ما هو الرد? فتح الموضوع (GWAS التنميط الجيني)

BIOSTAR هو موقع لطرح, الإجابة على الأسئلة ومناقشة المعلوماتية الحيوية. نحن أعضاء المجتمع وتجد أنه من المفيد جدا. غالبا أسئلة وأجوبة تنشأ في BIOSTAR التي ثيق لقرائنا (المستخدمين النهائيين للموارد الجينوميات). كل يوم خميس سنكون تسليط الضوء على واحدة من تلك الأسئلة والأجوبة هنا في هذه الصفحات. يمكنك طرح الأسئلة في هذا الموضوع, أو يمكنك الانضمام دائما في BIOSTAR.

مسألة أسبوع:

كم من الجينوم يتم التقاطها بواسطة GWAS?

إجابتان كبيرة لهذه الأسئلة, اقتبس من أول واحد. اضغط على الرابط أعلاه لمزيد من.

الجينوم البشري بترميز 1 SNP/100-300bp; ~ ~ 3GB تسلسل 10million النيوكلوتايد. فمن المستحيل لتحليل مثل هذا العدد الكبير من البيانات نظرا لعدة عوامل تحد من. للتعامل مع هذه القضية يمكننا استخدام اختلال التوازن الربط (LD) رسم الخرائط (انظر القسم الخاص ب "D, معدل إعادة التركيب), النمط الفرداني, كتل النمط الفرداني و النمط الفرداني العلامات النيوكلوتايد (tagSNPs). (قرأت عن مشروع هاب ماب هنا). بدلا من التنميط الجيني للجميع النيوكلوتايد 10M يمكننا الوراثي tagSNPs في كتلة النمط الفرداني. هذا هو ممثل الحزب الوطني الاسكتلندي في منطقة معينة من الجينوم دينار مع ارتفاع. وهذا سيمكن للعثور على الاختلاف الجيني دون التنميط الجيني للجميع النيوكلوتايد 10M. وأشارت دراسات سابقة أن التنميط الجيني مع رقائق النيوكلوتايد M - 1M 0.5 سوف يكون كافيا لGWAS جيدة.