الوسم المحفوظات: نكبي

ProSplign

تلميح فيديو للأسبوع: ProSplign in NCBI’s Genome Workbench

ProSplign

There are many tools at نكبي, with a huge range of functions. أدب, تسلسل البيانات, الاختلافات, بنية البروتين, chemicals and bioassays, وأكثر. It’s hard to keep track of what’s available. Their video tutorials are helping me to be aware of new tools, and new features within existing tools. لنصيحة هذا الأسبوع من الأسبوع, we’ll look at their recent video for ProSplign. It’s a tool that will help you align protein information to genomic sequences.

على الرغم من أن الجينوم منضدة itself has been around for a while (we featured it as a tip it first in 2013), it is constantly underdevelopment, and new features are available regularly. And although this tip focuses on how to use the ProSplign piece, if you haven’t used it much it will help you to understand how a number of tools within the Workbench can be accessed. You can also see that Splign is available in the tool list–which is another NCBI tool for a similar type of process, but with mRNA sequences as the focus.

If you want to have a text-based type of walk-through instead, there is a page that will take you through the features (see the quick links below). And there are other videos that will help you to explore the Genome Workbench features as well–there’s a handy special playlist of just those الفيديو. Subscribe to their YouTube channel for notices of their new items.

ربط سريع:

NCBI في الجينوم منضدة: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/gbench/

Text-based tutorial page: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/gbench/tutorial13/

المراجع:

كابوستين, Y., سوفوروف, أ., Tatusova, ت., & ليبمان, D. (2008). Splign: algorithms for computing spliced alignments with identification of paralogs Biology Direct, 3 (1) دوى: 10.1186/1745-6150-3-20

NCBI staff (2016). قاعدة بيانات الموارد من المركز الوطني لمعلومات التقنية الحيوية أبحاث الأحماض النووية, 44 (D1) دوى: 10.1093/nar/gkv1290

Viral Genomes at NCBI

تلميح فيديو للأسبوع: Viral Resources at NCBI (including new #ZikaResearch module)

Viral Genomes at NCBIIt would be hard to escape hearing and reading about the recent drama about the Zika virus. But in terms of viral genomics, that only serves to highlight how important it is to deliver quality sequence information for researchers. So in a timely coincidence, a recent lecture for the CDC on the Viral Resources at NCBI was just made available.

The lecture by Rodney Brister provides an overview of the features of the site and explores ways to access the data with some tools they’ve had in place for a long time. He shows ways to quickly get to family members. Then he described a newer direction that they are taking that includes a separate feature accessed from the same homepage called the Virus Variation Resource (starts ~11min). If you click through you’ll see that there are modules for various viruses–و Zika module just became available last week. So you can find sequences collected there, and also links to related health resources like the WHO and CDC relevant pages. (That’s not shown in the webinar, which was recorded in December 2015). He shows a dengue example that’s got some additional features too.

هناك أيضا Retrovirus Resource متاح (~25min in), which offers “specialized tools for the analysis of retroviral proteins and genomes”. And that’s the place to go if you want the HIV-1 specific module, it’s not with the others that I mentioned before.

It’s longer than our typical tips–but it’s worth exploring if you want to refine your skills at quickly getting to virus data and tools. Just a quick word about a question they had towards the end–about bacteriophage resources. There’s a resource I particularly like for phages, التي يمكن أن تجد هنا: المتشعب://www.phisite.org .

ملاحظة خاصة: if you intend to use the AmazonAWS services for any viral genome analysis, you should be aware of this.

وصلات سريعة:

Viral Resources at NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/viruses/

Virus Variation Resource: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/viruses/variation/

Zika module: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/viruses/variation/Zika/

مرجع:

القصور, ج., Ako-adjei, د., كيف, Y., & Blinkova, و. (2014). NCBI Viral Genomes Resource أبحاث الأحماض النووية, 43 (D1) دوى: 10.1093/nar/gku1207

SNPpets_2

الجمعة SNPpets

This week’s SNPpets include a range of things, from Pardis Sabeti’s recovery from a serious accident to tardigrade genome drama. There are new databases and tools such as the GMO sequence tracker in the EU, to new uses of tools such as عامل الميناء, لاستكشاف. Reports of a serious BLAST bug. A look at common spreadsheet formatting mistakes and some solutions. It’s not a gene-editing moratorium. وأكثر من ذلك.


SNPpets_2ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


ncbi_logo_black

تلميح فيديو للأسبوع: Explore Gene Pages at NCBI with Variation and Expression Information

نكبي has produced some of the most in-depth and reliable bioinformatic tools, in large part because they’ve been building them since the earliest days of the genomics era. ncbi_logo_black I once noted that I remember the oldest web interface, because it was one of the first places that I went for computational tools back in the day. Check out my post here with some of their older interfaces. I remember all of them.

But they don’t rest on their laurels. NCBI teams are always adding new tools, new features, and new data. أحيانا, رغم أن, I think that people take them for granted. Or they only keep re-visiting things they know. So recently they asked me to do a walk-through video about how I use the tools, so that I can show people ways they can go further than they might realize. This week’s Video Tip of the Week shows how I can add and explore a lot of data on a Gene page, to examine additional features: variations and expression data, right in the sequence viewer. A lot of people may not even be aware these tracks exist.

This video provides a walk-through of how to explore variation data and expression data from Gene pages, using the sequence viewer that’s embedded right on the page. Enhance your understanding of your genes of interest quickly using these additional track options.

I hope this demonstrates how you can add more information to your genes of interest from gene pages, which you might already use. But now you can use them better. You can take advantage of the great depth at NCBI, while staying up-to-date on the tools.

Speaking of staying up-to-date, which is a big need in this field: you should definitely keep an eye out for new features from NCBI. My favorite way is the اعلان قائمة بريدية, because it has details of new stuff, بينرس القادمة, البيانات الاقتصادية, الخ. But you can also watch their blog and twitter for new information all the time. They’ve been doing a lot of outreach–بينرس, quick videos, وأكثر. You should sign up to be notified, so you can stay current with the best data and tools. راجع their learning/webinars pages to see what I mean.

We are planning another video, and we’d love any feedback you have on this one.

وصلات سريعة:

NCBI Gene (subject of the video): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/

NCBI-announce mailing list: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mailman/listinfo/ncbi-announce

NCBI Insights blog: المتشعب://ncbiinsights.ncbi.nlm.nih.gov

NCBI twitter: @ NCBI

Learn (see webinars link): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/learn.shtml

NCBI YouTube channel: https://www.youtube.com/channel/UCvJHVo5xGSKejBbBj0A5AyQ

المراجع:

NCBI Resource Coordinators (2014). قاعدة بيانات الموارد من المركز الوطني لمعلومات التقنية الحيوية أبحاث الأحماض النووية, 43 (D1) دوى: 10.1093/nar/gku1130

إفشاء: This video was sponsored and completed under contract to NCBI.

الجمعة SNPpets

This week’s SNPpets include The Economist and C&EN cover gene editing in different but useful ways, new software for metagenomics, stranded RNA-Seq, the new CDC Public Health Genomics Knowledge Base, مجلس الحبوب العراقي ورقة, عامل الميناء getting attention in biology, FDA precision medicine workshops, a nice popular press version of the ExAc (Exome Aggregate Consortium) قصة, and the heresy of Keith Robison who doesn’t hate Excel enough.


ترحيب لدينا ميزة جمع الجمعة الارتباط: SNPpets. خلال الأسبوع صادفنا الكثير من الروابط والقراءات التي نعتقد أنها مثيرة للاهتمام, ولكن لا تجعل من لبلوق وظيفة. ها هم لمتعتك…


HTTPS://twitter.com/chris_dag/status/641672663493033984

NCBI على عقد لمدة يومين الجينوم هاكاثون في يناير

لأن هذا جاء على بريدي الإلكتروني يوم الأربعاء قبل عطلة, يبدو لي أن بعض الناس قد تفوت الذين قد يرغبون في حضور. لذلك أردت فقط لتعزيز إشارة قليلا من خلال إعادة إرساله من. وجاء ذلك من NCBI إعلان القائمة البريدية إذا كنت تريد أن ترى كل شيء, أنا excerpting سوى بعض من هنا. وهو يحتوي على قطعة تطبيق, FYI.

من 05-07 يناير, سوف NCBI استضافة هاكاثون علم الجينوم التركيز على تحليل متقدمة المعلوماتية الحيوية من البيانات تسلسل الجيل القادم. هذا الحدث هو للطلاب, الباحثني من حملة الدكتوراه والمحققين الذين يعملون بالفعل في استخدام خطوط الأنابيب لتحليلات الجينومية من البيانات تسلسل الجيل القادم. مجموعات عمل 5-6 وسيتم تشكيل الأفراد لتسلسل الحمض النووي / multiomics, تسلسل الحمض النووي الريبي., metagenomics وEpigenomics. وهذه المجموعات بناء خطوط أنابيب لتحليل مجموعات البيانات الكبيرة ضمن البنية التحتية السحابية.

منظمة:
بعد جلسة التنظيمية الأساسية, سوف تنفق فرق 2.5 أيام تحليل مجموعة صعبة من المشاكل العلمية ذات الصلة لمجموعة من قواعد البيانات. سيقوم الطلاب تحليل والجمع بين مجموعات البيانات من أجل العمل على هذه المشاكل. هذا بالطبع سوف تجري في الحرم الجامعي الرئيسي NIH في بيثيسدا, ميريلاند.

مجموعات البيانات:
سوف مجموعات البيانات تأتي من المستودعات العامة يضم في NCBI. خلال, سوف الطلاب لديهم فرصة لتشمل مجموعات البيانات وأدوات أخرى لتحليل. يرجى الملاحظة, إذا كنت تستخدم البيانات الخاصة بك أثناء, نطلب منك تقديمها إلى قاعدة بيانات عامة خلال ستة أشهر من نهاية الحدث.

المنتجات:
جميع خطوط الأنابيب وغيرها من الكتابات, وستضاف البرمجيات والبرامج ولدت في هذه الدورة إلى مستودع جيثب العام مصممة لهذا الغرض. مخطوطة توضح تصميم هاكاثون وdescripting عمليات مشارك, وسيتم تقديم المنتجات والنتائج العلمية لمجلة المناسبة.

تطبيق:
لتطبيق, أكمل النموذج أدناه مرتبطة (ما يقرب من 10-15 دقيقة لكي يكتمل). التطبيقات هي 1ST يرجع ديسمبر كانون الاول 05:00 EST.

وسيتم اختيار المشاركين من بين مجموعة من المتقدمين; وستعطى الأولوية للطلاب مسبق في حال التعادل. سيتم إخطار المتقدمين المقبولين في 10 ديسمبر من 09:00 EST, ولها حتى 12 ديسمبر عند الظهيرة لتأكيد مشاركتهم. يرجى إدراج عنوان بريدك رصدها, في حالة وجود أسئلة المتابعة.

[بعض الاشياء إزالة هنا, مع متطلبات, قبل reqs, وبعض التفاصيل الأخرى على الاشياء الحدث الفعلي. انظر النسخة الكاملة هنا.]

* علم الجينوم استمارة الطلب هاكاثون: https://docs.google.com/forms/d/1isJT0Ns-5MHX8mH4xQnDEFbhlu4HombXspQQaADQoec/viewform

هاك بعيدا.

تلميح فيديو للأسبوع: NCBI تباين عارض

الناس في NCBI استضافت مؤخرا الويبينار التي تغطي عددا من الموارد: GTR, ClinVar, و MedGen. كان مقدمة لطيفة لهذه الموارد باستخدام دراسة حالة لاستكشاف المعلومات حول طفل يبلغ من العمر 9 سنوات الذين هم في حاجة إلى الحصول على إذن للمشاركة في الألعاب الرياضية. ذلك أنها تتبع مسار بعض التفاصيل عن هذا الطفل عبر مختلف الموارد في NCBI لاظهار ما يمكن أن تتعلم في مواقع مختلفة.

وكنت آمل أن التسجيل سوف تصبح متاحة بحيث يمكن أن يكون بلاغ الثلاثي الأسبوع, لكنني لم أر أي إعلانات منه; سوف ترقب وتسليط الضوء عليه في المستقبل إذا لم. أدناه لقد المشار إليه أيضا ورقة أن يغطي بعض من نفس الأرض كما أن الويبينار. لكن في الوقت نفسه أنها أيضا أن أضيف مؤخرا شريط فيديو قصير جديد حول عارض التغيير التي وجدت في متناول يدي فضلا. حتى لا تكون غيض الفيديو هذا الأسبوع.

ولا سيما اعجبني الطريقة يمكنك بسهولة تحديد اكسون التركيز على, مع فقاعات صغيرة بالقرب من أعلى. لم يكن ذلك واضحا لي في البداية. غالبا ما يسألني الناس عن طرق مفيد للتركيز على تفاصيل من اكسون واحد.

بالإضافة إلى هذا الفيديو, وسوف توفر أيضا شاشة الحد الأقصى من واحدة من الشرائح من الويبينار يعد أن ترتبط الموارد ذات الصلة حول نكبي. إذا لم تكن قد سحبه هذه الأدوات المرتبطة كنت تريد أن ننظر إليها كذلك. هناك الكثير من الأدوات المتاحة رائع وانهم دائما إضافة ميزات جديدة مفيدة. متابعتها على التغريد للإعلانات حول أدواتهم والتدريب–كيف لي ان البقاء على رأس بنود جديدة.

NCBI webinar sitesوصلات سريعة:

تباين عارض: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/view/

MedGen: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/medgen

GTR: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gtr/

ClinVar: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/

مرجع:

اندروم M.J., G. R. رايلي, في. جانغ, في. S. روبنشتاين, D. M. كنيسة & D. R. Maglottقاعدة بيانات الموارد من المركز الوطني لمعلومات التقنية الحيوية أبحاث الأحماض النووية دوى: 10.1093/nar/gkr1184 (2014). ClinVar: الأرشيف العام للعلاقات بين اختلاف النمط الظاهري وتسلسل الإنسان, أبحاث الأحماض النووية, 42 (D1) D980-D985. دوى: http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkt1113

تلميح فيديو للأسبوع: NCBI تسلسل عارض PDF تصدير

وقبل بضعة أسابيع يعود فعلنا ورشة عمل حول UCSC متصفح الجينوم, وسئلت سؤالا نرى في كثير من الأحيان إلى حد ما: هل هناك طريقة لتصدير عرض المتصفح الذي حددته مع مسارات محددة, مرشحات, المناطق, الخ? الناس قد تريد أن يكون لها سجل من وجهة نظرهم حسب الطلب في دفتر المختبر, أو استخدامه للتدريس, أو ربما في ندوة–أو بالطبع لنشر الملاحظات رهيبة في المجلات.

معظم الوقت أنا فقط أخذ لقطات الشاشة من ما أحتاج مع أداة القبض على الشاشة (قناعتي الشخصية المفضلة هي بعقبة-IT من برنامج TechSmith). ولكن قد تكون هناك أوقات كنت تريد شيئا قليلا أثقل من الرسوم الجمركية. إذا كنت تنوي القيام به ملصق, أو تقديمه للنشر, مثلا, قد ترغب إصدار بوستسكريبت طيفة يمكنك العمل مع ومواصلة تحرير. في UCSC, طريقة للقيام بذلك هي مع “رأي” خيار القائمة هنا للPDF / PS:

Export the browser image to a file for further editing or use.

تصدير صورة المتصفح إلى ملف لمزيد من التحرير أو استخدام.

عندما تحصل على ملف, يمكنك أن تأخذ أسفل واستخدام أدوات أدوبي الرسومات إذا كان لديك لهم, أو حرة مفتوحة المصدر واحد مثل إنكسكيب. يمكنك تغيير الألوان, حذف الاشياء, إضافة المزيد من الشروح, الخ.

لذلك عندما رأيت أن هناك وظيفة مماثلة مع نكبي'ق تسلسل عارض أداة, فكرت وأود أن أذكر أنه كذلك. لديهم شريط فيديو لطيفة واضحا أن يوضح كيفية إنجاز الحصول على صورة من عارض في ملف و.

لمحاولة هذا بنفسك على الملف عينة أظهروا, يمكنك انتقل إلى NC_000022.10 في قاعدة البيانات النوكليوتيدات. من تلك الصفحة, فوق “الرسومات” الرابط كما هو موضح هنا:

Click the "Graphics" link on the page to open the Sequence Viewer.

فوق “الرسومات” ربط على الصفحة لفتح عارض تسلسل.

بعد الحصول على تسلسل المشاهد, اتبع الإرشادات تماما كما أنه يلعب في الفيديو يوتيوب. انها جميلة على التوالي إلى الأمام–فقط احترس فوق القائمة اليمنى لملفات PDF.

إذا كنت لم تستخدم NCBI تسلسل عارض الكثير, يجب عليك بالتأكيد تحقق من ذلك. هناك بعض أشرطة الفيديو المفيدة الأخرى لمزيد من الميزات وكذلك. وميزة أخرى أنيق هو أنه يمكنك تضمين المشاهد تسلسل في صفحات الويب الخاصة بك.

كل من المتصفحات الجينوم تحتوي على مزايا ووظائف مختلفة, وأنه من الجيد أن نعرف أن هناك استراتيجيات مختلفة لإنجاز المهام التي قد تحتاج إلى الحصول على القيام به.

وصلات سريعة:

موقع عارض تسلسل المتشعب://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/sviewer/

أشرطة الفيديو: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/sviewer/videos/

المراجع:

Karolchik D., الحلاق G.P., كاسبر J., كلوسون H., كلاين الشر ق, Diekhans M., Dreszer T.R., فوجيتا P.A., Guruvadoo L. & Haeussler M. & (2013). مستعرض قاعدة بيانات الجينوم UCSC: 2014 التحديث, أبحاث الأحماض النووية, 42 (D1) D764-D770. دوى:

أكلاند A., أغاروال R., باريت ت., بيك J., بنسون D.A., Bollin C., بولتون E., براينت S.H., Canese K. & الكنيسة D.M. & (2013). قاعدة بيانات الموارد من المركز الوطني لمعلومات التقنية الحيوية, أبحاث الأحماض النووية, 42 (D1) D7-D17. دوى:

عتيق الزي (أو ربما “كلاسيكي”) تقاعد UCSC المتصفحات الجينوم

الجميع هو مريح جدا مع مفهوم غير القياسية ولكن يشيع استخدامها الكلب سنوات باعتبارها وسيلة لمقارنة بحياة البشر. عشاق السيارات لديها التصنيف للأعمار من السيارات. ولكن لقد كنت جالسا هنا أتساءل ما ينبغي أن يكون نطاق الجينوم متصفح سنوات. لقد تم التفكير فيه بسبب الإعلان الأخير على لائحة UCSC في اليوم الآخر:

تغيير في الوصول التصور لجمعيات القديمة

مرحبا بالجميع!

أكثر من الماضي 12 سنوات ونحن قد بذلت جهودا للحفاظ على التصور القديم العديد من, جمعيات المؤرشفة على الخادم لدينا في الأرشيف المتشعب://الجينوم archive.cse.ucsc.edu /, بالإضافة إلى توفير وصول التحميل إلى مجموعات البيانات المرتبطة. للأسف, هذا التصور لم تعد مستدامة للجمعيات قديمة جدا بسبب العديد من التغييرات في برنامج متصفح الجينوم كما أنها قد نضجت. ولذلك، فإننا الحد من فرص الحصول على بعض الجمعيات القديمة لتنزيل البيانات فقط, ويتم الاعلان عن اغلاق الخادم أرشيفنا. وسوف نستمر في تقديم الجينوم وصول المتصفح لل 4 الجمعيات الإنسان معظم الحالية, وعلى الأقل 2 جمعيات معظم الحالية لجميع الكائنات الأخرى مع بعض الاستثناءات. نحن سيوقف الدعم التصور لدينا لجميع الجمعيات الأخرى القديمة, ولكن سوف تستمر لجعل مجموعات هذه البيانات متاحة على خوادم التنزيل الخاص بنا. جمعيات حاليا على خادم أرشيفنا الذي قمنا توقف الدعم التصور تشمل في وقت مبكر مسودات الجمعية الإنسان, HG4, hg5, hg6, hg7, hg8, HG10, hg11, hg12, hg13, hg15, RN1, RN2, MM1, MM2, MM3, MM4, MM5, rheMac1, bosTau1, CE1, danRer1, وdanRer2. تم إضافة روابط للبيانات والشروح المرتبطة بهذه الجمعيات في الأماكن المناسبة على صفحة التحميل لدينا في المتشعب://hgdownload.soe.ucsc.ايدو /. يرجى الاتصال بنا إذا كان لديك صعوبة في تحديد موقع مجموعة بيانات من الفائدة.

ماثيو Speir
الجينوم UCSC المعلوماتية الحيوية المجموعة

A view of the UCSC Genome Browser in the early days, ~2004.

منظر لمتصفح الجينوم UCSC في الأيام الأولى, ~ 2004.

أنا متأكد من أن لا يتم استخدام إصدارات المتصفح كثيرا بعد الآن, ولكنه كان شيئا كنت بحاجة ليكون على بينة من. في ورش العمل لدينا وأذكر أن الإصدارات القديمة كانت متاحة من “أرشيف” التنقل على الصفحة المقصودة, ولكن ذلك سوف يكون قد انتهى الآن. أحيانا هناك الأوراق القديمة التي ترجع فترة الجيني الذي تريد إعادة النظر–ولكن هذا أصبح أقل شيوعا لتلك المجالس القديمة حقا في هذه المرحلة. فإن البيانات تستمر لتحميله, ولكن ستزول مرئيات المتصفح. لكنه جعلني أريد أن أعود ونتطلع من خلال المواد بلادي القديمة لمعرفة ما بدا المتصفحات في وقت مبكر مثل (انقر على الصورة لembiggen). وهناك الكثير من البنية التأسيسية هو نفسه, ولكن اذا نظرتم الى واحدة من هذه التجميعات القديمة قد تفاجأ. وهناك الكثير أقل المسارات, وهذا أمر مؤكد. في بلدي بالرصاص, لا يوجد سوى عدد قليل من الأنواع في المسار الحفظ (الإنسان, الشمبانزي, الماوس, نصيحة, دجاج). نحن فقط لم يكن لديك أن الكثير من البيانات المتاحة–ليس فقط عبر الأنواع, ولكن أنواع أخرى من تقنيات وأدوات. أقل المسارات. أزرار وظائف أقل.

كان هذا تقريبا بقدر متعة كما ننظر الى الوراء واجهات NCBI القديمة أن أتذكر من طريق العودة. أولئك منكم الذين كانوا في هذا روديو لفترة من الوقت قد تذكر تلك. البعض منكم سوف نتذكر حتى المفتاح “بيدرو أدوات” من مرة في اليوم. في بعض الأحيان انها تستحق النظر مرة أخرى في المكان الذي أتينا منه لندرك مدى أبعد من ذلك بكثير ونحن من أدركنا. أعرف أن هناك الكثير من التذمر عن عدم وجود سرطان الشفاء وغيرت صناعة الأدوية مع تسلسل الجينوم البشري حتى الآن–لكننا حقا لم تتح البيانات التي طويلة في المتصفح عاما. أو ربما انها أكثر مثل المريخ سنوات–أطول مما كنت أدرك, على الرغم من فترة مماثلة إلى حد ما من يوم واحد. قوس العلم هو طويل, ولكنه يتجه نحو إجابات.

تحرير: أدركت أنني يجب أن ننظر في أقرب الورق وأضيف أن مرجع أدناه. تحقق من الشكل 1 للرأي حتى كبار السن من البيانات.

ربط سريع:

UCSC متصفح الجينوم: http://genome.ucsc.edu

مرجع:

كينت WJ, Sugnet C.W., Furey T.S., Roskin K.M., برينغل T.H., دافع صباحا إلى. & هاوسلر D. (2002). في متصفح الجينوم UCSC الإنسان في, الجينوم الدقة., 12 996-1006. دوى:

نصيحة الأسبوع: NCBI Genome Workbench

تلميح اليوم هو من NCBI. على وجه التحديد, NCBI في الجينوم منضدة. طاولة العمل هو

…تطبيق متكامل للعرض وتحليل البيانات تسلسل. مع الجينوم منضدة, يمكنك عرض البيانات في قواعد البيانات المتاحة للعموم في تسلسل NCBI, وتخلط هذه البيانات مع بيانات خاصة بك.

انها مفيدة وبرنامج لديهم مجموعة كبيرة من أشرطة الفيديو لأعرض لكم لوظائف وميزات طاولة العمل. الفيديو جزءا لا يتجزأ هنا هو مقدمة, ولكن لديهم أيضا عدة أشرطة فيديو إضافية بما في ذلك كيفية تحميل الجينوم في طاولة العمل, phylogenies وغيرها. التحقق من ذلك.

( يغفر التأخير نصيحة هذا الأسبوع. إلغاء العمل الثلوج, وخرج الوصول إلى الإنترنت!)