Tag Archives: Néandertal

Astuce Vidéo de la semaine: Neandertal Inheritance and Consequences

Ok, it’s been a while since this was a regular feature. But I am still finding that I want to show some videos of science topics and software tools sometimes. So it may not be a regular feature, but I will be highlighting some videos that seem interesting to me for various reasons.

This video struck me because I recently gave a talk about the information from ancestral genomes and the influence of the DNA on us today (as well as how we visualize that). They use software that we’ve talked about before, PolyPhen et EIPD, in this analysis. And it would have been handy to have this as a resources to give out to the audience members, who were general public folks in a pub. I am impressed that a research team did this additional step of explaining their research in this way.

Référence:

Dannemann, M., Prüfer, K., Wagner, A., & Kelso, J. (2017). Functional implications of Neandertal introgression in modern humans Genome Biology 18:61. DOI: 10.1186/s13059-017-1181-7

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SNPpets vendredi

This week’s SNPpets include real-time visualization of Ebola spread, precision medicine informatics, big capacity for whole genomes, “genetobollocks” for a new description of media coverage of genomics papers, Neanderal pathogenic variants, and re-examining old problems on a couple of matters.


Bienvenue à notre collection vendredi lien fonction: SNPpets. Au cours de la semaine, nous avons rencontré beaucoup de liens et de lectures qui nous paraissent intéressants, mais ne pas se rendre à un billet de blog. Ici, ils sont pour votre plaisir…


https://twitter.com/marimiya_tky/status/608055768181575680 also possible tip

Nous sommes tous désormais de Neandertal, et je peux analyser ce…

Si vous n'avez pas lu les nouvelles, la séquence projet de Neandertal (ou est-il de Neandertal, vérification orthographique ne prendra pas l'ancien) a été libéré et publiée dans Science todaet. Il ya un tas de trucs fascinants là-bas. Pourtant la lecture. Bien sûr, les grandes nouvelles, les trucs des thats volant à travers les nouvelles, sont non-africains sont génomes 1-4% Néandertal. Cela semble régler la question de façon concluante que oui, nous sommes un peu de Neandertal et nous n'avons pas les remplacer, nous les avons absorbé avec certains croisements. Peut-être pas aussi complètement que cela, mais certainement quelques adjuvant passe. Comme Razib l'expression des gènes souligne, c'est fascinant de voir à quelle vitesse, dans le visage de données, le paradigme a changé. (grand poste et de discussion, devrait le lire).

Comme Razib souligne, et comme vous pouvez lire l'annonce à l'UCSC, l' UCSC Genome Browser a maintenant les données du projet dans l'assemblage du génome hg18. Comme les le codage des différences alléliques région des données, des données de balayage sélectif, etc. Avec les données de Neandertal maintenant dans le navigateur de génome UCSC et d'autres sources de données, nous pouvons séparer les données, l'analyser.. (et tu sais que je vais mettre mon génome personnel dans une bonne voie comparative lorsque j'ai jamais l'obtenir. Juste curieux tu sais).

(TVA, il ya une photo intéressante, copyright… je ne vais pas poster ici, vous pourriez vouloir vérifier. Il ya une histoire intéressante, comment nos illustrations de Neandertal ont évolué au fil des années pour être plus «humaniser’ que nous apprenons qu'ils ont fabriqué des outils, a la culture et maintenant… font partie de nos ancêtres…”)

Je suis une démangeaison d'aller jouer là-bas et voir ce que je vois, je suis sûr que beaucoup de scientifiques sont. Il est également fascinant d'être dans ce monde d'énormes quantités de données provenant rapidement. Je pense que beaucoup de paradigmes seront déplacer pendant un moment.

UCSC Site principal: http://genome.ucsc.edu et cliquez sur Neandertal de la navigation bouton gauche.

Génomes antique: Néandertal

Alors, Hier, c'était le 200e anniversaire de la naissance de Darwin. Beaucoup de festivités et d'histoires NPR entourant ce jour-là, y compris quelques annonces, comme UCSC annonçant leur navigateur v200th Code un jour plus tôt de manière à coïncider (ils ne pouvaient pas résister à la coïncidence :)). Une autre annonce qui a été à propos a été l'annonce que des chercheurs de l' Institut Max Planck d'anthropologie évolutive ont a terminé la séquence préliminaire du génome de Neandertal. Comme seulement 63% du génome est effectivement couverte (3.7 milliards bps couverte du 3.2 milliards pb du génome, avec des duplications), quand on annonce un “projet” peut être un peu arbitraire, de sorte que le 200e anniversaire de la de l'homme qui a écrit “The Descent of Man, et la sélection liée au sexe” est aussi bon moment que tout. Et nous apprenons quelques petites choses comme des, Neandertal a pu avoir la capacité physique pour la langue, mais ne pouvait pas supporter le lait que les adultes (pas d'accord avec leur digestion). Il est prévu un projet et la recherche seront publiés à la fin de cette année. Nous allons rendre compte que bien sûr, et un lien vers tous les navigateurs qu'ils pourraient être mise en place :D. Génomes antique nous apprennent certaines choses.

Parlant de ce qui, l'Exploratorium, un musée des sciences excellent dans ma ville équitable, a une grande exposition (sur le site et en ligne) sur la façon dont «nous savons que les choses’ et comment fonctionne la science. Cette exposition est spécialement sur les origines de l'être humain et l'ADN de Néandertal et la recherche au Max-Planck figure en bonne place.