태그 아카이브: Biostar

답변은 무엇입니까? (Biostars의 F1 갤럭시 버전하기 x!)

Offspring of original Biostars site, Galaxy Biostars replaces their support mailing list.

원래 Biostars 사이트의 자손, 갤럭시 Biostars은 지원 메일 링리스트를 대체.

일반적으로 각 주에 우리는에서 포스트를 강조 주요 Biostars 사이트, 몇 가지 질문에 대답이나 생물 정보학 도구의 설명을 제공하거나 다양한 무대를 통해 분석하는. 그러나 이번 주 나는 당신에게 바이오 스타 (Biostar)의 자손을 살펴주고 싶어–바이오 스타 (Biostar) 갤럭시!

나는 그것을 Biostars x의 F1 전화 해요 은하, 오히려 젠더보다 “갤럭시의 아들”. 이 새로운 형식으로 떨어져 전통적인 메일 링리스트 기반 지원에서 전환을 설명하는 갤럭시 바이오 스타 (Biostar) 지원 사이트에서 게시물을 통해이있다. 여기 그 부분을 연결합니다, 하지만 그래서 당신은 거기 전체를​​ 읽어 가야한다 길어.

포럼: 갤럭시 바이오 스타 (Biostar)에 오신 것을 환영합니다

친애하는 갤럭시 커뮤니티,
갤럭시는 갤럭시 사용자 지원 포럼을 만드는 바이오 스타 (Biostar)와 협력하고있다 은 https://biostar.usegalaxy.org!

우리는 연구자가 사용하는 공간을 만들려면 은하 함께 모여 과학적인 조언과 실용적인 도구의 도움을 모두 공유 할 수 있습니다. 에 대한 여부 usegalaxy.org, a Cloudman 예, 또는 다른 은하 (공개 또는 지역), 당신에 대해 할 말이있는 경우 갤럭시를 사용하여, 이 그것을 할 수있는 장소입니다!

[has a lot more detail–go read the whole thing over there]

제니퍼 힐만 잭슨

나는 거기 언급 한 바와 같이, 즉 우리가 가진 무엇 때문에 오랫동안 행복하게 메일 링리스트를 사용하고있다. 그러나 나는이 대신 이메일 목록의 지금 지원하기 위해 전환 할 수있는 좋은 방법이라고 생각. 확인해!

 

무슨 대답이야? (현재 유지하는 방법)

이번주는 평소보다 조금 다릅니다 “무슨 대답이야?” 우리 독자가 관심이 있다고 포럼에서 질문을 강조 어디에 게시. 그러나–이 게시물에, 답변 중 하나가 포함 Biostar–그래서 일종의 주위에 다시 온다!

스티븐 터너 (일명 @ genetics_blog) 그는 생물 정보학 / 유전체학에 현재의 유지 방법을 물어 사람에게 응답으로 최근 블로그 게시물을 썼습니다. 나는 많은 사람들이 시간에 해당 게시물을 retweeted 알고, 과 OpenHelix 그의 매우 친절 포함이 블로그와 새로운 트위터의 추종자에게 좋은 트래픽을 이끌. 그리고 어제밤 나는뿐만 아니라 이것을보고, 이 게시물에 대한 내 인상을 확인:

블로그가 있습니다, 포럼, 자동 검색, 지저귐, 문학–물론. 많은 사람들이 이들 중 일부에 대해 알고 있습니다, 하지만 누군가 컬렉션을 조립 볼 수 좋네요. 그것은 나의 전략으로 얼마나 유사한보고도 흥미 롭.

그래서 이것이 여러 가지에 대한 답변의 좋은 소스로 강조하는 재미있는 아이템이 될 것 같았, 유용한 사이트와 가족을 찾는 좋은 방법은이 분야에서 인식하는 방법. 이것 좀 봐.

생물 정보학 / 지노 믹스에서 현재 유지하는 방법

그래서 많은 데이터 및 정보. 당신이해야하는 몇 가지 전략을 가지고. 그리고 당신은 문학 이상을 가져야.

무슨 대답이야? (온라인 마우스 자원)

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리의 회원커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

마우스 연구에 대한 온라인 리소스를 필요? 바이오 스타 앤드류 스와 같은 자원의 목록을 요청하고 몇 12로 시작:

나는 마우스 연구자를 위해 가장 유용한 온라인 리소스의 모음을 만들고자. 여기 제 목록은 너무 멀어요…

코멘트 스레드는 마우스 자원 브라우저로 메리를 포함한 많은 훌륭한 추가로 계속: http://bioit.fleming.gr/mrb/, 잭스: http://informatics.jax.org/그리고 앤드류가 목록에 다른 사용자를 추가하는.

무슨 대답이야? (Biostar의 생물 정보학 툴)

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리의 회원커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

그냥 약 한달 전에, BioStar는 도구 섹션을 추가 신규 및 기존 생물 정보학 도구를 발표하고 업데이트 할 수있는 장소로. 그래서, 어떤 의미에서, 오늘의 게시물의 질문 검색의 답변입니다되어 :):

우리는 단지 ** 우리는 생물 정보학 소프트웨어 도구에 관한 공지 사항이 섹션을 지정 ** 도구라는 사이트에 새로운 섹션을 추가, 신구 모두.

생각이 있습니다 10 분석의 다양한 영역에 대해 현재 열거된 도구. 이것은 함께 멋지게 dovetails “사망 기사” 섹션 메리는 Biostar에서 만든 더 이상 지원되지 않는 도구와 데이터베이스에 대한 그녀 이번 주 초에 논의. 삶의 원형과 그 :).

무슨 대답이야? (차세대 장면-NGS- 코스)

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리의 회원커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

이 질문을 만들었습니다 18 개월 전, 하지만 새 슬라이드 및 의견은 추가되고 여전히 NGS의 과정에 대한 훌륭한 리소스입니다되었습니다:

질문: 나는 NGS에 코스를 준비하고 있습니다: 어떠한 제안 ?

첫 번째 대답 (와 22 투표까지!) 재료의 보물 관은입니다, 다른 답변에서 몇 가지 훌륭한 리소스와 함께. NGS 데이터의 분석에 대한 자세한 내용을 원하십니까?… 여기 있네.

무슨 대답이야? (진 아이디 전환)

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리의 회원커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

이번주의 하이라이트 질문:

좋은 무엇입니까 “유전자 ID를 변환 도구

이것은 이전 질문입니다, 부터 2 년 전, 하지만 여전히 관련성이 높은 답변을 여전히 매우 도움과 같은 자원의 전체 데이빗, BioDBnet, BioMart 외.

이것 좀 봐. 또한, 를 확인하는 것이 좋습니다 우리 UCSC 고급 튜토리얼의 3 분의 운동 . 운동:

“UCSC 유전자의 목록에서, 유전자 기호를 추가하고 유전자 세트에 대한 자세한 내용은 ID를 GO. 보너스 단계: 검색어를 가면 추가합니다.”

당신은 몇 가지 간단한 수정으로 UCSC 표 브라우저로 이렇게 할 수있을 방법을 통해 걷고.

Biostar, 이동

OpenHelix 사랑에 여기에 우리 Biostar. 당신은 눈치 못 채셨, 우리는 우리의 Biostar 매주 목요일에서 해답을 강조 “무슨 대답이야” 실. Biostar에 새로 분들, 빠른 소개: Biostar는 Q입니다&생물 정보학 및 유전체학을위한 사이트 또는, 그것에 대해 설명대로 에 대한 페이지:

이 사이트의 초점은 생물 정보학, 계산 유전체학생물 학적 데이터 분석.

음, 그것은 특히 설명이 아니예요, 그러나, 읽고 당신은 BioStar이 우수한 질의 응답 사이트입니다 것을 찾을거야. 질문과 답변은 아주 상세하고 복잡할 수, 또는 그들에 대한 페이지에 말씀 하신대로, “어떤 질문이 너무 사소한 혹은 너무 없다 “초보자”. 우리가 사용하는 많은 좋은 답변을 많이 발견했습니다 (질문에게). 메리나는이다 모두가 (메리는 운영자입니다) 그리고 매주 우리는 우리의 독자를 위해 특히 유용 질문과 답변에 대한 사이트 검색.

다만, 설명 BioStar이 게시물의 제목이 아니었 (및 우리는 일을하기 전에 그 :), 하지만 부모님을 생각나게하는 BioStar는 그 자체가 고향으로 이사를했다고. 그것은에서 지내게 될 때 사용 StackExchange, 하지만 여러 가지 이유로 (토론의 역사 당신은 찔러 싶다면) 결정은 새 사이트로 BioStar를 마이 그 레이션되었다. 그 이주는 지난 주말 발생한, 에 http://www.biostars.org. 그것은 당신이 기억하는 모든 기능과 특징을 가진 좋은 새로운 사이트입니다, 몇 가지 변경된 것들 (명성은 다르게 계산됩니다). 부드럽고 행복 이동. 기존 URL이 새로 리디렉션합니다, 하지만 그렇지 않을, 당신은 여기있다. 새로운 사이트 및 시작 Biostars의 커뮤니티에 축하.

 

무슨 대답이야? 지질 결합 단백질 데이터베이스 또는 도구?

 

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리의 회원 커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

이번주의 하이라이트 질문:

지질 바인딩 영역을 식별하는 방법 (아미노산 잔류물) 단백질의? 모든 전문 온라인 / 상업적인 도구가있다.

첫 번째 대답에서 시작:

당신은 시도 할 수 있습니다 CGDB - 막 단백질 / 지질 상호 작용 데이터베이스. 당신은 또한 입체 구조 데이터를 사용하여 지질 바인딩 사이트에 대한 예측 알고리즘을 시도할 수 있습니다, 에 의해 설명 스콧, 외.

그리고 읽기에 더와 지속 및 일부 설명. 있다 (이 시간에) PFAM를 사용하여 다른 대답.

무슨 대답이야? 질병 SNPs의 데이터베이스

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리는 thecommunity의 회원이며, 그것이 매우 유용. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

이번 주 질문은 SNPS '인과의 데이터베이스를 검색 할 수 있습니다’ 질병에 대한. 대답은 지적으로, 단어를 '인과’ SNPs 얘기를 할 때 주저와 함께 사용해야합니다. 그렇게 말했다, 답변이 사계절을 통해서 계속되게 묻는 질문에 대한 좋은 제안을했다, 여기서 첫 번째의 (다른 사람으로 유용, 그래서 그들이 OU 확인t):

인간 유전자 돌연변이 데이터베이스

http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php

최신 정보는 유료 가입. 그렇지 않으면 적은 최신 데이터베이스의 공개 버전은 교육 기관 / 비영리 단체에서 등록된 사용자에게 자유롭게 사용할 수 있습니다.

무슨 대답이야? 은하에 대한 대안

Biostar 질문에 대한 사이트입니다, 응답 및 생물 정보학 질문에 대해 논의. 우리의 회원커뮤니티는 매우 유용한 찾아. 자주 질문 및 답변은​​ 우리의 독자들에게 밀접한 관계가있는 것을 BioStar에서 발생하는 (게놈 자원의 최종 사용자). 매주 목요일은 우리가이 스레드 여기에 그 질문 중 하나이며, 답변을 강조합니다. 당신이이 스레드에 질문을 할 수, 또는 당신은 항상 BioStar에 참가할 수.

이번주의 하이라이트 질문입니다

은 무엇입니까 “GUI에서 명령줄 도구를 배치를 위해 은하에 대한 대안?

또는 다른 단어, 워크플로우 시스템은 이외에도 밖에서 어떤 은하 (훌륭한 도구를, 하지만 때로는 사람들은 다른 뭔가가 필요 :). 이 질문에 대한 답변이 그들을 사용하는 도구와 생물 학자를 만드는 두 bioinformaticists 도움이 될 것입니다, 밖으로 시도 필요하다면이 일을 위해 전 대안과 후자 다른 워크플로우 시스템을 제공.

몇몇은 강조를 포함했다 선술집, YabiKnime 그리고 목록은 위키 피 디아에서 제공된. 더 많은 예제에 대한 답변을 확인.