OH lance une recherche en génomique et en savoir Portal

OpenHelix a annoncé aujourd'hui le lancement de la nouvelle www.openhelix.com site web, un son tout premier du portail de genre qui aide les chercheurs à mener des recherches de pointe. Le portail oriente les scientifiques de la bioinformatique les plus pertinentes disponibles publiquement et de ressources en génomique sur le web, et puis leur donne un accès immédiat à des tutoriels, matériel de formation, et des conseils utiles et des informations développées par OpenHelix.

"Il ya maintenant des milliers de bases de données et des outils d'analyse pour le chercheur d'utiliser lorsqu'on fait des recherches biologiques,»A déclaré Scott Tour, PDG de OpenHelix, "Les chercheurs ont premier problème est juste de trouver l'outil le plus pertinent. Il existe des catalogues de ressources sur le web, mais ils sont lourds à utiliser et en utilisant une recherche par mot clé sur eux le plus souvent produit des résultats non pertinents. Le portail OpenHelix résout ce problème "

Le portail OpenHelix recherches une très pertinent, base de données organisée de ressources en génomique et biologique, Tutoriels OpenHelix et matériels de formation, et des conseils et des informations sur les ressources sur le blog de OpenHelix. Le portail fournit une liste de ressources pertinentes pour l'utilisateur grâce à un système de pertinence exclusive mise au point par des scientifiques OpenHelix. Une fois qu'un utilisateur trouve les ressources les plus pertinentes dans les résultats, ils peuvent se rendre immédiatement à la formation sur la ressource.

La recherche de la ressource la plus pertinente est gratuit pour tous les utilisateurs. Certaines des suites de tutorat sont également libres, comme ils sont parrainés par des ressources elles-mêmes, telles que le navigateur de génome UCSC.

«La seconde, et peut-être problème le plus important face à un chercheur est d'apprendre à utiliser ces ressources souvent complexe et en mutation », expliqué Tour "Depuis plusieurs formateurs OpenHelix a tous les doctorats en sciences biologiques ayant, connaissance intime des ressources, et ayant des années d'expérience sur site et la formation en ligne, nous avons une capacité unique à fournir la solution à ce problème. "

Avec un individu ou une institution de souscription OpenHelix, les utilisateurs peuvent accéder au catalogue complet de suites tutoriel OpenHelix, sur 80 actuellement, dans les catégories, y compris les voies, d'expression, variation, littérature et des bases de données générales. Ces tutoriels sont continuellement mis à jour chaque mois avec de nouveaux didacticiels ajoutées fréquemment. (Pour un catalogue complet, aller à http://www.openhelix.com/cgi/tutorials.cgi)

Avec un abonnement, scientifiques apprendre rapidement à utiliser les outils dont ils ont besoin quand ils en ont besoin. Le didacticiel en ligne narré, qui fonctionne dans n'importe quel navigateur, peut être consulté du début à la fin ou navigué en utilisant des chapitres et en avant et en arrière curseurs. L' 30-60 tutoriels minute évidence et d'expliquer toutes les caractéristiques et les fonctionnalités nécessaires pour commencer à utiliser la ressource de manière efficace. Les tutoriels sont utilisés pour introduire une nouvelle ressource, pour voir de nouvelles fonctionnalités, ou simplement comme un outil de référence pour rafraîchir une connaissance des utilisateurs sur une ressource.

En plus des tutoriels, abonnés reçoivent également du matériel de formation utile, y compris les diapositives PowerPoint animées utilisées comme base pour le tutoriel, scénario proposé pour les diapositives, polycopiés diapositives, et des exercices. Cela peut économiser un temps énorme et les efforts des enseignants et des professeurs pour créer du contenu en classe.

Le nouveau portail a été partiellement financé par NHGRI octroi 3R44HG004531.

A propos de OpenHelix
OpenHelix, LLC, (www.openhelix.com) fournit les connaissances de la génomique vous avez besoin quand vous en avez besoin. OpenHelix fournit une recherche en bioinformatique et en génomique et le portail de formation, en donnant aux chercheurs un endroit à trouver et apprendre à utiliser les ressources et les bases de données sur le web. Une utilisation plus efficace des ressources les plus pertinentes des moyens de recherche plus rapide et plus efficace.

7 réflexions sur "OH lance une recherche en génomique et en savoir Portal

  1. GSGS

    y at-il un forum de discussion sur Internet où les gens
    peuvent parler de leurs recherches avec d'autres ,
    trouver des co-auteurs, trouver des idées pour de nouveaux travaux, etc. ?

    il doit exister quelque part, mais je ne peux pas le trouver.
    Pages Web ou des blogs comme celui-ci ne sont généralement pas de soutien
    lecteur-discussion et les forums existants sont
    principalement pour les laïcs, pas des chercheurs.

  2. Mary

    Salut GSGS–

    Ouais, il existe une variété de lieux. Je sais qu'il ya beaucoup de scientifiques sur FriendFeed en bioinformatique. Chaque espèce a généralement un wiki ou un forum ou liste de diffusion qui fonctionne pour que les. Je veux le regarder dans votre sujet d'intérêt pour un forum comme celui. Si vous nous raconter votre domaine, nous pouvons regarder autour un peu trop.

    Il ya aussi un nouveau projet financé par NCRR appelé Vivo qui va construire des réseaux pour les scientifiques. Vous pouvez apprendre à ce sujet ici: http://www.ncrr.nih.gov/the_american_recovery_and_reinvestment_act/20091102.asp

  3. GSGS

    Salut Marie,

    Je suis intéressé par la grippe espèces,
    Peut-être que j'ai écrit ici earlier.I aller à
    flutrackers.com,fluwikie.com, mais ce n'est pas
    vraiment de la recherche. J'ai googlé “FriendFeed pour
    bioinformatique” mais n'a pas trouvé quelque chose de
    utile encore. La plupart de la discussion est en privé
    forums,listes,wikis ? Non consultable avec Google

  4. Mary

    Ouais, J'ai vu des bavardages bioinformatique sur FriendFeed parce que les gens ont lié à nous à partir de là. J'ai vu des discussions du papier et de ressources. Mais je n'ai pas l'utiliser activement, Je n'ai lu de lui quand j'ai vu des liens. Je pense que c'était un de ces: http://friendfeed.com/groups/search?q=bioinformatics

    Chris Upton allait avoir un forum chercheur de virus au VBRC, mais leur financement a été touché. http://www.vbrc.org/

    La plupart des autres ressources virale que j'ai rencontré n'ont pas eu de groupes de discussion. Mais je vais regarder autour de certains plus.

    ResearcherID essayait de construire un lieu de réseautage: http://www.researcherid.com

    Il ya eu beaucoup de tentatives pour lancer des trucs comme ça qui ne se coincent pas dans. Mais parfois, il ya une liste de diffusion Vieux-Nice qui a été autour pendant un moment qui fonctionne. Je pensais que FluDB pourrait avoir quelque chose parce qu'ils ont cette carte collaboratrice mais je ne trouve rien…http://www.fludb.org Peut-être que quelqu'un sait sur un wiki ou la liste. Je suis très effrontée–Je écrire et demander à leur bureau d'aide :)

  5. GSGS

    OK, merci encore.

    J'ai essayé le lien FriendFeed.
    Recherche en bioinformatique et / ou la grippe.
    J'ai trouvé le journal bioinformatique dont je bookmarged
    et certains peope intéressante.
    Mais pas vraiment la discussion sur (publiés et à venir) les papiers
    ou tout simplement des idées.
    Il était une fois il y avait Usenet, Internet était plus petit, mais vous avez toujours
    savait où pour discuter de choses. Aujourd'hui, nous avons essentiellement des blogs – les gens disent
    quelque chose de, mais pas de la coopération.
    Pourquoi ces pages Web, comme vbrc.org,openhelix.com,CDC,GenBank,Les universités ont pas un forum de discussion
    attachés ? Je vois une atmosphère de secret – gens de ne pas discuter de leurs idées,
    il fonctionne grâce à la publication d'articles ne.

    http://athena.bioc.uvic.ca/node/402

    suivantes cupton1 sur twitter maintenant
    souscrit à la newsletter de la BID (pas sûr que ça a travaillé)

    12 chercheurs pour la grippe, avec
    http://www.researcherid.com/

    Christophe Fraser , Richard Squires , Anton Tsyganov-Bodounov

    ainsi, J'ai contacté certains chercheurs avant qu'ils semblaient intéressés
    mais ils ont vite cessé de répondre. Un tel contact ne semble fonctionner au sein de certaines institutions
    système de financement et , pas de débat public.

  6. Mary

    Peut-être que vous n'avez pas trouvé la communauté de discussion droite encore, ou peut-être il vraiment n'existe tout simplement pas dans la communauté de la recherche de virus, pour quelque raison. Je ne pense pas que c'est une “l'atmosphère de secret” en général,. J'ai vu des discussions comme celle d'autres conseils. Il n'est pas facile d'obtenir un forum a commencé à partir de zéro. Nous avons regardé en elle, et j'ai pensé qu'il était trop d'entretien pour nous. Voici un forum que j'ai trouvé sur la grippe: http://forum.flu.org.cn

    Mais les gens ne sera probablement pas partager des détails intimes de leur travail sur Internet–Personne ne veut être raflé sur leur sujet soit. Mais ils ne discuter des techniques et des obstacles qu'ils frappent.

    J'ai remarqué que les conférences, même devenaient de moins en moins intéressant, car il ne semble pas être la nouveauté beaucoup plus à venir là-bas qui n'a pas déjà été dans la presse.

    Oh–il ya un autre groupe, j'ai pris conscience de la dernière conférence que j'étais à. Ils appelaient à la science ouverte. Mais cela sonnait un peu jeune: http://sagebase.org/ Je ne sais pas s'ils auront un aspect quelconque du virus.

  7. GSGS

    > Peut-être que vous n'avez pas trouvé la communauté de discussion droite encore, ou peut-être vraiment juste
    > n'existe pas dans la communauté de recherche de virus, pour quelque raison. Je ne pense pas que c'est une
    > “l'atmosphère de secret” en général,.

    J'ai eu cette impression quand je compare avec mon ancienne zone de recherche et les forums,
    ce qui est des mathématiques,la programmation.

    > J'ai vu des discussions comme celle d'autres conseils. Il n'est pas facile d'obtenir un forum a commencé à partir de zéro.

    il est. J'ai créé 5-10 (mais peu de trafic)

    > Nous avons regardé en elle, et j'ai pensé qu'il était trop d'entretien pour nous.

    aucun entretien pour les groupes Google ou Yahoo Groups ou des forums hébergé

    > Voici un forum que j'ai trouvé sur la grippe: http://forum.flu.org.cn

    Merci. Je me suis inscrit. Je sais que le FIC, obtenir leur bulletin de, mais ne savent pas qu'ils ont un forum.
    Non tant de membres que d'autres forums de la grippe, si – mais la recherche peut-être plus.
    Hmm, un forum chinois signifie la censure ?

    > Mais les gens ne sera probablement pas partager des détails intimes de leur travail sur Internet–
    > Personne ne veut être raflé {ramasser} sur leur sujet soit. Mais ils ne discutent
    > techniques et les obstacles qu'ils frappent.

    protéger contre “écopage”. récompenser les gens par raflé la valeur estimée du scoop
    Peur de l'excavation est mauvais pour la recherche

    > J'ai remarqué que les conférences, même devenaient de moins en moins intéressant, car il
    > ne semble pas être la nouveauté beaucoup plus à venir là-bas qui n'a pas déjà été dans la presse.

    Je ne comprends pas le sens de conférences, quand nous avons e-mail et internet une forums
    (l'exception au secret,la peur de scoop, )

    > Oh–il ya un autre groupe, j'ai pris conscience de la dernière conférence que j'étais à. Ils ont été
    > appelant à la science ouverte. Mais cela sonnait un peu jeune: http://sagebase.org/
    > Je ne sais pas s'ils auront un aspect quelconque du virus.

    Je ne pouvais pas deviner (encore) comment joindre leur forum

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