Bioinformatics.org에서 우리 친구들이 현장 여름 코스

내 메일이 통지를 받았어요–부터 Bioinformatics.org:

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=- =-=-=-=-=-=-=-=-=-

생물 정보학 프로그래밍 CS101 소개

July 28-29, 2011

*캠브리지에서 현장 *, 매사 추세츠 주, 미국

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=- =-=-=-=-=-=-=-=-=-

***이것은 우리의 기초 프로그래밍 과정의 특별 제공하고 있습니다, 켄달 광장에서 인 준, 캠브리지, 매사 추세츠 .***

목표:

이 코스는 IT 전문가를 가르치고, 엔트리 레벨 bioinformaticians 및 Linux 활용 및 다양한 오픈 소스 생물 정보학 도구에 생물학, 함께 스크립팅 및 데이터 관리 도구, 생물 학적 연구에 계산을 수행하고 데이터로부터 정보를 만들려면. 이 과정에서 예로 DNA와 아미노산 시퀀스에서 데이터를 사용합니다, microarray 프로필, 이미지, 질량 분석계, LIMS, 및 생물 학적 주석.

교과:

코스로 나뉘어져 있습니다 4 세션, 대략과 1-1.5 강의 시간, 연구실 연습을위한 추가 시간. 다섯째 세션이 프로젝트 토론 및 기타 과정 관련 문제에 대해 예약되어 학생들은 토론 할 수 있습니다.

세션 1 생물 정보학에 대한 컴퓨팅 풍경의 개요를 다룹니다. 일반적인 데이터 관리 및 광산 문제는 강조 표시됩니다, alongwith는 도전적인 문제의 개요 및 솔루션. 리눅스 운영 체제의 개요는 할 것입니다, alongwith 연구소는 리눅스에 익숙한 참가자를 얻을 연습.

세션 2 펄과 스크립트의 기초를 커버합니다, scalars 같은, 배열, 변수 보간, 운영자 (수학, 조건부, 논리적), 파일 입 / 출력, 인쇄, 루프 (경우 - 당시 다른, 용, 동안), 목록 작업, 등등. 랩 연습이 실시됩니다

세션 3 기능 / 서브루틴을 커버합니다, 해시 배열과 정규 표현식. 참가자는 MySQL의 데이터베이스를 소개합니다.

세션 4 펄 패키지의 설치를 커버합니다, 와 순서를 조작에 대한 유명한 패키지 BioPerl를 사용하는 몇 가지 예제, 블래스트 검색어 자동, 등등. 프로젝트는 BioPerl와 펄 데이터베이스 인터페이스를 사용하는 할당됩니다

전제 조건: 프로그래밍 경험이 필요하지 않습니다, 프로그램을하는 방법에 대한 자세한 내용은 단지 필요.

추가 정보에 대한: 수업료 및 기타 문의, 연락 주시기 바랍니다 edu@bioinformatics.org.

참고: 이 OpenHelix과 연결되어 있지 않습니다, 우린 그냥 알고 Bioinformatics.org 팀을 좋아하고 단어를 퍼뜨릴.