Oh, können Sie auch einen Blick auf diese? Browser-Sitzungen.

Haben Sie sich Ihre Kollegen wollen auf einige Regionen des Genoms Blick, die Art und Weise haben Sie es einrichten in Ihrem Browser in diesem Moment? Ja, Sie wechselten einige Farben und individuell auf dem Display ein bisschen. Du hast dir genau die Strecke die Sie anzeigen möchten. Aber diesersie müssen sehen, dieser!

Ich fand mich meine Kollegen wollen auf dieser Strecke von Genen beteiligt Blick in dass Autismus Forschung von den anderen Tag. Also ging ich zu den Papier und fand Figur 1 wo sie die Liste der Gene und der Region angegeben, und ging zum UCSC Genome Browser für mich selbst schauen. Und ich konnte nur sagen, Sie gehen über zu UCSC. Oder ich könnte Ihnen meine gespeicherte Sitzung–wo ich diese Region im Fokus und könnten bis die Anzeige eingestellt irgendeiner Weise wollte ich. Folgen Sie mir über das Flip um mehr zu erfahren, und Angesichts meiner Sitzung. Diese Überschneidungen am Ende sind wirklich offensichtlich hier–Besuche die BOLA2 an jedem Ende. Gleiche mit SULT1A3. Und andere. Ist das nicht merkwürdig und faszinierend?

Als wir taten Schulungen rund um das Land auf dem UCSC Genome-Browser und die Aufklärung der Menschen, wie toll es war in der Lage sein, ihre Sicht mit Filtern und Track Auswahl anpassen, Personen wurden gefragt, ob sie könnten alles, was zu retten. Und ja–Browser merkt sich, wo Sie zuletzt waren, so ist es immer noch da. Aber wenn es eine Ansicht, die Sie wollten regelmäßig zu erstellen und gehen Sie zurück zu, oder Sie teilen wollte, dass bestimmte Sicht mit Ihren Kollegen, UCSC neue Sessions Mechanismus um dies zu ermöglichen.

Wenn Sie anfangen zu arbeiten um in der Genom-Viewer, Sie finden sich in einer genomischen Region wie dieser. Am oberen Rand des Browser-Seite, in der blauen Navigationsleiste, können Sie die Option für Session. Wenn Sie auf, dass Sie in der Lage sein, um Ihre aktuelle genaue Ansicht speichern, und Sie werden die Möglichkeit haben, laden, die im Browser oder das Erzeugen einer E-Mail mit, die. Die Sitzungen werden gespeichert und Sie können in zu gehen und sie später, und andere Menschen können sie später laden. Dies ist viel leichter als Ziehen Sie Ihre Kollegen über auf Ihren Computer genau in dem Moment müssen Sie sie. Vor allem, wenn Ihr Kollege ist nicht in Ihrer Abteilung, oder auch in Ihrem Land! Es könnte auch für die Lehre oder Ausbildung handlich wie wir es tun–Sie können eine bestimmte Region, dass Sie wissen, jeder ist zur gleichen Zeit. Und für diejenigen unter Ihnen, die lokalen Helpdesk sind–Beantwortung von Fragen von Ihren Kollegen darüber, wie Sie bei Bestellung im Genom-Browser betrachten–hier. Du siehst toll aus!

Es erfordert einen Benutzernamen und ein Passwort für den UCSC Genome Wiki. Aber wenn man einmal, dass Sie bereit sind zu gehen.

Dieses Feature wurde in der beschriebenen 2007 Nachrichten, [bearbeiten: und in der Zeitung unter] und die Details sind:

16 Februar 2007 – Neuer Browser Session-Sharing-Funktion erhältlich

Wir freuen uns, die Freigabe einer neuen Session-Management-Funktionalität in der Genom-Browser bekannt, welche Benutzer zu speichern und teilen Browser-Sitzungen ermöglicht.

Benutzer können nun ihre Browser mit bestimmten Titel Kombinationen konfigurieren, einschließlich kundenspezifischer Titel, und speichern Sie das Configuration-Optionen. Mehrere Sitzungen können zur späteren Verwendung gespeichert werden, für den Vergleich von Szenarien oder für den Austausch mit Kollegen. Gespeicherte Sitzungen erhalten für ein Jahr nach dem letzten Zugriff, es sei denn gelöscht. Custom Tracks bestehen für mindestens 48 Stunden nach der letzten Zeit sind sie gelesen.

Die neue Funktion kann über die zugegriffen werden “Sessions” Link oben blauen Balken in jeder Versammlung. Um sicherzustellen, Privatsphäre und Sicherheit, Benutzer müssen die genomewiki Website anmelden und einen Benutzernamen und ein Passwort. Einzelne Sitzungen können vom Anwender entweder benannt werden “geteilt” oder “nicht freigegebenen” um die Privatsphäre von vertraulichen Daten schützen.

Um zu vermeiden, ein neues gemeinsames Sitzung von jemand anderem überschreiben bestehende Genom-Browser-Einstellungen, Benutzer werden aufgefordert, eine neue Web-Browser-Instanz öffnen oder bestehende Einstellungen in einer Sitzung vor dem Laden ein neues gemeinsames Session speichern.

Die Sessions Feature wurde von Angie Hinrichs der UCSC Genome Bioinformatics Group geschrieben und mit Hilfe von Kayla Smith und Robert Kuhn.

Herausgegeben zu Zitierungen für die Forschung Komponenten bieten:

1. Autism Research Papier: Weiss, DAS, Shen, Y., Getreide, JM, Arking, DE, Miller, DT, Fossdal, R., Saemundsen, E., Stefansson, H., Ferreira, MA, Green, T., Flat, OS, Ruderfer, DM, Walsh, CA, Altshuler, D., Chakravarti, A., Tanzi, RE, Stefansson, K., Santangelo, SL, Gusella, JF, Sklar, P., Wu, B., Daly, MJ. (2008). Assoziation zwischen Mikrodeletion und Microduplication bei 16p11.2 und Autismus. New England Journal of Medicine DOI: 10.1056/NEJMoa075974 .

2. UCSC Genome Browser Papier: Karolchik, D., Kuhn, RM, Bärtsch, R., Friseur, GP, Clawson, H., Diekhans, M., Giardine, B., Harte, RA, RAMspan>, Hinrichs, AS, Hsu, F., Kober, KM, Miller, W., Pedersen, JS, Pohl, A., Raney, BJ , AS, Hsu, F., Kober, KM, Miller, W., Pedersen, JS, Pohl, A., Raney, B.J., Rhead, B., Rosenbloom, KR, Smith, TO, Stanke, M., Thakkapallayil, A., Trumbower, H., Wang, T., Zweig, AS, Haussler, D., Kent, WJ. (2007). Die UCSC Genome Browser Database: 2008 Update. Nucleic Acids Research, 36(Database), D773-D779. DOI: 10.1093/nar/gkm966

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