Tag Archives: Neandertaler

Video Tipp der Woche: Neandertal Inheritance and Consequences

OK, es ist schon eine Weile her, seit dies ein fester Bestandteil war,,en,Aber ich finde immer noch, dass ich manchmal ein paar Videos von naturwissenschaftlichen Themen und Software-Tool zeigen will,,en. But I am still finding that I want to show some videos of science topics and software tools sometimes. So it may not be a regular feature, but I will be highlighting some videos that seem interesting to me for various reasons.

This video struck me because I recently gave a talk about the information from ancestral genomes and the influence of the DNA on us today (as well as how we visualize that). They use software that we’ve talked about before, PolyPhen und SIFT, in this analysis. And it would have been handy to have this as a resources to give out to the audience members, who were general public folks in a pub. I am impressed that a research team did this additional step of explaining their research in this way.

Referenz:

Dannemann, M., Prüfer, K., Wagner, A., & Kelso, J. (2017). Functional implications of Neandertal introgression in modern humans Genome Biology 18:61. DOI: 10.1186/s13059-017-1181-7

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Freitag SNPpets

This week’s SNPpets include real-time visualization of Ebola spread, precision medicine informatics, big capacity for whole genomes, “genetobollocks” for a new description of media coverage of genomics papers, Neanderal pathogenic variants, and re-examining old problems on a couple of matters.


Herzlich Willkommen auf unserer Friday Feature Linksammlung: SNPpets. Während der Woche kommen wir auf eine Vielzahl von Links und liest, dass wir denken, sind interessant, sondern machen es nicht zu einem Blog-Eintrag. Hier sind sie für Ihr Vergnügen…


https://twitter.com/marimiya_tky/status/608055768181575680 also possible tip

Wir sind alle Neandertaler jetzt, und ich kann analysieren, dass…

Wenn Sie nicht die Nachrichten zu lesen, des Genoms des Neandertalers (oder ist es Neanderthal, Rechtschreibprüfung wird nicht an die ehemaligen) veröffentlicht wurde und in der Wissenschaft toda veröffentlichtund. Es gibt eine Menge faszinierender Sachen dort. Noch lesen. Natürlich ist die große Neuigkeit, das Zeug das ist über die Nachricht fliegen, sind nicht-afrikanischen Genomen sind 1-4% Neandertaler. Dies scheint schlüssig regeln die Frage, die ja, wir sind ein bisschen Neandertaler und wir wussten nicht ersetzen, Wir absorbiert sie mit einigen Kreuzungen. Vielleicht nicht so ganz wie das aber definitiv einige Beimischung los. Als Razib der Genexpression weist darauf hin,, Es ist faszinierend zu beobachten, wie schnell, in das Gesicht von Daten, das Paradigma hat sich verschoben. (großen Beitrag und Diskussion, lesen sollte es).

Als Razib weist darauf hin,, und als Sie können in der Ankündigung auf UCSC lesen, der UCSC Genome Browser verfügt nun über den Entwurf von Daten bis in die HG18 Genom Montage. Wie die kodierende Region allelischen Unterschiede Daten, Selektionsschub Daten, usw.. Mit dem Neanderthal-Daten jetzt in der UCSC Genome Browser und anderen Datenquellen, können wir auseinander ziehen, dass die Daten, analysieren.. (und du weißt, ich werde Putting meine persönliche Genom in einer vergleichenden Spur, wenn ich es jemals. Einfach nur neugierig ya know).

(Mehrwertsteuer, gibt es eine interessante Foto, urheberrechtlich geschützt… so werde ich nicht hier posten, möchten Sie vielleicht Besuche. Es ist eine interessante Geschichte gibt es, wie unsere Abbildungen von Neanderthal haben im Laufe der Jahre entwickelt zu sein 'Humanisierung’ wie wir erfahren, dass sie Werkzeuge aus, hatte Kultur und jetzt… sind Teil unserer Vorfahren…”)

Ich bin Juckreiz gehen dort spielen und sehen, was ich sehen kann, da ich sicher bin, viele Wissenschaftler sind. Es ist auch faszinierend, in dieser Welt der große Mengen an Daten, die schnell. Ich denke, eine Menge von Paradigmen für eine Weile zu verlagern.

UCSC Hauptseite: http://genome.ucsc.edu und klicken Sie auf Neandertal von links Navigationstaste.

Alte Genome: Neandertaler

So, gestern war der 200Jubiläum von Darwins Geburt. Viele Feste und NPR Geschichten rund um diesen Tag mit ein paar Ansagen wie UCSC Bekanntgabe ihrer v200th Browser Code einen Tag zu früh, um zusammen (sie konnte nicht widerstehen, den Zufall :)). Eine weitere Ankündigung, dass apropos war die Ankündigung, dass Forscher an der Max-Planck-Institut für evolutionäre Anthropologie haben beendete den Entwurf Sequenz des Neandertaler-Genoms. Da nur etwa 63% des Genoms ist tatsächlich abgedeckt (3.7 Milliarden bps der abgedeckten 3.2 Milliarden bp Genom, mit Verdoppelungen), wenn man kündigt eine “Entwurf” kann ein wenig willkürlich, so den 200. Jahrestag der des Mannes, der schrieb “The Descent of Man, und die Auswahl in Bezug auf Sex” ist ein guter Zeitpunkt, als jeder. Und wir lernen ein paar Dinge, wie, Neandertalers hätten möglicherweise dazu geführt körperliche Fähigkeit zur Sprache, aber konnte es nicht ertragen Milch als Erwachsene (nicht mit ihrer Verdauung einverstanden). Es wird erwartet, einen Entwurf und Forschung an der Ende dieses Jahres veröffentlicht werden. Wir werden uns auf, dass natürlich berichten, und Link zu einem Browser sie auch sein mögen Einrichtung :D. Alte Genome lehren uns einige Dinge.

Apropos, das Exploratorium, ein hervorragendes wissenschaftliches Museum in meiner schönen Stadt, hat eine große Ausstellung (vor Ort und online) auf das "Wie wir wissen, was’ und wie Wissenschaft funktioniert. Diese Ausstellung ist speziell auf die Ursprünge des Menschen und Neandertaler-DNA und die Forschung am Max-Planck prominent.