الوسم المحفوظات: الجينات وظيفة التنبؤ

نصيحة الأسبوع: نخل, فرز (النيوكلوتايد) المتعصبة من متسامح

ونصيحة أخيرة فعلت في PolyPhen, خوارزمية التي تساعد على التنبؤ نتيجة المظهري من SNP غير مرادف. هناك خوارزميات أخرى من هذا القبيل المتاحة بما في ذلك MAPP (متعدد المتغيرات Analaysis من تعدد الأشكال البروتين), SNPs3D و نخل (الفرز من عدم تقبل ومتسامح). انها طرف الأخير أن اليوم سيكون لفترة وجيزة تغطي.

نخل, مثل PolyPhen, يحتوي على واجهة الويب, ولكنها تستخدم أيضا في مختلف أدوات أخرى لتعطي دلالة لاستبدال الأحماض الأمينية تؤثر على وظيفة البروتين. إذا كنت تريد معرفة المزيد حول كيفية جعل التوقعات (وبعض المقارنات لمختلف المنهجيات), كنت قد تريد أن تحقق من ورقتهم (تحذير, ملف pdf).

نصيحة الأسبوع: GeneMANIA سريع للتوقعات وظائف الجينات

أنا سعيدة الحظ العلماء هنا في OpenHelix الذي اختير لإنشاء برنامج تعليمي كامل على مورد شبكة المسمى GeneMANIA, لكنني فقط لا يمكن أن ننتظر لتقاسم بعض من التفاصيل حول ميزات هذا المورد العظيم. GeneMANIA تقف على شبكة متعددة رابطة خوارزمية تكامل. يمكن للمستخدمين إدخال إما جينة واحدة ونرى شبكات التفاعل المرتبطة الجين, أو (أكثر بقوة) لإدخال قائمة من الجينات ذات الصلة، واستخدام GeneMANIA في 'خوارزمية تحليل للدولة من بين الفن’ بسرعة وسهولة العثور على جينات إضافية ذات صلة.

GeneMANIA يسمح للعالم مع أي تدريب مسبق في مجال المعلوماتية البيولوجية الحاسوبية لاستخدام بسهولة القائمة الجينات اهتمامهم للبحث في قائمة مخصصة من المنشورات الجينوميات الوظيفية المنشورة, فضلا عن مجموعة متنوعة من قواعد البيانات العامة, وتظهر نتائج التحليل في وسيلة سهلة لتفسير التقرير PDF. حتى يمكن للمستخدمين تحميل قواعد البيانات الخاصة بهم مهمة وتؤثر على مدى عشرات الخوارزمية كل الجينات ورقة العمل. أنا لا يمكن أن تغطي كل هذه الوظيفة في هذا غيض قصيرة – عليك أن ترى أن البرنامج التعليمي لدينا – ولكن هنا سوف تظهر لك كيفية القيام بالبحث الأساسية وبعض الميزات عرض GeneMANIA.

GeneMANIA تقف على شبكة متعددة رابطة خوارزمية تكامل. لمزيد من المعلومات حول هذا الموضوع, يرجى الاطلاع على هذا 2008 GeneMANIA منشور, أو GeneMANIA الوثائق.