نصيحة الأسبوع: مقدمة البرامج الإحصائية R (مع الفيديو)

نصيحة هذا الأسبوع الفيديو يختلف عن نصائحنا المعتاد في عدة طرق. الأول, لن تسمع لي–وقد تم ذلك عن طريق الويبينار ميرك هيذر من ولاية أوهايو. نحن أيضا تسليط الضوء عادة على شبكة الإنترنت الأدوات, وهذا العرض على أدوات R الحوسبة الإحصائية تعتمد على سطر الأوامر. وانها أطول مما كنا نفعل عادة–ولكن بسبب أن هذا التفصيل مقدمة R يغطي سوف يستغرق بعض الوقت. لاحظ: هذا الفيديو يوتيوب الأول هو مجرد 1 من 7 التي خلقت من الويبينار كله. يمكنك مشاهدتها في سلسلة في يوتيوب, أو اذهب الى الصفحة الويبينار في موقع داخلي UMass لجميع من لهم, وصلات إضافية لشريحة التنزيلات, نموذج البيانات يمكنك استخدام مجموعات, والمراجع + مفيدة روابط لكثير من المصادر الأخرى.

ولكن إذا كنت قد نسمع عن علماء الأحياء الذين يستخدمون R لعملهم, أو كنت قد تم رؤيته المذكورة في ورقات, ولقد كنت أتساءل لماذا وكيف لتبدأ مع البحث, وسوف يكون هذا يستحق وقتك. انها مقدمة لطيفة إلى أين يمكن الحصول على R, كيفية بدء التفاعل معها, بعض النصائح حول الاشياء التنسيق الخاص, وصلات إلى موارد إضافية لمساعدة لاستعمال R.

R على حد سواء لغة برمجة وتحليل للبيئة الحوسبة الإحصائية التي والفائدة العامة, ولكن يجري على نطاق واسع في مجال البيولوجيا والمعلوماتية الحيوية. هذا الويبينار يركز على البيانات تربية النباتات, ولكن سترى أنها يمكن أن تكون منبرا تحليل رائع للعديد من أنواع البيانات التي قد تستخدم.

على الرغم كما ذكرت هذه المواد تركز على استخدام R عبر سطر الأوامر, يمكنك أيضا التفاعل مع البحث على شبكة الإنترنت. من خلال موقعنا مجرة ورش العمل كان كثير من الناس مسرور انظر إلى الأدوات R قد أدرجت في واجهة غالاكسي–يمكنك ان ترى لهم في الجزء السفلي من العمود الأدوات على اليسار. وقد روس لازاروس ، من جامعة هارفارد دمج ميزات R في واجهة غالاكسي. الهدف العام من غالاكسي هو خلق أدوات شبكة الإنترنت للباحثين للوصول إلى الكثير من الأدوات التي قد تحتاج إلى استخدام ذلك في أماكن منفصلة أو تثبيت نفسها. المرجع أدناه يوضح استراتيجيات متعددة في المجرة, وكان روس واحدة من مؤلفي هذا.

R هي بالتأكيد ليست فقط لعلماء البيولوجيا, رغم أن. هذا سقسقة الأخيرة من ممارس المعلوماتية الحيوية يوضح مداه:

RT @ Neilfws: كيف لويدز في لندن يستخدم R للتأمين http://bit.ly/ogUT1I #greader

ويوضح أن مجرد مجموعة من الأشياء التي من الممكن–ربما هناك شيء ما يجب أن نفعله في البحث لتحليل البيانات الخاصة بك. ونظرة على الويبينار ومعرفة ما اذا كان سيكون من المفيد لك.

 

وصلات سريعة:

الويبينار الصفحة التفاصيل الكاملة: مقدمة البرامج الإحصائية R: تطبيق لالويبينار تربية النباتات قدمها ميرك هيذر.

R مشروع الحوسبة الإحصائية: http://www.r-project.org/

R علم الوراثة + المجرة: http://rgenetics.org/trac/rgalaxy

RStudio: http://www.rstudio.com/

المراجع:

Blankenberg, D, بواسطة كوستر, G, Coraor, N, أناندا, G, لعازر, R, المنغنيز, M, Nekrutenko, A, & تايلور, J (2010). المجرة: تحليل الجينوم ويب المستندة إلى أداة لالتجريبيون البروتوكولات الحالية في علم الأحياء الجزيئية, 19 (10) دوى: 10.1002/0471142727.mb1910s89

عن وثائق مفيدة حول العديد من الأبحاث وتحديدا حول التطبيقات في مجال البيولوجيا راجع صفحة الويبينار مرجع + وصلات خارجية القسم.

واحد يعتقد على "نصيحة الأسبوع: مقدمة البرامج الإحصائية R (مع الفيديو)

  1. التنبيهات: ما هو الرد? (الأسئلة R) | وOpenHelix مدونة

التعليقات مغلقة.