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Video Tipp der Woche: Airbase TV, und ein Brief der Unterstützung für Modellorganismus Gemeinden

In dieser Woche Video-Tipp wurde durch ein paar Dinge aufgefordert. Erste, es war ein Tweet von FlyBase, über ihre Videokanal. Es ist schon eine Weile her, seit wir ein getan hatte Airbase Tipp der Woche, so das war Grund genug,.

Aber es kam auch nur, nachdem ich über die Bedeutung der Modellorganismen dachte, auf der Grundlage der Kampagne von den Modellorganismus Datenbanken ihre Finanzierung zu sichern. Hier ist ein Tweet aus dem Hefegenom Datenbank (SGD) mit einem Plädoyer:

Aber dieser Brief zitiert Hefe, Fliegen, WormBase, Tanz, MGI, RGD und Gene Ontology sowie.

mergeIch habe ein Faible für Modellorganismen, nicht nur wegen der enormen Menge von großer Biologie sie zur Verfügung gestellt haben. Ich war ein Postdoc-Aufenthalt am Jackson Lab, und ich bin sehr bewusst, wie wichtig es ist, die Tiefe der Spezies Spezialisten beteiligt zu haben, bei der Schaffung und Erhaltung der Ressourcen, die für ihren Organismus angemessen sind. Aber es ist mehr als nur institutionelle Wissen und Daten, natürlich. Es ist auch die Bedeutung der Gemeinschaft der Forscher auf diesem Organismus arbeiten, sie unterstützen und mit ihren Bedürfnissen in vielerlei Hinsicht mit artspezifischen Ressourcen erfüllt.

So Der Tip der Woche zeigt einige Merkmale der FlyBase Tools, als eine Möglichkeit, Leute von der großen Arbeit zu erinnern, dass bei Modellorganismus Datenbanken los ist (Modifikationen).

Jetzt, wenn Sie nicht bereits getan haben, beachten Sie bitte an die Unterzeichnung auf Schreiben der Unterstützung für diese Datenbanken. Sie können mehr über das Thema über an der Stelle lesen, aber kurz:

NHGRI / NIH fortgeschritten ist vor kurzem einen Plan, in dem die MODs werden in einer einzigen kombinierten Datenbank integriert werden, zusammen mit einem 30% Kürzung der Mittel für jeden MOD (siehe auch diese Nature und Wissenschaft Nachrichten). Während eine verstärkte Integration wird viele Vorteile präsentieren, Der Plan wird in einem Verlust von kritischen Organismus spezifische Datensätze führen. Die Finanzierung Schnitt wird auch Kernfunktionen Krüppel wie hochwertige Literatur Kuration und Genomannotation, Verschlechtern der Nützlichkeit der MODs. Angesichts der großen Zahl von Wissenschaftlern, dass diese Änderung der Politik beeinflussen würde und die Bedeutung ihrer Arbeit, dies ist eine Angelegenheit von äußerster Besorgnis.

Ich habe schrie immer über die Bedeutung von qualitativ hochwertigen curation. Es ist so unterbewertet, aber es ist nur mehr und mehr von entscheidender Bedeutung jetzt, dass wir so viel Sequenzdaten bekommen und wir brauchen die beste vorhandene Wissen uns durch sie zu helfen. Jetzt ist nicht die Zeit, auf Kuration, um wieder.

Also, wenn Sie MOD Daten bewertet und Community-Sites, beachten Sie bitte auf das Schreiben der Unterstützung bei der Unterzeichnung.

Quick-Links:

FlyBase: http://flybase.org/

Unterstützung Modellorganismus Datenbanken Schreiben: http://www.genetics-gsa.org/MODSupport/

Referenzen:

Hayden, Erica überprüfen. “Die Finanzierung für Modellorganismus Datenbanken in Schwierigkeiten.” Nature News. () DOI: 10.1038/nature.2016.20134

Kaiser, Jocelyn. “Die Finanzierung für die wichtigsten Datenressourcen in Gefahr.” Wissenschaft 351.6268 (2016): 14-14. DOI: 10.1126/science.351.6268.14

Attrill, Helen, et al. “FlyBase: eines Gene-Gruppe Ressource für Drosophila melanogaster zu etablieren.” Nucleic Acids Research (2015): gkv1046. DOI: 10.1093/Granatapfel / gkv1046