De nouveaux tutoriels en ligne sur ZFIN, SGD, PlantGDB et GBrowse Ressources

Tutoriels complets sur les bases de données ZFIN organisme modèle, SGD et PlantGDB et GBrowse, un navigateur génome organisme modèle, permettre aux chercheurs de rapidement et efficacement l'utilisation de ces ressources inestimables.

Seattle, WA Septembre 15, 2008 — OpenHelix a annoncé aujourd'hui la disponibilité de suites nouveau tutoriel sur plusieurs ressources de l'organisme modèle, y compris Réseau d'information de poisson zèbre (Danse), Saccharomyces Base de données du génome (SGD) et le Usine Genome Database (PlantGDB) et aussi un tutoriel en utilisant les navigateurs génome avec GBrowse. Ces quatre tutoriels élargir la formation de OpenHelix organisme modèle base de données qui inclut désormais aussi des tutoriels sur la GIG (la souris), FlyBase (drosophile), GRAMENE (herbes), RGD (rat), WormBase et plus à venir bientôt. Organismes modèles font partie intégrante de notre compréhension de la biologie fondamentale et la recherche biomédicale moderne. ZFIN est une collection de données, outils, et des ressources sur le poisson zèbre (Danio rerio), un organisme modèle populaire pour la biologie du développement et de la recherche génétique et de SGD est une collection de données, des outils et des analyses centrées autour Saccharomyces cerevisiae, communément appelé boulangers’ ou de levure de boulanger. PlantGDB est la principale ressource pour la génomique comparative des plantes.

En outre, OpenHelix a ajouté un tutoriel sur GBrowse, une application web qui vous permet d'explorer des séquences génomiques avec les données annotées. GBrowse devient rapidement le navigateur génomique de choix parmi les bases organisme modèle, parce que le navigateur est à la fois universelle et pourtant personnalisable.

Les suites tutoriel, disponibles à l'achat unique ou par le biais d'un abonnement à bas prix par an pour tous les tutoriels OpenHelix, contiennent une narration, auto-run, tutoriel en ligne, diapositives, documents et d'exercices. Avec les tutoriels, les chercheurs peuvent rapidement apprendre à utiliser efficacement ces ressources. Ces tutoriels vous apprendra les utilisateurs:

Danse

  • d'effectuer des recherches efficaces et de comprendre les écrans
  • d'accéder à des recherches avancées permettant des requêtes multiples
  • d'utiliser les différentes bases de données des gènes et des marqueurs, données d'expression, mutant génotype / phénotype de détails, ontologies, et plus
  • pour enquêter sur de nombreuses ressources connexes associés à ZFIN

SGD

  • pour naviguer sur le site de SGD, localiser les options de recherche de base et avancé, et utiliser le plan du site pour accéder aux outils de recherche supplémentaires
  • effectuer les deux types de base SGD recherche rapide et de texte et de comprendre les écrans
  • pour naviguer dans la page Locus SGD et l'accès aux données à partir d'un éventail d'outils, onglets, et des liens
  • pour enquêter sur de nombreuses ressources connexes associés à SGD

PlantGDB

  • d'effectuer des recherches rapides et naviguer dans les pages séquence
  • d'effectuer des recherches BLAST à travers plusieurs espèces de plantes de votre choix
  • pour créer des prédictions de gènes exon / intron et des alignements de séquences
  • pour construire des tableaux affichant les informations très variées à partir de données de nombreux
  • GBrowse

  • La structure de base et les méthodes de recherche au GBrowse
  • comment accéder aux données d'annotation détaillée liée à des séquences génomiques
  • comment choisir et personnaliser les annotations en utilisant Pistes
  • comment télécharger et d'intégrer vos propres données ou d'autres sources de données externes
  • faire une visite des installations GBrowse différentes bases de données à l'organisme modèle

Pour en savoir plus sur ces autres et suites tutoriel visiter le Catalogue Tutoriel OpenHelix et OpenHelix ou visitez le OpenHelix Blog Pour obtenir des renseignements à jour sur la génomique.

Une réflexion au sujet "De nouveaux tutoriels en ligne sur ZFIN, SGD, PlantGDB et GBrowse Ressources

  1. Pingback: Comment choisir une plate-forme de bases de données du génome | Le blog OpenHelix

Les commentaires sont fermés.