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Vídeo Consejo de la semana: Neandertal Inheritance and Consequences

Ok, it’s been a while since this was a regular feature. But I am still finding that I want to show some videos of science topics and software tools sometimes. So it may not be a regular feature, but I will be highlighting some videos that seem interesting to me for various reasons.

This video struck me because I recently gave a talk about the information from ancestral genomes and the influence of the DNA on us today (as well as how we visualize that). They use software that we’ve talked about before, PolyPhen y SIFT, in this analysis. And it would have been handy to have this as a resources to give out to the audience members, who were general public folks in a pub. I am impressed that a research team did this additional step of explaining their research in this way.

De referencia:

Dannemann, M., Prüfer, K., Wagner, A., & Kelso, J. (2017). Functional implications of Neandertal introgression in modern humans Genome Biology 18:61. DOI: 10.1186/s13059-017-1181-7

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Viernes SNPpets

This week’s SNPpets include real-time visualization of Ebola spread, precision medicine informatics, big capacity for whole genomes, “genetobollocks” for a new description of media coverage of genomics papers, Neanderal pathogenic variants, and re-examining old problems on a couple of matters.


Bienvenido a nuestra colección de enlaces Viernes función: SNPpets. Durante la semana nos encontramos con un montón de enlaces y lecturas que nos parecen interesantes, pero no llegar a una entrada de blog. Aquí están para su disfrute…


https://twitter.com/marimiya_tky/status/608055768181575680 also possible tip

Todos estamos ahora Neanderthal, y puedo analizar que…

Si usted no ha estado leyendo las noticias, el proyecto de secuencia del Neandertal (o es hombre de Neandertal, El corrector ortográfico no se llevará a la antigua) fue lanzado y publicado en Science Today. Hay un montón de cosas fascinantes allá. Aún así la lectura. Por supuesto, la gran noticia, las cosas eso es volar a través de las noticias, no son africanos genomas son 1-4% Neanderthal. Esto parece poner punto final a la pregunta de que sí, estamos un poco neandertal y no los sustituirá, les absorbe con algunos mestizaje. Tal vez no sea tan completa como eso, pero sin duda alguna mezcla pasando. Como Razib de la expresión génica señala, Es fascinante ver con qué rapidez, en la cara de los datos, el paradigma ha cambiado. (gran post y el debate, deben leerlo).

Como Razib señala, y como se puede leer en el anuncio de la UCSC, la UCSC Genome Browser ahora tiene los datos de proyecto en la asamblea hg18 genoma. Al igual que el codificación de las diferencias alélicas región datos, de datos selectiva de barrido, etc. Con los datos de Neanderthal ahora en la UCSC Genome Browser y otras fuentes de datos, podemos separar los datos, analizarla.. (y usted sabe que va a poner mi genoma personal en una pista comparativa cuando alguna vez lo harán. Sólo por curiosidad ¿sabes).

(IVA, hay una foto interesante, derechos de autor… así que no voy a publicar aquí, es posible que desee ver. Hay una historia interesante que, cómo nuestras ilustraciones de Neanderthal han evolucionado a lo largo de los años para ser más "humanizar’ como nos enteramos de que se fabricaron herramientas, tenía la cultura y ahora… son parte de nuestros ancestros…”)

Estoy con ganas de ir a jugar allí y ver lo que puedo ver, como estoy seguro que muchos científicos están. También es fascinante estar en este mundo de enormes cantidades de datos viene pronto. Creo que muchos de los paradigmas se cambio por un tiempo.

UCSC Página principal: http://genome.ucsc.edu y haga clic en el botón izquierdo del Neandertal a partir de la navegación.

Genomas antiguos: Neanderthal

Así que, Ayer fue el 200º aniversario del nacimiento de Darwin. Muchas fiestas e historias NPR rodean ese día incluyendo algunos anuncios como el UCSC anunciar su navegador v200th código de un día de anticipación a fin de coincidir (que no pudo resistir la coincidencia :)). Otro anuncio que fue a propósito fue el anuncio de que los investigadores de la Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva tener terminado el proyecto de secuencia del genoma del Neandertal. Ya que sólo 63% del genoma es realmente cubiertos (3.7 millones de bps cubierta de la 3.2 mil millones de pares de bases del genoma, con duplicaciones), cuando se anuncia una “borrador” puede ser un poco arbitrario, por lo que el 200 aniversario de la del hombre que escribió “El origen del hombre, y la selección en relación al sexo” es un momento tan bueno como cualquier otro. Y estamos aprendiendo algunas cosas como, Neanderthal pudo haber tenido la capacidad física para el lenguaje, pero no podía soportar la leche en la edad adulta (no estaba de acuerdo con su digestión). Se espera un proyecto de investigación y se publicará a finales de este año. Informaremos acerca de que, por supuesto,, y enlace a cualquier navegador que podría ser la creación de :D. Genomas antiguos nos están enseñando algunas cosas.

Hablando de lo cual, el Exploratorium, un museo de la ciencia excelente en mi hermosa ciudad, tiene una gran exposición (en el sitio y en línea) en el cómo 'sabemos que las cosas’ y cómo funciona la ciencia. Esta exposición es específicamente sobre los orígenes del ser humano y el ADN neandertal y la investigación en el Max Planck ocupa un lugar destacado.