태그 아카이브: 네안데르탈인

주의 비디오 도움말: Neandertal Inheritance and Consequences

확인, it’s been a while since this was a regular feature. But I am still finding that I want to show some videos of science topics and software tools sometimes. So it may not be a regular feature, but I will be highlighting some videos that seem interesting to me for various reasons.

This video struck me because I recently gave a talk about the information from ancestral genomes and the influence of the DNA on us today (as well as how we visualize that). They use software that we’ve talked about before, PolyPhen엄밀히 조사하다, in this analysis. And it would have been handy to have this as a resources to give out to the audience members, who were general public folks in a pub. I am impressed that a research team did this additional step of explaining their research in this way.

참조:

Dannemann, 엠, Prüfer, 사장님, 와그너, 대답 :, & 켈소의, Kokocinski. (2017). Functional implications of Neandertal introgression in modern humans 게놈 생물학 18:61. 간접 자원부: 10.1186/s13059-017-1181-7

dna_cutting_with_scissors_hr-150x150

금요일 SNPpets

This week’s SNPpets include real-time visualization of Ebola spread, precision medicine informatics, big capacity for whole genomes, “genetobollocks” for a new description of media coverage of genomics papers, Neanderal pathogenic variants, and re-examining old problems on a couple of matters.


오신 것을 환영 금요일 기능 링크 모음: SNPpets. 일주일 동안 우리는 링크의 많은 가로질러 와서 우리가 흥미있는 것을 읽습니다, 하지만 블로그 게시물에 그것을 만들지 마. 여기에 그들은 당신의 즐거움을위한…


은 https://twitter.com/marimiya_tky/status/608055768181575680 also possible tip

우리 모두는 지금 네안데르탈인이야, 그리고 나도 그 사람 분석할 수 있습니다…

당신이 뉴스를 읽는되지 않은 경우, Neandertal의 초안 시퀀스 (아니면 네안데르탈인입니다, 맞춤법 검사는 이전을하지 않습니다) 릴리스되었습니다 과학에 발표된 도다를및. 매력적인 것들이 저기있다. 아직 못 읽어. 물론 가장 큰 뉴스, 물건이 뉴스를 통해 비행 먹으렴, 비 아프리카 genomes가되어 있습니다 1-4% 네안데르탈인. 이것은 결정적 질문을 해결하는 것 같다 예, 우리가 조금 네안데르탈인 있으며 우리는 그들을 대체하지 않았어, 우리는 어떤 interbreeding 그들을 흡수. 아닐지도 모르겠지만 완전히 것이 아니라 이들의 혼합물에가는대로. 로 유전자 표현의 Razib가 ​​포인트, 그것은 환상적인 모습 얼마나 빨리, 데이터의 얼굴에, 패러다임이 이동되었습니다. (좋은 게시물과 토론, 그것을 읽어야).

Razib이 포인트, 그리고 당신이 UCSC에서 발표에서 읽을 수 있습니다, the UCSC 게놈 브라우저는 이제 임시 데이터가 최대 hg18 게놈 어셈블리에. 같은 지역 allelic 차이를 코딩 데이터, 선택적 스위프 데이터, 등등. 네안데르탈인 데이터 이제 UCSC 게놈 브라우저 및 기타 데이터 소스에되는, 우리가 분열 시키려고 수있는 데이터, 그것을 분석할 수 있습니다.. (그리고 당신은 내가 지금까지 그것을 얻을 때 비교 트랙에 내 개인 게놈을 가하고있을거야 알아. 그냥 나중에 알고 호기심).

(부가 가치세, 재미있는 사진이 없습니다, 저작권… 그래서 내가 여기에 게시하지 않습니다, 당신이 체크 아웃 원하는 것일 수도. 재미있는 이야기가있어, 네안데르탈 인 우리의 그림 더 'humanizing 할 년 동안 진화 방법’ 우리는 그들이 도구를 만든 것을 배울 때, 문화를했다 그리고 지금… 우리 조상의 일부입니다…”)

내가 거기 플레이 가서 내가 볼 수 있는지 가려움증 오전, 내가로서 확실히 많은 과학자들이. 빨리 오는 데이터의 거대한 양의이 세상에서해야하는 것도 흥미 롭군요. 내가 패러다임 많은 잠시 동안 이동 될 것 같아요.

UCSC 주요 사이트: http://genome.ucsc.edu 및 왼쪽 탐색 버튼에서 Neandertal 클릭하십시오.

고대 Genomes: 네안데르탈인

그래서, 어제는 살 200다윈의 탄생 주년. 축제와 같은 몇 가지 공지 사항을 포함 그날 주변 NPR의 이야기를 많이 UCSC들은 v200th 브라우저 발표 너무 일찍으로 맞춰 하루 코드 (그들은 우연을 이​​기지 못했지 :)). 참시기 적절한 말이라고 또 다른 발표가 발표했다는 연구원 진화 인류학을위한 맥스 플랑크 연구소 있다 네안데르탈인 게놈의 초안 시퀀스를 완료. 이후에만 약 63% 게놈 실제로 적용입니다 (3.7 의 적용 억 bps 3.2 억 혈압의 게놈, duplications과), 하나는 발표 “초안” 조금은 임의의 수, 누가 쓴 사람의 만도 200 주년 “사람의 하강, 섹스 관련 및 선택” 어느만큼 좋​​은 시간입니다. 그리고 우리는 같은 몇 가지를 배우는, 네안데르탈인가 언어에 대한 실제 능력을 들었을 거예요, 하지만 성인 우유를 참을 수 없습니다 (그들의 소화에 동의하지 않았어). 이것은 초안을 예정이다 연구 년이 말에 출판될 것이다. 우리는 물론 거기에 다시 연락 드리겠습니다, 및 기타 브라우저에 링크들이 설정 수도 :디. 고대 genomes 우리에게 뭔가를 가르치고 아르.

의 말하는 것은 어떤, Exploratorium, 내 공정한 도시에서 우수 과학 박물관, 멋진 전시회를 여는데 (사이트 및 온라인에) '하는 방법에 우리는 세상을 알고’ 과학 작동 방식. 이 전시는 인간과 네안데르탈인 DNA의 기원에 특별히입니다 그리고 맥스 플랑크의 연구는 눈에 띄게 피규어.