Tipp der Woche: LAMHDI für Tiermodelle

An der Experimental Biology Konferenz letzte Woche, Wir waren “Stand Nachbarn” mit einer Gruppe die Bereitstellung einer Datenbank, die wir nicht gehört hatte–LAMHDI. Natürlich, wir lieben es, neue Software, die Bedürfnisse für Biologen dient erkunden, und dies schien etwas in der Natur sein. Also gingen wir über um mehr zu erfahren.

LAMHDI steht für ihre Mission, das als beschrieben “Initiative zur LTinte Einnimal Modelle zu Hmenschlichen ASease”. Die Idee ist, zusammen zu bringen verschiedenen Quellen Tiermodell Informationen, in einer einzigen Google-like simple search. Derzeit werden sie integrieren die Datenbanken von verschiedenen Modell-Organismus Gruppen: FlyBase, MGI, RGD, SGD, und Tanz. Aber sie sind uns auf in mehrere von ihnen sowie zu bringen–Wenn Sie ein Tiermodell Datenbank haben Sie vielleicht mit ihnen in Kontakt zu bekommen.

Neben den Tiermodellen, Sie beinhalten auch andere Quellen von curated Informationen verwendet, um Elemente miteinander zu verbinden ist. Sie nutzen OMIM, Entrez Gene, HomoloGene, und WikiPathways Inhalt, um eine Brücke, die Text verbindet aus dem Tiermodell Details zu einander und zu den Informationen aufbauen. Wenn ein mutiertes Zebrafisch hat ein Gen, das in HomoloGene, zum Beispiel–Man erkennt, dass Artikel in einem Maus-Modell oder eine Fliege Modell verbinden. Es gibt vorab berechneten Krankheit-zu-Modell-Pfade, und das Zählen der Anzahl der Hops, muss man zwischen den Modellen zu machen bietet ein Scoring-System, um die Stärke dieser Beziehung für ein Modell-System zeigen. Das ist im Detail auf ihre erklärte About-Seite.

Es gibt eine große Liste von anderen Modell-Quellen, dass sie auf die Ergänzung der Sammlung arbeiten. Sehen Sie sich ihre Ausgewählte Ressourcen Seite, um diese zu sehen.

Dies wird nicht nur nützlich sein, um Forscher auf der Suche nach geeigneten Tiermodellen bei ihrer Forschung nimmt sie in neue Richtungen–aber die LAMHDI Team auch erwähnt, dass es vielleicht auch dazu beitragen, Tierpflege und-Nutzung Ausschüsse (IACUC) zu bewerten, die geeigneten und verfügbaren Modelle unter Auswertung in ihre Websites.

Betrachten Sie versuchen LAMHDI für eine breite Suche nach Tiermodellen, die nützlich sein könnte für Ihre Forschung–oder neue Leads auf Gene und Literatur, die Sie nicht zuvor untersucht.

Quick-Link:

LAMHDI http://lamhdi.org/