标记档案: 映泰

答案是什么? (Biostars的F1 x银河版本!)

Offspring of original Biostars site, Galaxy Biostars replaces their support mailing list.

原来Biostars网站的后代, 银河Biostars取代了他们的支持邮件列表.

一般每个星期,我们突出一个帖子从 主要Biostars网站, 它回答了一些问题,或提供的生物信息学工具的讨论或跨越许多领域分析. 但这个星期,我想给你看看映泰的后代–映泰银河!

我打电话给它Biostars x的F1 星系, 而不是性别 “银河的儿子”. 有一个较后在银河映泰支持网站描述远离其传统的邮件列表的支持过渡到这种新格式. 我会在这里连接的那部分, 但它的长,所以你应该去阅读整个事情在那边.

论坛: 欢迎来到银河映泰

亲爱的银河社区,
银河已经与映泰建立在银河的用户支持论坛 通过https://biostar.usegalaxy.org!

我们要创建那里的研究人员使用的空间 星系 能走到一起,分享双方的科学建议和实用的工具帮助. 无论是在 usegalaxy.org, 一 Cloudman 例, 或任何其他银河 (公众当地), 如果你有话要说 用银河, 这是做它的地方!

[has a lot more detail–go read the whole thing over there]

詹妮弗·希尔曼杰克逊

正如我指出的那边, 我一直在使用邮件列表愉快很长一段时间,因为这是我们不得不. 但我认为这是一个伟大的方式过渡到现在的支持,而不是电子邮件列表. 去检查出来!

 

答案是什么? (如何保持目前的)

这一周是有点比平常不同 “答案是什么?” 哨所,在那里,我们强调从一个论坛,我们的读者可能会感兴趣的问题. 不过–在这个岗位, 一个问题的答案,包括 映泰–所以回来围绕!

斯蒂芬特纳 (又名 @ genetics_blog) 人们问他写了一篇博客文章,最近他是如何保持目前在生物信息学/基因组学. 我知道很多人时,后转推, 和OpenHelix他很亲切列入导致一些良好的交通,这个博客和新的Twitter的追随者. 昨晚我看到这个以及, 确认我这个职位的印象:

博客, 论坛, 自动搜索, 叽叽喳喳, 与文学–当然. 很多人可能会知道一些关于这些, 但它很高兴看到有人组装集合. 它也是有趣的,看看如何相似,它是我的策略.

因此,它似乎是这可能是一个有趣的项目,突出对一些事情的答案来源, 一个很好的方法,找到有用的网站和乡亲要注意的,在这一领域. 检查出来.

如何保持目前在生物信息学/基因

这么多的数据和信息. 你总得有一些战略. 你必须有超过文献.

答案是什么? (在网上点鼠标资源)

映泰 网站是一个要求, 生物信息学的问题,回答和讨论. 我们的成员社区和发现它非常有用. 经常出现的问题和答案在映泰是我们的读者有密切关系 (基因组学的最终用户资源). 每星期四,我们将其中的一个突出问题和答案在这里在这个线程. 您可以询问一下该线程问题, 或者你可以随时参加在映泰.

需要鼠标研究网上资源? 映泰问安德鲁·苏列表等资源,并开始与一对夫妇打:

我想创建鼠标研究者的一个最有用的网上资源集合. 这里是我的清单至今…

此外,包括许多来自玛丽如鼠标资源浏览器与一些伟大的评论线程继续: http://bioit.fleming.gr/mrb/, JAX: http://informatics.jax.org/和其他安德鲁添加到列表.

答案是什么? (生物信息学工具对映泰)

映泰 网站是一个要求, 生物信息学的问题,回答和讨论. 我们的成员社区和发现它非常有用. 经常出现的问题和答案在映泰是我们的读者有密切关系 (基因组学的最终用户资源). 每星期四,我们将其中的一个突出问题和答案在这里在这个线程. 您可以询问一下该线程问题, 或者你可以随时参加在映泰.

只是一个月前, 映泰增加了一个工具部分 作为一个地方公布和更新新的和旧的生物信息学工具. 因此,, 在某种意义上, 今天的文章是在寻找你的问题的答案 :):

我们只是增加了一个新的部分称为**工具网站**我们指定本节公布关于生物信息学软件工具, 新旧.

大约有 10 目前上市的各个领域的分析工具. 这恰好吻合A的 “讣告” 玛丽部分创建于映泰 不再支持的工具和数据库的她 本星期早些时候讨论. 生命和所有圈 :).

答案是什么? (下一代测序农工商- 课程)

映泰 网站是一个要求, 生物信息学的问题,回答和讨论. 我们的成员社区和发现它非常有用. 经常出现的问题和答案在映泰是我们的读者有密切关系 (基因组学的最终用户资源). 每星期四,我们将其中的一个突出问题和答案在这里在这个线程. 您可以询问一下该线程问题, 或者你可以随时参加在映泰.

这个问题是创建 18 个月前, 但添加新的幻灯片和意见已对农工商的过程中仍然是一个极好的资源:

问题: 我准备在农工商课程: 任何建议 ?

第一个答案 (与 22 最高票!) 是物质的宝库, 随着一些优秀的资源,从其他的答案. 想了解更多关于农工商数据分析?… 在这里你走.

答案是什么? (基因ID转换)

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这一周的突出问题:

什么是好的 “基因标识转换工具

这是一个旧的问题, 从 2 年前, 但仍然相关和答案仍然非常有用,如资源 国宝, BioDBnet, BioMart 和其他人.

检查出来. 还, 可能要检查出 第三行使我们的加州大学圣克鲁兹分校的高级教程 . 演习:

“从UCSC的基因列表, 添加基因符号和基因组的附加信息的ID. 奖金步骤: 添加GO术语。”

遍历你可能会对如何能够做一些简单的修改与UCSC表浏览器.

映泰, 动议

我们在这里OpenHelix爱 映泰. 如果你还没有注意到, 我们强调在我们的回答映泰逢星期四 “答案是什么” 螺纹. 对于这些新来映泰, 一个快速的介绍: 映泰是一个Q&一个网站或生物信息学和基因组学, 因为它描述了 关于页面:

这个网站的重点是 生物信息学, 计算基因组学生物数据分析.

嗯, 这不是特别的描述, 但读,你会发现,映泰是一个很好的问题和答案的网站. 问题和答案可以是相当详细和复杂, 或者像他们说的对有关网页, “毫无疑问是太琐碎或太 “新手”. 我们已经发现了大量的使用了很多很好的答案 (和问题). 玛丽我是 同时有 (玛丽是主持人) 每星期我们寻找问题和答案,为我们的读者,特别是有用的网站.

映泰描述但是这是不是这篇文章的标题 (和 我们所做的前 :), 但要提醒乡亲,映泰已经转移到自己的家. 它被安置在 StackExchange, 但由于种种原因 (讨论历史 如果你想大幅下挫) 作出这一决定是迁移到一个新的站点映泰. 移徙的最后一个周末举行, 到 http://www.biostars.org. 与所有的功能和特点,你还记得这是一个不错的新网站, 一些变化的东西 (信誉是不同的计算). 一个平稳和幸福的举动. 您的旧网址重定向到新, 但如果它不, 你这里有. 恭喜社区到一个新的网站,并开始在Biostars.

 

答案是什么? 脂质结合蛋白数据库或工具?

 

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这一周的突出问题:

如何识别脂质结合区 (氨基酸残基) 中的蛋白质? 任何专门的在线/商业工具有.

第一个答案开始:

你可以试试 CGDB - 膜蛋白/脂质相互作用数据库. 您也可以尝试脂结合网站采用三维结构数据的预测算法, 描述 斯科特, 等.

然后继续与更多的阅读和一些描述. 有 (在这个时候) 另一个答案使用PFAM.

答案是什么? 疾病的单核苷酸多态性数据库

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本周的 SNPS“因果数据库的搜索问题’ 的疾病. 答案指出, 这个词的因果关系’ 在约单核苷酸多态性时,应使用与犹豫. 这就是说, 答案常年问到这个问题提出了一些很好的建议, 这里的第一个 (其他有用, 所以 检查他们的OU吨):

人类基因突变数据库

http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php

付费订阅的最新信息. 否则少到公共数据库的最新版本是只从学术机构/非营利组织的注册用户免费提供.

答案是什么? 银河替代

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这一周的突出问题是

是什么 “银河包装在图形用户界面的命令行工具的替代品?

或者换句话说, 工作流系统中除了有 星系 (一个伟大的工具, 但有时人们需要不同的东西 :). 这个问题的答案将帮助生物信息学家谁建立谁使用他们的工具和生物学家, 这样做,如果需要的话,前者的替代品和后者的其他工作流系统的尝试.

强调包括 酒馆, YabiKnime 从Wikipedia提供了列表. 检查出更多的例子的答案.