The Dawn of Virtuelle Zellbiologie: Journal Club-Video verfügbar

Heute besuchte ich eine virtuelle Journal Club. Organisiert von Stephen Larson von OpenWorm (Ich sprach über die sehr coole 3D-Wurm-Projekt in einem Tipp der Woche eine Weile zurück), Sie enthielt auch ein paar Leute aus OpenWorm, und zwei der Autoren des Papiers: Jonathan Karr und Jayodita Sanghvi. Jonathans Katze zeigte sich auch an einem Punkt :) .

Stephen hat eine Rolle in der Anfang, der eine Darstellung der wichtigsten Merkmale des Papiers war, und der Kontext der Arbeit in der Biologie heute. Ich glaube, er hatte ein ganz ähnliches nehmen sie auf, was ich bei der Beschreibung Mein Tipp in dieser Woche: Modellierung Arten von Papieren verursachen ein bisschen Drama und Widerstand in der Biologie-Community; und dass dies auf so viel früheren Arbeiten in Hunderten von Publikationen und viele kuratierten Datenbanken verlassen. Aber er betonte auch die Bedeutung dieser Arbeit in diesem Feld nach vorne bewegen.

Die Diskussion Teil war grandios. Wir deckten Standards in der Systembiologie (sie sind noch nicht bereit, diese Arbeit aufzunehmen), wie diese können helfen anderen Modellierer denke durch die Themen (insbesondere diejenigen mit größeren Genomen), wie viel Charakterisierung der Biologie müssen Sie, bevor Sie dies tun, wie viel von einem Zellsystem dies tatsächlich erfasst, und mehr. Es war ein Teil darum, diese mehr von einer Gemeinschaft von “offenzelligen” wie OpenWorm. Aber die Antwort von den Autoren / grad Studenten war interessant: es ist wirklich nicht bis zu ihnen. Wäre dies geschehen, es müssten unterstützt und gefördert werden und das ist nicht das, was sie angeklagt sind. Es trifft in der Frage der Unterstützung für Computational Tools und unsere Fähigkeit, auf vorhandenen Sachen zu bauen. Es war ein wichtiger Punkt.

Sowieso, Das Video ist verfügbar und Sie können zusehen. Es ist mehr als eine Stunde lang, aber wenn Sie auf Zelle Modellierung arbeiten, ich denke, es wäre Ihre Zeit wert sein. Es könnte auch bieten den Studierenden eine Orientierung über mögliche Bereiche, die sich nach diesem abgeholt werden müssen, wenn Sie für Projekte suchen.

Ich genoss das Virtual Journal Club Idee und Format. Es sollte mehr von diesen sein. Es wäre toll, wenn Verlage einige von ihnen unterstützen würde.

EDIT: Wollte nur zu beachten, dass die ursprüngliche Einladung zur Besprechung wurde der Video-Links, auch für die Folien verwendet Stephen, und einige andere nützliche Sachen (wie das Papier und Ergänzungen) https://plus.google.com/events/c1hs4k76d0mc5d6n03b4rneh0ro/117948341754627144949