종이를 액세스 할 수 있습니다. 이 프로젝트는 현재 시험 단계 과거 이동하고 새 데이터를 모든 시간을 발표합니다. 당신은 공지 사항 및 프로젝트 세부 정보를 볼 수 있습니다, 또는 액세스하는 데이터, 를 통해 공무원 1000 Genomes 프로젝트 사이트, 또는 공식을 통해 1000 Genomes 버전 Ensembl 브라우저. 당신은에 대한 상상으로 “큰 데이터” 이와 같은 프로젝트를, 데이터는 NCBI 데이터베이스의 다양한에 추가되었습니다, 포함 dbSNP, the 순서는 보관함의 글을 읽을 (SRA)BioSample. 당신은 범용 Entrez 검색 시스템을 통해이 데이터를 검색 할 수 있지만, 이전 데이터를보기 위해서는 각각 별도의 데이터베이스에서 개별 결과를 볼 수있을 것. The 1000 NCBI에서 Genomes 브라우저는 종합적으로 검색을위한 강력한 인터페이스로 만들었습니다, 및보기, 1000 한 페이지에 NCBI 자원에 포함 된 Genomes 데이터.

비디오 끝에서 나는 페이지의 다양한 영역에 익숙해 것 - 브라우저가 위젯의 일련의 생성, 자신의 함수를 사용하여 각. 나는 모든 기능을 포함 할 수 없습니다, 또는 사용자가 브라우저에 자신의 대안 데이터를 업로드 할 수 방법을 보여줍니다 – 내가 직접 사람들을 탐험의 재미를 둘 게요. 이 도구는 어린 나이 때문에, 버그 및 제안 / 의견은 여전히​​ 적극적으로 요청되고있다 – 당신이 뭔가를 발견 한 경우, 자주 묻는 질문 (FAQ)을 확인 (고정되는 다양한 단계에서 버그를 논의하는) 다음 팀에 이메일을.

빠른 연결:
NCBI 뉴스 레터 공지 7월 20, 2012: http://1.usa.gov/RQu5dR

NCBI 유사 페이지: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/

NCBI 1000 Genomes 브라우저 페이지:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/

1000 Genomes 프로젝트 사이트: http://www.1000genomes.org/home

The 1000 의 genomes 프로젝트 특정 버전 Ensembl 브라우저:
http://browser.1000genomes.org

참조:
The 1000 Genomes 프로젝트 컨소시엄 (2010). 인구 규모의 시퀀싱에서 인간 게놈 변이의지도 자연, 467, 1061-1073 간접 자원부: 10.1038/nature09534

주의 비디오 도움말: MetaboAnalyst 2.0


를 찾고에 2012 NAR의 웹 서버 문제, 핵산 연구 저널, 나는 개발자에 대한 비트를 공개 통지 자원 이름을 도울 수 없습니다’ 유머 감각, 등 “세금 징수 원” 및 “XXmotif“. 기타리스트에 있었다 (“자석“, “특징” 및 ““, 예를 들면) 그의 이름은 사람이 평균 검색 엔진 그들을 찾기 위해 애를 상상 나를 싫증이 나다 한. [Our family’s favorite such resource is 함께, 또는 정보가 단백질 이상의 하이퍼 링크 - 내가 가야하는 개발자가 다른 영광의 그 이름을 겨냥한 생각 함께 :) 어디서나와 아침 식사.]

오늘의 팁에 제공 할 수있는 자원을 찾을 때까지 많은 같은 이름을 통해 스크롤. 나는 현재의 주제를 처리 무언가를 원 – 그들은 모두 거의에 맞는 기준 – 내가이 관심을 것 같아요, 하지만 그게 내 밖에있었습니다 “전문 일반 지역”. 나는 결정 “MetaboAnalyst 2.0“, 이는 오늘의 팁에 제공 될 수있는 자원입니다. 이 문서에 설명되어 “metabolomic 데이터 분석을위한 MetaboAnalyst 2.0 포괄적 인 서버” 다음과 같이:

“MetaboAnalyst 고 처리량 metabolomic 데이터 분석을위한 웹 기반 스위트 룸. 원래 2009 년 출시 된… MetaboAnalyst 2.0 이제 데이터 처리를위한 새로운 모듈의 다양한 포함, 데이터 QC 및 데이터 정상화. 또한 데이터 해석을 지원하는 새로운 도구가, 다중 그룹 데이터 분석을 지원하는 새로운 기능, 상관 관계 분석뿐만 아니라 새로운 기능, 시간 시리즈 분석 및 이중 분석. 우리는 또한 업데이트 및 그래픽 출력이 높은 해상도의 생성을 지원하는 업그레이드 한, 출판 품질의 이미지.”

나는 자주로, 나는 시작 “여행” MetaboAnalyst 2.0 자신의 NAR 문서를 읽어. 이곳은 서면 및 인터페이스의 목표는 사용자 친화적이고 직관적이 될 것입니다 방법을 설명합니다, 그래서 MetaboAnalyst으로 향했다 2.0 “어떤 타이어를 차”, 말하자면. 나는 인터페이스가 매우 쉽다 것을 발견 & 사용하기 직관적 인. 그리고 정말 사용자가 자신의 데이터를 업로드에 실행하기 전에 리소스를 이해하는 데 도움이, 개발자가 예를 들어 데이터의 다양한 범위를 제공하면 사용자가 가지고 놀 수있는 설정, 뿐만 아니라 단계별 가이드 (PDF 파일, 파워 포인트, & 저널 구독을 필요로이 기사를, 아직 동영상이 없습니다). 내 동영상에 내가 그들의 데이터 세트 중 하나를 사용 & 일부 분석 단계의 간단한 예를 보여. 물론 완전히 MetaboAnalyst을 충당 할 시간이 없다 2.0, 하지만 다행스럽게도 필자는 자신에 사용해 유혹 할만큼 표시.

*모든 사용자 데이터가 MetaboAnalyst에 의해 개인 정보 및 기밀로 취급되기 때문에 개발자가 즉시 결과를 다운로드하는 것이 좋습니다 되오니, 이용에 참고하여주십시오 2.0 자동으로 삭제되기 전에 만 72 시간 동안 서버에 유지됩니다.

빠른 링크:

MetaboAnalyst 2.0 – http://www.metaboanalyst.ca/

참고 문헌:
Jianguo 쌰, Manda Rupasri, 이고르 V. Sinelnikov, 데이비드 Broadhurst, & 데이비드 S. Wishart (2012). metabolomic 데이터 분석을위한 MetaboAnalyst 2.0 포괄적 인 서버 핵산 연구, 40 (W1) 간접 자원부: 10.1093/nar/gks374

Jianguo 쌰, 닉 Psychogios, 넬슨 영, & 데이비드 S. Wishart (2009). MetaboAnalyst: metabolomic 데이터 분석 및 해석을위한 웹 서버 핵산 연구 볼륨 37, 문제 suppl 2 PP. W652-W660. , 37 간접 자원부: 10.1093/nar/gkp356

주의 비디오 도움말: 새로운 유전자 테스트 레지스트리 (GTR) 리소스


하순 지난 달 생명 공학 정보를위한 국립 센터, 또는 NCBI, 유전자 검사에 대한 새 리소스 정보를 포함 발표. 리소스의 이름입니다 유전자 테스트 레지스트리 (GTR), 과 홈페이지에 의하면, GTR:

” 제공자에 의한 유전자 검사 정보를 자발적으로 제출 중앙 위치를 제공합니다. 범위는 시험의 목적이 포함되어 있습니다, 방법론, 효력, 검사의 유용의 증거, 그리고 실험실 연락처 및 자격 증명. GTR의 overarching 목표는 건강과 질병의 유전적 근거로 공중 보건과 연구를 진행하는 것입니다.”

난 항상 NCBI에서 새 자원을 체크 아웃에 관심이 있어요, 그것은 매주 팁을 할 내 차례입니다 특히. 처음에 제가 GTR을 확인하고 그것을 사용하는 방법에 대한 동영상을 게시할 것이라고 생각 – 하지만 NCBI 그 날 이길. 당신은 그들을 볼 수 있습니다 유튜브 팁 (두 사람은있다) 자신의 홈페이지 링크를 클릭하여 & 일부 검색 도움말을 보려면, 등등. [참고, 두 동영상 나를 위해 루프로 계속 & 난 한때 그들을보고 나서 그들을 막을 필요].

하지만 내가 생각해낸 것이 질문은, “나는 이미 내가 사용하는 다른 임상 자료에서 안타 그게 대체 무슨 GTR 날 제공할 것입니다, 그것에 OpenHelix 열차?” 나는 동일한 검색을 수행하여 내 동영상에서 그 질문을 해결하려고, 용 “낭성 섬유증”, 다섯 가지 임상 관련 자료에서, 그리고 각각 제공하며, 일을 전문적으로 어떤 논의. 물론 이죠, 5 분 비디오에 제가 종합 수 없습니다 – 자원 또는 그들이 커버 중 – 하지만 당신이 GTR 당신에게 제공하는 일에 감사하는 것은 당신에게 충분한 맛을 줄 것이라고 생각, 또는 귀하의 직접 비교 계속.

제가 팁 영화에서 방문하는 자원입니다: GTR, GeneTests, the 유전자 홈 참조 (GHR), OMIM, 및 Orphanet. 각 리소스에서 나는 질병에 대한 기본적인 검색을 수행 “낭성 섬유증” 그리고 결과 초기 결과 디스플레이를 표시. 나는 각에서 사용할 수있는 자세한 보고서를 비교하는 시간이 없어, 이보다 더 낮을 게시물에 나는 자원에 대한 참조에 연결 (가능하다면), 자원 OpenHelix 교육 자료뿐만 아니라 방문 페이지 – 우리는 이러한 리소스의 많은에 튜토리얼을 가지고 있기 때문에. 나는 또한 각 리소스에 대한 직접 링크를 포함.

당신이 읽을 것을 권해 줄 GTR 릴리스에 대한 NIH 뉴스 기사 GTR에 대한 몇 가지 배경. 여기서 모든 것을 커버하지 않습니다, 하지만 여러분의 관심을 가리 키도록하려는 단락 몇가 없습니다. 첫 번째는 GeneTests와 GTR의 관계를 설명, 다음과 같이 말한다:

“GTR은 GeneTests의 실험실 디렉토리에서 가져온 데이터를 기반으로하고 있습니다, 내년 걸쳐 단계별됩니다 선구적인 NIH 투자 자원. GTR은 그 이전보다 더 상세한 정보를 포함하도록 설계되었습니다, 뿐만 아니라 테스트 접근법 훨씬 광범위한 범위를 포괄하는, 이러한 일반적인 질병와 관련된 유전자 변형에 대한 복잡한 테스트와 같은 마약에 대한 다양한 반응과. GeneReviews, 이것은 피어 리뷰를 포함 GeneTests의 섹션입니다, 이상의 임상 설명 500 조건, GTR을 통해 구할 수 있습니다.”

그것이 새 리소스를 시작하는 데 쉽게 간주되었다 곳이 있었나 보군 (GTR) 시도하고 오래된 리소스를 개편하는 것보다 (GeneTests) 새로운 데이터의 놀라운 유입을 처리하는. 종종 자원은 빨리 예상대로 은퇴하지 않습니다, 사용자의 피드백에 의한, 하지만 GTR 결국 GeneTests를 대체하는 장소를 보이는 점에 유의하는 것이 중요하다. 나는 가정 GeneReviews 여전히 의해 수정됩니다 & 에 대한 저작권 워싱턴 대학, 시애틀, 하지만 그것에 대한 참조가없는. 유사한 전환 OMIM 위해 발생, 어떤은 그러나 년간 NCBI에서 호스팅되었습니다 지금은 존스 홉킨스에​​서 새 URL을 가지고 (OMIM에 대한 우리의 새로운 튜토리얼 엿보다, 이것은 작품 현재).

제가 특히 관심을 찾은 두 번째 단락은 GTR에 포함된 내용을 하나 였어요, 그리고이 포함되어 있습니다. 그것은기로:

“기본적인 사실 이외에, GTR은 분석적 타당성에 대한 자세한 정보를 제공합니다, 이는 테스트를 유전자 표적을 측정하는 방법 정확하고 안정적​​으로 평가; 임상적 유효성, 테스트가 감지 방식을 일관하고 정확하게 평가 또는 이익의 결과를 예측하는; 테스트의 임상 유틸리티에 관한 정보, 아니면 시험은 환자 결과를 개선하는 방법을 가능성이 높습니다.”

나는 즉시 GTR 문서의 유효성 또는 유틸리티 정보를 제공합니다 사람의 언급을 찾을 수 없습니다, 건설중인 현재있는 것입니다. 그것은 데이터베이스의 내용 정도가 될 것이 분명하다 “자발적으로 시험 기관에 의해 제출된”, 그리고 그것은 적혀있다 그 “NIH는 독립적으로 GTR에 제출된 정보를 확인하지 않습니다; 그것은 오해의 소지가 정확하고 아닌 정보를 제공하기 위해 submitters에 의존합니다.”, 하지만 또한 전문가들이 정기적으로 GTR의 콘텐츠에 입력됩니다 보았다, 여기 읽을 수로. GTR 팀은 또한 리소스에 입력을 받기에 아주 흥미 롭, 있는가를 통해 제출할 수 GTR 피드백 양식.

빠른 연결:

유전자 테스트 레지스트리 (GTR) – http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gtr/

NCBI에서 GTR 유튜브 팁 – http://www.youtube.com/playlist?list=PL1C4A2AFF811F6F0B

GeneTests – http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/GeneTests/?db=GeneTests

OpenHelix에 *으로 기초 자습서 GeneTests – http://bit.ly/genetests

유전자 홈 참조 (GHR) – http://ghr.nlm.nih.gov/

OpenHelix에 *하여 GHR 입문 자습서 – http://bit.ly/geneticshomeref

사람에 온라인 Mendelian 상속 (OMIM) – http://www.omim.org/

OpenHelix 의한 OMIM 입문 자습서 – (출시예정, 현재 업데이 트되는)

Orphanet – http://www.orpha.net/

형태.

*개별 구매 가능한 다음 자료 또는 가입을 통해 OpenHelix 자습서

사용 가능한 참조:

GeneTests 위해 (PMC에서 무료)Pagon RA (2006). GeneTests: 의료 서비스 제공자를위한 온라인 유전자 정보 자원. 의학 도서관 협회 저널 : JMLA, 94 (3), 343-8 PMID: 16888670

GHR 위해 (PMC에서 무료)미첼, JA, Fomous C, & 재미있는 J (2006). 유전학 홈 레퍼런스의 과제와 전략. 의학 도서관 협회 저널 : JMLA, 94 (3), 336-42 PMID: 16888669

OMIM 위해 (액세스 문서를 엽니다)Amberger, 제이, Mouthpieces, C., & Hamosh, A. (2011). 새로운 얼굴과 인간의 온라인 Mendelian 상속을위한 새로운 도전 (OMIM ®) 인간의 돌연변, 32 (5), 564-567 간접 자원부: 10.1002/mu.21466입니다

Orphanet 위해 (전체 접속 회원 가입이 필요합니다) - Ayme, 미국, & Schmidtke, Kokocinski. (2007). 희귀 질환을위한 네트워킹: 유럽​​에 대한 필요성 연방 보건 공보 – 건강 연구 – 건강, 50 (12), 1477-1483 간접 자원부: 10.1007/s00103-007-0381-9

UCSC 게놈 브라우저를 사용하는 방법에 대한 무료 웹 세미나

UCSC 생물 정보학 그룹은 UCSC 게놈 브라우저에 두 가지 무료 웹 세미나 발표 (http://genome.ucsc.edu/). 웹 세미나는 OpenHelix에 의해 실시됩니다, 무료 100s에 대한 교육의 공급자, 공개적으로 액세스할 생물 정보학 및 게놈 자원.

시간 15 분 긴 웹 세미나를 효과적으로이 강력한를 사용하는 데 필요한 주제를 다룰 것입니다, 무료, 공개적으로 액세스할 도구. The 첫번째 웹 세미나, 개최 화요일, 월 24, 11:00-12:15 태평양 표준시 / 2:00-3:15 및 (추가, 수정: 이건 18:00 세계 협정시 / 그리니치 표준시), 수 게놈 브라우저의 소​​개, UCSC 게놈 브라우저의 새로운 사용자를 위해 설계, 누가 싶은 사람은 기본 탐색 및 디스플레이에서 자신의 능력을 향상시킬.

이 웹 세미나에서는, 너도 알게 될거다:
기본적인 텍스트 검색을 수행하도록 •
•이 탐색 및 이익의 게놈 영역에 표시되는 기능을 이해
• 여러분의 요구에 맞게 표시를 사용자 정의
• 사용 필터를 사용하면 관심있는 데이터를 강조, 이러한 밖으로 서 적색 이외의 동의어 SNPs를 표시로서
• 어떻게 볼 당신이 원하는 방식을 설정하는, 그리고 그 저장 다른 사람들과 공유할 수있는 "세션"으로

The 두번째 웹 세미나, 개최 목요일, 월 26, 1:00-2:15 태평양 표준시 / 4:00-5:15 및 (추가, 수정: 이건 20:00 세계 협정시 / 그리니치 표준시), 커버됩니다 고급 주제 사용자 정의 트랙을 생성하고 테이블 브라우저를 사용하여 포함.

이 웹 세미나에서는, 당신은 방법을 배우게 될거야:
•이 UCSC 게놈 데이터베이스의 고급 검색을 수행
• 수출 및 타겟 데이터의 다운로드 다량
• 여러분 고급 검색 인한 사용자 트랙을 만들
• 다른 사람들과 공유하기위한 귀하의 데이터를 사용자 정의 주석 트랙을 만들

좌석이 한정되어 등록이 필요합니다. 등록 시에 www.openhelix.com / cgi는 / webinar.cgi. 참고 사항에 대한 웹 세미나 전에 다운로드 슬라이드에 복용 http://www.openhelix.com/ucsc.

세미나 요약:
: "UCSC 게놈 브라우저 입문"과 "UCSC 게놈 브라우저: 사용자 정의 트랙과 테이블 브라우저 "무료 웹 세미나는 UCSC 생물 정보학 그룹에서 후원하고 OpenHelix로 제시, LLC는.

언제: [참고 시간이 다르다는 것을]
소개: 화요일, 월 24, 11:00-12:15 태평양 표준시 / 2:00-3:15 및 (추가, 수정: 이건 18:00 세계 협정시 / 그리니치 표준시)
사용자 정의 트랙과 테이블 브라우저: 목요일, 월 26, 1:00-2:15 태평양 표준시 / 4:00-5:15 및 (추가, 수정: 이건 20:00 세계 협정시 / 그리니치 표준시)

누가: 어떻게 UCSC 게놈 브라우저를 사용 학습에 관심이 사람. 게놈 / 생물 학적 개념에 대한 지식이 필요. 필요 없음 프로그래밍 기술.

비용: 비용 없음.

연락처 정보: 등록 시에 www.openhelix.com / cgi는 / webinar.cgi. 당신은 웹 세미나에 대한 URL과 이메일이 발송됩니다.

UCSC 생물 정보학 그룹에 대하여
UCSC 생물 정보학 그룹은 생명 과학 및 엔지니어링 센터의 일부입니다 (CBSE) 캘리포니아 대학, 산타 크루즈. 감독과 HHMI 수사관 데이빗 Haussler 과학자의 팀을 리드, 엔지니어와 연구에 학생과 포유 동물 및 모델 생물체의 genomes의 비교 분석. 연구 과학자 짐 켄트가 개발 및 유지 UCSC 게놈 브라우저 엔지니어링 팀을 헤드 (HTTP를://genome.ucsc.edu), 게놈 시퀀스의 그래픽 디스플레이 정렬 주석으로 과학자들은 전세계 수백의 작업을 통합하는 연구 도구. 게놈 브라우저 — 원래 인간 게놈의 초기 조립을 지원하기 위해 개발된 — 지금은 포유 동물 및 모델 생물체의 genomes의 다수에 대한 주석의 풍부한 기능 세트를. UCSC 생물 정보학 그룹 제공하기 위해 원래의 사명을 유지하기 위해 지속적으로 무료, 무제한 공용 액세스는 웹상의 데이터를 게놈으로.

소개 OpenHelix, LLC는.
OpenHelix, LLC는, 당신은 당신이 그것을 필요로 할 때 필요한 유전체학 지식을 제공합니다. OpenHelix 온라인 자동 실행 자습서를 제공합니다, 웹 세미나, 및 기관 및 기업 현장 연수의 가장 강력하고 인기있는 무료, 기반 웹, 공개적으로 액세스할 생물 정보학 자원. 또한, OpenHelix는 또한 포괄적인 제공하기 위해 리소스 공급자에 의해 계약을 체결합니다, 장기 교육 및 아웃리치 프로그램.

OpenHelix 시애틀에 본사를 가지고, 샌프란 시스코와 보스턴에 지사를. 더 자세한 정보는 www.openhelix.com이나 전화하여 찾을 수 있습니다 1-888-861-5051

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추가 수정: 여기에 대한 시간 전환 차트의 소개 세미나 그건 전세계 여러 지역에서 시간을 제공합니다: http://timeanddate.com/worldclock/fixedtime.html?msg=UCSC+Intro+Live+Online+Webinar&iso=20110524T14&p1=43&ah=1&am=15

새로운 BioMed 중앙 기능

OpenHelix과 중앙 BioMed로 가져 왔어요 :디. 우리가 정말 기능과 아이디어를 같은 (물론) 그리고 우리가 그것을 통과 줄 알았는데.

BioMed 중앙 (BMC는) 개방형 액세스 출판사입니다. BMC는 함께 OpenHelix가 출시와 함께 새로운 기능 최근 관련 게놈 자원 자습서에 BMC는 저널의 독자에게 적시에 액세스 권한을 부여하려면. BMC의에서 연구 문서를 읽을 때, 연구자들은 이제 게놈 자원과 도구의 많은 온라인 자습서에 대한 링크를 제공하는가하는 데 사용 또는 인용 문서. 링크는 OpenHelix 사이트에있는 훈련 방문 페이지로 직접 독자가 걸립니다. BMC는 개방형 액세스의 큰 선택을 높은 품질이 피어 연구 저널 검토한 결과, 많은 연구의 오늘 보도했다 사용 및 자원의 많은 OpenHelix의 열차를 인용. 연구팀은 지금 빨리 연구에 사용되는 데이터베이스 및 도구에 대한 교육을 찾을 수 있습니다. 예를 들어, 이 최근 문서 , 비 polyadenylated RNAs의 Genomewide의 특성, BMC의에서 게놈 생물학 포함하여 그들의 연구에서 사용되는 몇 가지 도구를 인용 지리적, 에도 외. 새로운 기능은 문서에서 이러한 인용을 발견하고 같은 이미지에서 볼 수있는 자원에 OpenHelix 자습서에 대한 링크를 나열합니다.

그것은 신문에 관련된 리소스에 대한 빠른 링크를 찾기 힘들 수 있습니다–인용 때로는 완전하지 않은가, 스나 사이트에 연결되어 있지.

우리는 연구자 간단하고 더 빨리 관련 중요한 게놈 자원에 대한 교육을 만들기 위해 여러 가지 방법으로이 기능을 확장할 계획을 가지고.

우리는 이미 이것에 대한 좋은 의견이 오긴했는데–좋은 생각!

@jytricker 좋은 생각! @BioMedCentral / OpenHelix 합작은 게놈 / 생물 정보학 도구에 코치 과학자들은 논문에서 언급한 것입니다 http://ow.ly/4eQbG

 

우리는 단어를이 프로그램을 중단… 각 튜토리얼 구입

우리는 일반적으로 OpenHelix 자습서 구입에 대해 구체적으로 블로그를하지 (우리는 보도 자료와 함께 할), 그것은 블로그의 목적은 아니에요, 하지만 난 정말까지 빠른 헤드를주고 싶어. 리소스 공급자가 훈련과 아웃리치을 투자했기 때문에 우리 자습서의 대부분은 최종 사용자에게 무료입니다. UCSC, 인코딩, GDP는, 보기, SBKB은하 그냥 몇 가지 예입니다. 우리 자습서의 대량 (카탈로그를 체크 아웃: 에 도달 100!) 뒤에 회원 가입 벽. 강사를위한, 교수 교육 게놈, 전원 학습자, 단체 및 기관, 구독 감각을 많이 만들. 가끔하지만, 개별 사용자는 하나 또는 두 개의 자원을 양성해야하고 그들의 필요가 충족됩니다. 우리는 그 사용자를위한 튜토리얼에 대한 개별적인 구매 기능을 추가했습니다.

당신이 가입하지 않은 경우, 당신은 새로운 녹색을 알 수 있습니다 “구매” 및 “구독하기” 버튼 (당신이 가입하는 경우, 이러한 버튼은 물론 나타나지 않습니다, 자습서는 무제한 액세스할 아르). 를 클릭하십시오 “구매” 버튼을 당신은 후 즉시 특정 튜토리얼에 대한 액세스 권한을 얻을 수 $28.50 구매 (Google Checkout을 통해, 무료 Google 계정이 필요합니다, 당신은 구글 이메일을 사용하는 경우, 그건 당신이 알 필요합니다). 당신은 지속됩니다 바로 액세스할 수있을 겁니다 3 구입 후 일. 무제한 사흘 동안 Flash 동영상에 액세스하고 슬라이드를 다운로드하는 기능을 제공합니다 그, 유인물과 연습.

다시, 당신을 볼 수 있습니다 여기에 우리의 목록에 자습서, 우리의 자원이나 검색 가정 및 검색 페이지. 리소스에 바로 입력 (또는 일반 주제) 당신은 검색 상자에 관심이있는. 우리는 자원에 대한 튜토리얼이있다면, '퍼즐있을 것입니다’ 검색 결과의 왼쪽에있는 아이콘. 그린은 후원과 무료 뜻, 빨간색은 가입으로 볼 수있다는 것을 의미합니다, 또는 개인 구매. 그냥 아이콘을 클릭 :디.

OH 뉴스 레터

OpenHelix은 지난 몇 년 동안 뉴스 레터를 가지고 있습니다. 우리는 관심이 가입자와 다른 사람에게 그것을 보내. 그것은 공공연한 비밀 약간의 :). 음, 에 (삼점의 카드) 올해 그것을 짜고 점령하고 최신 하나를 수행의 가운데 오전, 내가 블로그에 언급 줄 알았는데.

뉴스 레터 밖으로 나오는 사람 3-4 회. 우리는 주 우리의 인기하거나 재미있는 팁 몇을 강조, 우리가 추가한 새로운 자습서 최근에 업데이트된 것들에 대한 짧은 기사 및 업데이트 가입자를 작성. 그들은 오른쪽 칼럼에 팁 또는 OH에 계속한다면이 블로그의 일반 독자들은 이미 이미 많은 전쟁을 멈추는 것입니다, 하지만 도움말의 일부 자신을 생각나게하는 좋은 방법이 될 수 있습니다, 한 곳에서 우리가 과거에 업데이 트하거나 추가한 모든 자습서를 얻으려면 3-4 개월.

여기 구독할 수 있습니다 그리고 당신이 할 수 여기에 마지막 또는 이전 뉴스 레터보기. 새로운 몇 주에서 온다!

직원에서 더 많은 작업을 받으세요.. 집으로 보내

이것은 특히 관련 게놈 없습니다, 하지만 재미있고 OpenHelix에있는 여기 우리의 작업에 관련된. 우리는 세미 가상 회사입니다. 우리 과학자, 자신을 포함하여, 가정에서 풀타임으로 일을. 우리는 벨르 물리 사무실이 있나요, 경상 북도는 어디 CEO 및 지원 직원 업무, 하지만 우리의 나머지 부분 (메리를 포함한, 제니퍼와 나는 여기에 블로그에) 재택 근무.

그것은 나를 위해 조정되었습니다했지만 방법을 telecommute 학습 (작업에 물리적으로 별도의 장소를 찾는, 강성 루틴을, 내가 사용하는와는 '가지 할 일’ 시스템, 가족과 친구에 한 방울씩 떨어뜨 리다… 1,000 번.. 당신이 일하는 당신은이 건물에있다는 이유만으로 그걸 당신의 자유 시간이 아니에요, 측면과 기술.. 응 용 스카 이프!). 아직, 나는 고향에서 일하는 사랑. 그것은 아이를 키울 나에게있는 유연성을 제공합니다, 처음부터 요리사의 저녁 식사, 취미를 즐길 그것은 가스와 자동차 보수에 나한테 돈을 절약할 수. 사실, 그것이 아니었 으면 2 우리 딸이에 마일 드라이브’ 학교, 우리가 차를 필요 없을 테니까요. 단점 (동료와 작은 사회 시간, 등등) 그리고 사소한 쉽게 해결됩니다.

내가 telecommuting의 고체 옹호이다. 완료 바로 그것은 직원 일이구, 가족과 환경.

그것은 오랫동안이 다음 진술에 따라의: 그것은 또한 회사에 대한 좋은, 직원들이 더 일하고 싶어요? 그들을 집으로 보내 .

그것은 모든 작업 시간임을 밝혀 같은. BYU 연구원은 "브레이크 포인트를 계산,"그게, 포인트 어디에 25 근로자의 비율이 작품은 가족 생활을 방해하는 것을보고. 특정 시간 동안 사무실에서 모든 시간을 기록해야 할 사람들의, 이 브레이크 포인트에서 있었던 38 시간. 많은 풀타임 근로자 로그인 이후 40-45 주당 시간, 이것은 많은 사람들이 충돌을 기분 의미.

당신은 직원들에게 자신의 일정에 대한 유연성을 제공하는 경우, 그래도, 그리고 그들에게 가정에서 시간 중 일부를 작동하도록 옵션을 제공합니다, 브레이크 포인트가 때까지 공격하지 않습니다 57 시간. 그건 19 주당 더 시간 - 50 퍼센트 사무실 전용 노동자보다 더, 와 등가의 2.5 전체 일.

우리는 그것이 우리에게 돈을 절약할 수있는 것으로 나타났습니다. 작게 물리 발자국, 아니 사무실 임대, 등등. 하지만, 위의 링크된 그 연구에 따르면, 또한 직원에서 더 많은 실제 _work_를 얻을. 내가 그것에 대해 보증할 수있을 것 같아요. 제가 개인적으로 내가 부딪힌 거 같아요 내 “너무 일을 많이” 포인트 훨씬 나중에 난 사무실에서 일하는 경우보다 제가 출퇴근로를하곤했는데.

한 가지에 대한, 난 없어 30-90 분 이상의 통근 매일 일을 여행. 자유 시간 또는 작업 시간의 건전한 시간이나이있어. 그리고 난 융통성이 될 수 있기 때문에, 예제를 학교에서 우리 딸을 데리러위한 3:00 어떤 활동에 그녀를 데리고, 그것은 내 시간을 사용하는 방법에 많은 여지를 제공합니다, 작품은 덜 스트레스 만들기. 차례로 그, 일을 더 쉽게 할 수있게. 나 자신은 종종 아이가 침대에서 후 작업 찾기, 아니면 주말에 자유 시간을 가지고. 전시 - 더 - 직장인도 자주 할 수있다는 걸 알고, 하지만 나를 위해… 내가하고 싶을 때 더 자주하고 있어요, 그 “해야” 순간이 적은 종종.

난 telecommuting에서 판매 해요. 내 생각은, 많은 기업, 직원 및 가족… 환경, 이것은 윈 - 윈 - 윈 - 윈의 :디.

HatTip: 앤드류 설리반.

(그리고 공부는 BYU 연구자에 의해 수행되었다, 내 학부 모교 :/)

NCBI에서 교육

나는 새로운 지적하고 싶습니다 NCBI 교육 페이지. 많은 당신은 체크 아웃 원하는 것일 수도있다는. NCBI는 것입니다, 이 가을 시작, 그들이 전화를 두 일 교육 과정 일련의를 제공하는 디스커버리 워크샵. 2 년 전 그들은 끝난 NCBI 필드 가이드 워크샵, 그래서 이것은 환영 변화 보인다.

도 있습니다 웹 세미나. 연구 세미나는 특히 인기가 아니라는 것을 제안, 이들은 밖으로 회전하는 방법 그래서 제가 좀 궁금 해서요. 방법 -에 '가 있습니다’ 가이드, 문서, 커뮤니티, 교사 자원. 그것은 체크 아웃 색과도 꽤 좋은 사이트.

나는 또한을 지적하고 싶습니다 “추천 링크” 섹션. 같은 추가 교육 리소스에 대한 링크가 많이있다 콜드 스프링 하버의 돌런 DNA 학습 센터 그리고 훨씬 더. 그리고, 부수적으로 :), 우리의 무료 튜토리얼에 대한 링크 어떤보고 매우 반가웠어요. 당신은 그 확인해셔야, 우리는 이상이 10 PDB를 포함, SGKB, UCSC 게놈 브라우저, 은하, 여러 모델 생물 데이터베이스, 더.