标记档案: 尼安德特人

一周的视频提示: Neandertal Inheritance and Consequences

确定, it’s been a while since this was a regular feature. But I am still finding that I want to show some videos of science topics and software tools sometimes. So it may not be a regular feature, but I will be highlighting some videos that seem interesting to me for various reasons.

This video struck me because I recently gave a talk about the information from ancestral genomes and the influence of the DNA on us today (as well as how we visualize that). They use software that we’ve talked about before, PolyPhen上海对外贸易学院, in this analysis. And it would have been handy to have this as a resources to give out to the audience members, who were general public folks in a pub. I am impressed that a research team did this additional step of explaining their research in this way.

参考:

Dannemann, 米, Prüfer, 光, 瓦格纳, 答:, & 凯尔索, Ĵ. (2017). Functional implications of Neandertal introgression in modern humans 基因组生物学 18:61. 分类号: 10.1186/s13059-017-1181-7

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星期五SNPpets

This week’s SNPpets include real-time visualization of Ebola spread, precision medicine informatics, big capacity for whole genomes, “genetobollocks” for a new description of media coverage of genomics papers, Neanderal pathogenic variants, and re-examining old problems on a couple of matters.


欢迎来到我们的链接集合星期五功能: SNPpets. 一周之内,我们遇到了很多链接和读取,我们认为很有趣, 但不要到一个博客帖子. 在这里,他们是您的享受…


通过https://twitter.com/marimiya_tky/status/608055768181575680 also possible tip

现在我们都尼安德特人, 分析认为,我可以…

如果你没有阅读新闻, 对尼安德特人序列草图 (抑或是尼安德特人, 拼写检查前不会采取) 被释放,并在科学出版托达和. 有一种迷人的很多东西在那边. 还在读它. 当然,大新闻, 这就是飞的东西通过新闻, 是非洲以外的基因组 1-4% 尼安德特人. 这似乎要最终解决这个问题,是, 我们都有点尼安德特人,我们没有更换, 我们吸收他们的一些杂交. 也许因为这并不完全肯定,但一些外加剂回事. 随着 基因表达Razib指出, 它的速度有多快看迷人, 在数据面, 该模式已转移. (伟大的职位和讨论, 应该读它).

随着 Razib指出, 和 你可以阅读在UCSC公告, 的 UCSC基因组浏览器现在有数据草案 在基因组组装的hg18. 像 编码区等位基因的差异 数据, 选择性的扫描数据, 等. 随着尼安德特数据现正在UCSC基因组浏览器和其他数据源, 我们可以拉开数据, 分析它。. (你知道我会放在一个比较追踪我的个人基因组的时候我曾经得到它. 只是好奇亚知道).

(增值税, 有一个有趣的照片, 版权… 所以我不会在这里发布, 你可能想看看. 这里有一个有趣的故事有, 我们的尼安德特人的插图经过多年的发展,更人性化的’ 因为我们知道他们做的工具, 文化,现在已经… 是我们祖先的一部分…”)

我渴望去那里踢球,看看我能看到, 因为我相信很多科学家. 它也将在这迷人的未来世界快速大量数据. 我认为会有很多的范例,而转向了.

UCSC主要网站: http://genome.ucsc.edu 然后单击“尼安德特人从左侧的导航按钮.

古老的基因组: 尼安德特人

因此,, 昨天是 200周年纪念达尔文诞辰. 大量的庆祝活动和全国公共广播电台当天报道,包括周围几个这样的公告 UCSC的浏览器宣布他们v200th 提前一天的代码,以配合 (他们无法抗拒的巧合 :)). 这是中肯的另一项公告宣布,研究人员是在 马克斯普朗克进化人类学研究所 完成了对尼安德特人基因组序列草图. 由于只有约 63% 基因组实际上是覆盖 (3.7 涵盖亿个基点 3.2 亿碱基的基因组, 与重复), 当一个人宣布一 “草案” 可有点乱, 所以该名男子的是谁写的200周年 “人类的演化, 和选择性别的关系” 是一个很好的任何时间. 而且我们正在学习一些事情,比如, 尼安德特人的可能有体能的语言, 但作为成年人无法忍受牛奶 (不同意他们的消化). 这是一个草案,预计研究将在本月底发布年. 我们将报告当然,, 并链接到任何浏览器,他们可能会成立 :ð. 古老的基因组 是教我们一些东西.

说到这, 在探索馆, 在我美丽的城市优秀的科学博物馆, 有一个伟大的展览 (现场和网上) “如何知道的事情’ 如何科学著作. 这个展览是专门对人类和尼安德特人的DNA的起源 并在显着位置马克斯普朗克研究数据.